MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 6651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004307	CGC	2	6	1150351	1150356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_004307	TCA	2	6	1150381	1150386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_004307	CAA	2	6	1150427	1150432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_004307	GC	3	6	1150437	1150442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_004307	GAA	2	6	1150469	1150474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_004307	GGC	2	6	1150520	1150525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_004307	CG	3	6	1150564	1150569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_004307	TCG	2	6	1150644	1150649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_004307	A	6	6	1150694	1150699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_004307	CGT	2	6	1150708	1150713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_004307	CGCC	2	8	1150726	1150733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3012	NC_004307	CG	3	6	1150739	1150744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_004307	CCG	2	6	1150803	1150808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_004307	CGTC	2	8	1150818	1150825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_004307	TTG	2	6	1150826	1150831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_004307	CGA	2	6	1150900	1150905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_004307	CG	3	6	1150914	1150919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_004307	CAT	2	6	1150989	1150994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_004307	GCC	2	6	1151075	1151080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_004307	CGG	2	6	1151108	1151113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_004307	GCA	2	6	1151162	1151167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_004307	TGG	2	6	1151186	1151191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_004307	TGT	2	6	1151268	1151273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_004307	TGG	2	6	1151299	1151304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_004307	TTCG	2	8	1154573	1154580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_004307	GCCA	2	8	1154643	1154650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_004307	AAC	2	6	1154678	1154683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_004307	TGG	2	6	1154703	1154708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_004307	TGG	3	9	1154791	1154799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_004307	GCCTCG	2	12	1154916	1154927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_004307	GCC	2	6	1154954	1154959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_004307	ATG	2	6	1155030	1155035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_004307	TCA	2	6	1155037	1155042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_004307	CGG	2	6	1155118	1155123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_004307	GC	3	6	1155173	1155178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_004307	CTTGA	2	10	1155198	1155207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3037	NC_004307	CG	3	6	1155220	1155225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_004307	TCG	2	6	1155301	1155306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_004307	CGT	2	6	1155365	1155370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3041	NC_004307	TCC	2	6	1155459	1155464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_004307	CGC	2	6	1155495	1155500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_004307	CGA	2	6	1155557	1155562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_004307	CAG	2	6	1155584	1155589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_004307	CGCCTT	2	12	1155596	1155607	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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3049	NC_004307	G	10	10	1156530	1156539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_004307	GA	3	6	1156562	1156567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_004307	GA	3	6	1158345	1158350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_004307	CTT	2	6	1158357	1158362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_004307	CTT	2	6	1158372	1158377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_004307	TC	3	6	1158381	1158386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_004307	TTG	2	6	1158430	1158435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_004307	GGT	2	6	1158456	1158461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004307	AATC	2	8	1158470	1158477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_004307	GAA	2	6	1160129	1160134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004307	AGC	2	6	1160148	1160153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_004307	ACC	2	6	1160178	1160183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_004307	TTG	2	6	1160219	1160224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_004307	AACC	2	8	1160294	1160301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_004307	TAT	2	6	1160305	1160310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_004307	ACC	2	6	1160373	1160378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_004307	GCT	2	6	1160411	1160416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3068	NC_004307	AT	3	6	1160480	1160485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_004307	TCG	2	6	1160577	1160582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_004307	ATA	2	6	1162164	1162169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_004307	CTT	2	6	1162196	1162201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_004307	TGT	2	6	1162206	1162211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_004307	GATG	2	8	1163703	1163710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_004307	ACG	2	6	1166003	1166008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_004307	ATCGC	2	10	1167396	1167405	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3079	NC_004307	CAT	2	6	1167498	1167503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_004307	GAAC	2	8	1170247	1170254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_004307	TTCCT	2	10	1170274	1170283	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3082	NC_004307	CTC	2	6	1171474	1171479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_004307	ACA	2	6	1171487	1171492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_004307	GTGCT	2	10	1173680	1173689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3085	NC_004307	AG	3	6	1173707	1173712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_004307	GGT	2	6	1173753	1173758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_004307	ACC	2	6	1173780	1173785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_004307	TCCGC	2	10	1173791	1173800	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3090	NC_004307	TGCTG	2	10	1175830	1175839	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3091	NC_004307	GGC	2	6	1175937	1175942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3093	NC_004307	GGT	2	6	1177406	1177411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_004307	TTC	2	6	1177417	1177422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_004307	TTG	2	6	1177491	1177496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_004307	CTG	2	6	1177530	1177535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_004307	GAT	2	6	1177631	1177636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_004307	T	7	7	1177678	1177684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_004307	TCCCC	2	10	1177753	1177762	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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3101	NC_004307	GCA	2	6	1177807	1177812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_004307	CA	3	6	1177834	1177839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_004307	CCA	2	6	1177853	1177858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_004307	GCC	2	6	1177863	1177868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_004307	C	6	6	1177934	1177939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3106	NC_004307	AGC	2	6	1177994	1177999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_004307	TCA	2	6	1178142	1178147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_004307	CAT	2	6	1178152	1178157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_004307	CCT	2	6	1178160	1178165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_004307	GCC	2	6	1178231	1178236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_004307	CAT	2	6	1178329	1178334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_004307	GAC	2	6	1178363	1178368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_004307	TCA	2	6	1178448	1178453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_004307	TGC	2	6	1178478	1178483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_004307	CACAT	2	10	1178582	1178591	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3118	NC_004307	TGC	2	6	1178605	1178610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_004307	CGC	2	6	1178671	1178676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_004307	GTAAC	2	10	1178705	1178714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3123	NC_004307	GTT	2	6	1182832	1182837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_004307	GA	3	6	1182933	1182938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_004307	CCAA	2	8	1182981	1182988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_004307	A	7	7	1182987	1182993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_004307	GAG	2	6	1183055	1183060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_004307	CTC	2	6	1183147	1183152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_004307	ACGTCA	2	12	1183183	1183194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_004307	CCG	2	6	1183197	1183202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_004307	GTC	2	6	1183333	1183338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_004307	GAC	2	6	1183347	1183352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_004307	ACGCA	2	10	1183726	1183735	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3134	NC_004307	CG	3	6	1185582	1185587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3135	NC_004307	A	7	7	1185604	1185610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_004307	TTG	2	6	1185634	1185639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_004307	GAT	2	6	1185713	1185718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_004307	GTC	2	6	1185728	1185733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_004307	GCC	2	6	1185742	1185747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3143	NC_004307	CGA	2	6	1189070	1189075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_004307	ATG	2	6	1189079	1189084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_004307	ACC	2	6	1190436	1190441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3146	NC_004307	AGG	2	6	1190445	1190450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_004307	GCC	2	6	1190488	1190493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3148	NC_004307	GTG	2	6	1190565	1190570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3152	NC_004307	TCA	2	6	1190751	1190756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_004307	GCT	2	6	1191723	1191728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3183	NC_004307	A	7	7	1198413	1198419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3199	NC_004307	ACAGC	2	10	1200393	1200402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3201	NC_004307	ATTCC	2	10	1202148	1202157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3243	NC_004307	CAT	2	6	1214492	1214497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3245	NC_004307	CA	3	6	1214549	1214554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3246	NC_004307	ACG	2	6	1214611	1214616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_004307	CGCA	2	8	1214641	1214648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3248	NC_004307	ACA	2	6	1214669	1214674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_004307	GCA	2	6	1214686	1214691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_004307	CAC	2	6	1214699	1214704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_004307	CG	3	6	1216263	1216268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3252	NC_004307	AAGG	2	8	1216340	1216347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_004307	CG	3	6	1216841	1216846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_004307	CGAA	2	8	1216906	1216913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3255	NC_004307	TGAA	2	8	1217141	1217148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_004307	CGA	2	6	1218041	1218046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_004307	ATG	2	6	1220747	1220752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_004307	T	6	6	1220763	1220768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_004307	TCA	2	6	1220783	1220788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_004307	GCAA	2	8	1220797	1220804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3261	NC_004307	CAA	2	6	1220837	1220842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_004307	CAT	2	6	1220850	1220855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3282	NC_004307	TTC	2	6	1237336	1237341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3384	NC_004307	CGA	2	6	1271749	1271754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3389	NC_004307	CG	3	6	1276133	1276138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3390	NC_004307	AAGAA	2	10	1276151	1276160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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