MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 24997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004463	CAG	2	6	1959509	1959514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_004463	CGC	2	6	1959515	1959520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_004463	CTTT	2	8	1959559	1959566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_004463	TTG	2	6	1959920	1959925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_004463	GAC	2	6	1959930	1959935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_004463	CGAT	2	8	1960517	1960524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_004463	GTGC	2	8	1960531	1960538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_004463	ATC	2	6	1960553	1960558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_004463	GA	3	6	1960642	1960647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_004463	TCGT	2	8	1960686	1960693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_004463	GCG	2	6	1960732	1960737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_004463	GTC	2	6	1960781	1960786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_004463	CTGG	2	8	1962276	1962283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_004463	GAG	2	6	1962356	1962361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_004463	GCG	2	6	1963497	1963502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_004463	GCA	3	9	1963596	1963604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_004463	AGCG	2	8	1963659	1963666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_004463	GGA	2	6	1963696	1963701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_004463	TC	3	6	1963702	1963707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_004463	GCGG	2	8	1963722	1963729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_004463	ATA	2	6	1963748	1963753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_004463	CGG	2	6	1963769	1963774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_004463	TGA	2	6	1963827	1963832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_004463	GAA	2	6	1963842	1963847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_004463	CGG	2	6	1963857	1963862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_004463	GCG	2	6	1963878	1963883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_004463	GCCT	2	8	1963923	1963930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_004463	GGA	2	6	1963931	1963936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_004463	GCT	2	6	1963957	1963962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_004463	CCGT	2	8	1964009	1964016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_004463	TCC	2	6	1964021	1964026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_004463	GCG	2	6	1964273	1964278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_004463	AAG	2	6	1964326	1964331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_004463	GGT	2	6	1964386	1964391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_004463	TC	3	6	1965129	1965134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_004463	TGA	2	6	1965143	1965148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_004463	AGCT	2	8	1965174	1965181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_004463	GC	3	6	1965187	1965192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_004463	CGC	2	6	1966135	1966140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_004463	TCA	2	6	1966252	1966257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_004463	TC	3	6	1975473	1975478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_004463	TCG	2	6	1975556	1975561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_004463	GA	3	6	1975585	1975590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_004463	GGCC	2	8	1975623	1975630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_004463	TCG	2	6	1975685	1975690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_004463	CGT	2	6	1976217	1976222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_004463	AAG	2	6	1976420	1976425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_004463	TTG	2	6	1976478	1976483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_004463	CAAT	2	8	1977210	1977217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_004463	GAGCC	2	10	1978378	1978387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5551	NC_004463	CTG	2	6	1978408	1978413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_004463	CGT	2	6	1978427	1978432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_004463	CAT	2	6	1978461	1978466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_004463	GCG	2	6	1978467	1978472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_004463	CAG	2	6	1978543	1978548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_004463	GAC	2	6	1978555	1978560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_004463	CAG	2	6	1978693	1978698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_004463	GTC	2	6	1980150	1980155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_004463	GCT	2	6	1980169	1980174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_004463	TGCG	2	8	1980268	1980275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_004463	AAGC	2	8	1980283	1980290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_004463	GCC	2	6	1980321	1980326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_004463	CG	3	6	1980350	1980355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_004463	AACCC	2	10	1980385	1980394	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5565	NC_004463	TCG	2	6	1980452	1980457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_004463	TCGG	2	8	1980480	1980487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5569	NC_004463	GCC	2	6	1980560	1980565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_004463	GCCG	2	8	1980595	1980602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_004463	AGGGC	2	10	1980686	1980695	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_004463	ATT	2	6	1980784	1980789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5574	NC_004463	GCC	3	9	1980832	1980840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_004463	TCC	2	6	1980866	1980871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5580	NC_004463	GAT	2	6	1981048	1981053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5585	NC_004463	AGGC	2	8	1981718	1981725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5589	NC_004463	TGG	2	6	1981932	1981937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_004463	CGT	2	6	1982035	1982040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_004463	AGCC	2	8	1982117	1982124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_004463	CTAT	2	8	1982170	1982177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_004463	C	6	6	1982258	1982263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5596	NC_004463	CCGCGC	2	12	1982282	1982293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5598	NC_004463	T	7	7	1982597	1982603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_004463	GGC	2	6	1982643	1982648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_004463	CTGC	2	8	1982661	1982668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_004463	GCT	2	6	1986764	1986769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_004463	CG	3	6	1986799	1986804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_004463	GAA	2	6	1987277	1987282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_004463	ATCAA	2	10	1987382	1987391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5605	NC_004463	CGC	2	6	1987432	1987437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5608	NC_004463	GGAGC	2	10	1987498	1987507	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5609	NC_004463	CG	3	6	1987535	1987540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_004463	GAC	2	6	1987706	1987711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_004463	CGG	2	6	1987734	1987739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_004463	GCCG	2	8	1987813	1987820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_004463	CTG	2	6	1987869	1987874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5615	NC_004463	GCGG	2	8	1987926	1987933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_004463	ACC	2	6	1987996	1988001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5622	NC_004463	TCG	2	6	1989027	1989032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_004463	GTT	2	6	1989050	1989055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_004463	GCG	2	6	1989133	1989138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5628	NC_004463	CG	3	6	1989191	1989196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_004463	CGC	2	6	1989269	1989274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5631	NC_004463	GCG	2	6	1989421	1989426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5763	NC_004463	G	6	6	2014965	2014970	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5764	NC_004463	CCG	2	6	2014979	2014984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5765	NC_004463	ATC	2	6	2015851	2015856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5767	NC_004463	CGC	2	6	2015910	2015915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5886	NC_004463	GCT	2	6	2032268	2032273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5888	NC_004463	GAT	2	6	2032405	2032410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5889	NC_004463	GC	3	6	2032423	2032428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5890	NC_004463	TGCT	2	8	2032457	2032464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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