MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome II

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004311	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004311	AGCGG	2	10	22099	22108	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_004311	GGCCT	2	10	37492	37501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_004311	ATGAA	2	10	40063	40072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004311	TTTGT	2	10	41224	41233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004311	CGCTC	2	10	43433	43442	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_004311	TGCGG	2	10	60812	60821	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004311	TATCT	2	10	73049	73058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_004311	TCGGT	2	10	81758	81767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004311	TTCTC	2	10	81787	81796	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_004311	CGCGG	2	10	81995	82004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_004311	ACTTG	2	10	87314	87323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004311	CGGTA	2	10	97183	97192	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004311	CCAAG	2	10	97358	97367	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_004311	CTTGC	2	10	108017	108026	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_004311	CCTGC	2	10	112691	112700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_004311	GCCCG	2	10	115951	115960	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_004311	GCACA	2	10	117242	117251	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_004311	GTTCG	2	10	117263	117272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004311	GAAAA	2	10	119195	119204	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004311	CGATA	2	10	121432	121441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_004311	GCCCG	2	10	121846	121855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_004311	AGATA	2	10	134535	134544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004311	GCCGC	2	10	141642	141651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_004311	TTGGC	2	10	145173	145182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004311	CCGGG	2	10	152323	152332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_004311	CGGAT	2	10	159694	159703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004311	TGGGC	2	10	159825	159834	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004311	TGTTT	2	10	160278	160287	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004311	CCCGT	2	10	161003	161012	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_004311	GCCGA	2	10	175195	175204	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_004311	GCCCC	2	10	175222	175231	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_004311	GGATA	2	10	188116	188125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004311	TGACG	2	10	191862	191871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004311	GATCA	2	10	193310	193319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_004311	AGCAG	2	10	203630	203639	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_004311	AAATT	2	10	209238	209247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004311	ATCAA	2	10	209381	209390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_004311	TGAAA	2	10	209391	209400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004311	TAAGT	2	10	214413	214422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004311	CGCTG	2	10	253206	253215	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_004311	CGTCC	2	10	254369	254378	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_004311	GCTTT	2	10	304919	304928	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004311	GCCGG	2	10	319942	319951	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_004311	TTTGT	2	10	322910	322919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004311	GGTGG	2	10	340410	340419	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004311	CTCCC	2	10	346890	346899	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_004311	GCGCC	2	10	347185	347194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_004311	AGGGC	2	10	347365	347374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004311	AAAAC	2	10	347551	347560	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_004311	AGTTG	2	10	361076	361085	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004311	TGCGC	2	10	361509	361518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_004311	GGCAT	2	10	361575	361584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_004311	TTTGT	2	10	365360	365369	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004311	GCTTC	2	10	375054	375063	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_004311	GGTGC	2	10	375806	375815	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_004311	TGGAG	2	10	395811	395820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004311	TGGAG	2	10	408876	408885	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004311	TCATA	2	10	409967	409976	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004311	GCCCA	2	10	411478	411487	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_004311	AGCAA	2	10	416329	416338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004311	CGGAA	2	10	443020	443029	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_004311	GCGCC	2	10	448072	448081	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_004311	CTGAT	2	10	448151	448160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004311	GGCAA	2	10	450393	450402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004311	AGTGA	2	10	450986	450995	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004311	ATCCC	2	10	455565	455574	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_004311	AAAGC	2	10	475348	475357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_004311	ACTGG	2	10	502246	502255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004311	TCGCA	2	10	531901	531910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_004311	GTCGA	2	10	538367	538376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_004311	AGCGG	2	10	572797	572806	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004311	ACAAA	2	10	575103	575112	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004311	TTTGC	2	10	599051	599060	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004311	ATTTC	2	10	601883	601892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_004311	GCAGA	2	10	605779	605788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004311	GCCTT	2	10	607226	607235	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_004311	GTTTT	2	10	617621	617630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004311	ACAAA	2	10	629857	629866	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004311	TCGCT	2	10	636375	636384	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_004311	GCCGC	2	10	645452	645461	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_004311	CCAGC	2	10	645531	645540	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_004311	GGCTC	2	10	647635	647644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_004311	TGGCT	2	10	669723	669732	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004311	CCGGC	2	10	675287	675296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_004311	ACGGC	2	10	692653	692662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_004311	AAGGC	2	10	697351	697360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004311	TTACG	2	10	708720	708729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004311	CTCTC	2	10	714105	714114	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_004311	TCAGG	2	10	719983	719992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004311	ATTAT	2	10	753814	753823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004311	CATGA	2	10	755329	755338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004311	GGCCG	2	10	755874	755883	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_004311	TCAAA	2	10	778324	778333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004311	CATCG	2	10	781693	781702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_004311	ACAAA	2	10	781809	781818	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_004311	TCCCC	2	10	790600	790609	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_004311	TCCCC	2	10	792220	792229	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_004311	GAGGT	2	10	795250	795259	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004311	CATTC	2	10	804646	804655	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_004311	GCAGT	2	10	820604	820613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004311	TCCGA	2	10	830893	830902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_004311	GCCGC	2	10	839489	839498	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_004311	ACGCC	2	10	839773	839782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_004311	AGAGG	2	10	843482	843491	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004311	CAATT	2	10	868615	868624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004311	CGTAT	2	10	868626	868635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004311	GAAAA	2	10	873800	873809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004311	GGTTT	2	10	881735	881744	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004311	TGATA	2	10	888711	888720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004311	CCCTC	2	10	911451	911460	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_004311	ACAAA	2	10	922181	922190	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_004311	GGTGG	2	10	950567	950576	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004311	CATGG	2	10	954335	954344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004311	CCGGG	4	20	954345	954364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_004311	GCCTC	2	10	954404	954413	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_004311	GCCTG	2	10	954896	954905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_004311	TGGAA	2	10	964448	964457	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004311	AGGCC	2	10	969081	969090	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_004311	CGCGC	3	15	972232	972246	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_004311	CCCTT	2	10	973673	973682	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_004311	CCCCG	2	10	989335	989344	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_004311	TAAAA	2	10	993411	993420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004311	AGCGA	2	10	1024189	1024198	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004311	CGCTT	2	10	1034030	1034039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_004311	TGCGC	2	10	1037742	1037751	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_004311	CGCCT	2	10	1053369	1053378	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_004311	ATTAA	2	10	1054777	1054786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004311	AACCG	2	10	1056607	1056616	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_004311	TTTTC	2	10	1066734	1066743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004311	GTTGA	2	10	1072977	1072986	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004311	CAGCT	2	10	1091445	1091454	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004311	GCGCT	2	10	1093969	1093978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_004311	CTATT	2	10	1095133	1095142	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004311	GAAAG	2	10	1101702	1101711	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004311	TTTTC	2	10	1102041	1102050	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004311	TTCAA	2	10	1105461	1105470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_004311	CCTCT	2	10	1105479	1105488	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_004311	GCTGT	2	10	1107090	1107099	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004311	CGAAG	2	10	1107903	1107912	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004311	AGCCC	2	10	1108457	1108466	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_004311	CACGA	2	10	1108602	1108611	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_004311	TTATT	2	10	1114400	1114409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004311	AGCCG	2	10	1131599	1131608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_004311	TGCGG	2	10	1135947	1135956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_004311	TTCTG	2	10	1150624	1150633	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004311	CGATG	2	10	1159778	1159787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_004311	GGAAG	2	10	1182775	1182784	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004311	ACGGC	2	10	1194648	1194657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.