MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004061	TTATT	2	10	1973	1982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004061	ATTTT	2	10	3128	3137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004061	TTTTA	2	10	3208	3217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004061	AAAAT	2	10	14001	14010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004061	ATAAA	2	10	18131	18140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004061	TAAAC	2	10	18566	18575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004061	CTATT	2	10	23329	23338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004061	TTTTC	2	10	23613	23622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_004061	AGATA	2	10	36097	36106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004061	ATTTA	2	10	36325	36334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004061	GATAA	2	10	36386	36395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004061	GTAAA	2	10	46171	46180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004061	TAAAA	2	10	47331	47340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004061	TATAT	2	10	48986	48995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004061	ATAAA	2	10	52367	52376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004061	ATTTA	2	10	58920	58929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004061	TTTTA	2	10	63165	63174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004061	ATTAA	2	10	65034	65043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004061	ATTTT	2	10	66352	66361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004061	AGAAT	2	10	66408	66417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004061	TAAAT	2	10	69073	69082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004061	TTTAA	2	10	71280	71289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004061	TTAAT	2	10	72528	72537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004061	AAATT	2	10	73836	73845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004061	AGGAA	2	10	74395	74404	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004061	GCATG	2	10	76821	76830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004061	ATTAG	2	10	77535	77544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004061	TTTAA	2	10	87663	87672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004061	TATTT	2	10	93321	93330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004061	GATTA	2	10	119777	119786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004061	ATTAT	2	10	128117	128126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004061	TATAA	2	10	128244	128253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004061	TAATT	2	10	129507	129516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004061	ATTAT	2	10	129559	129568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004061	TTAAA	2	10	134203	134212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004061	ATTTA	2	10	143796	143805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004061	GAAAA	2	10	144608	144617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004061	ATTAA	2	10	149905	149914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004061	AATGA	2	10	161160	161169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004061	TTTAT	2	10	161195	161204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004061	TATTT	2	10	165025	165034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004061	TAATA	2	10	177099	177108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004061	AATAA	2	10	187222	187231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004061	TTTTA	2	10	189016	189025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004061	TATGT	2	10	192689	192698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004061	TTAAA	2	10	199857	199866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004061	ACTTT	2	10	203694	203703	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004061	TAAAA	2	10	205955	205964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004061	ATTTA	2	10	207772	207781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004061	ATTAA	2	10	213048	213057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004061	TAAAA	2	10	216048	216057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004061	ATTTT	2	10	217614	217623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004061	ATTAT	2	10	218179	218188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004061	TTATC	2	10	218596	218605	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004061	AAAAT	2	10	233247	233256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004061	CTATA	2	10	235954	235963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_004061	TTTAT	2	10	236065	236074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004061	TTCTG	2	10	236189	236198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004061	TAACA	2	10	237616	237625	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004061	ATTTT	2	10	237930	237939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004061	AAAGA	2	10	238113	238122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004061	TTAAT	2	10	243695	243704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004061	ATTTT	2	10	244877	244886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004061	GAATG	2	10	245559	245568	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004061	AAAAT	2	10	245998	246007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004061	TTTTA	2	10	252315	252324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004061	TAAAA	2	10	252760	252769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004061	AGAGA	2	10	257128	257137	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004061	AAAAT	2	10	269898	269907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004061	TTTTA	2	10	280127	280136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004061	AATAT	2	10	287780	287789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004061	GTTAA	2	10	295711	295720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004061	ATTAA	2	10	299937	299946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004061	TAAAA	2	10	300051	300060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004061	ATTAT	2	10	318374	318383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004061	AACTC	2	10	319029	319038	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_004061	GTTGT	2	10	323160	323169	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004061	ATATA	2	10	323693	323702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004061	TGAAA	2	10	324386	324395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004061	ATTTT	2	10	329789	329798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004061	TAATT	2	10	332712	332721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004061	TAAAA	2	10	338723	338732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004061	ATTAA	2	10	344027	344036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004061	TAAAA	2	10	345745	345754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004061	TAAAA	2	10	360366	360375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004061	AATTA	2	10	364930	364939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004061	CTTTA	2	10	366380	366389	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004061	TATAT	2	10	371757	371766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004061	TTCTT	2	10	371776	371785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004061	AATAA	2	10	376330	376339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004061	ATTTT	2	10	380451	380460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004061	ATTAT	2	10	383677	383686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004061	GATAA	2	10	386750	386759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004061	ATTTA	2	10	389552	389561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004061	AAATA	2	10	420508	420517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004061	AATAA	2	10	421588	421597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004061	TTTTA	2	10	426012	426021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004061	TTCTT	2	10	428563	428572	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_004061	AAATA	2	10	428582	428591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004061	TAAAA	2	10	429667	429676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004061	TAAAT	2	10	432105	432114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004061	TACTA	2	10	445255	445264	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004061	ATATA	2	10	445273	445282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004061	TAAAA	2	10	446587	446596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004061	AAATT	2	10	447210	447219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004061	ATTAT	2	10	448734	448743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004061	TATTT	2	10	449462	449471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004061	ATTAA	2	10	449518	449527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004061	AATTT	2	10	449529	449538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004061	GTGCT	2	10	449877	449886	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004061	TATAA	2	10	449959	449968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004061	TAATT	2	10	451824	451833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004061	AGATA	2	10	454849	454858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004061	ATTTT	2	10	456821	456830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004061	ATTAT	2	10	457110	457119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004061	TTATT	2	10	459486	459495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004061	TCTTT	2	10	460940	460949	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004061	TTAAA	2	10	461666	461675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004061	ATGAC	2	10	463772	463781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004061	CGTTG	2	10	464768	464777	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_004061	TATTT	2	10	465228	465237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004061	ATTAA	2	10	470886	470895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004061	TTTTA	2	10	471018	471027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004061	TAATA	2	10	476529	476538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004061	AAATA	2	10	476541	476550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004061	AAAGA	2	10	476690	476699	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004061	ACAGA	2	10	477282	477291	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004061	ATACA	2	10	480504	480513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_004061	GTATG	2	10	480620	480629	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004061	TAGGA	2	10	480716	480725	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004061	TTAAT	2	10	483658	483667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004061	ATATT	2	10	484981	484990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004061	TTAAA	2	10	512487	512496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004061	TAAAA	2	10	518949	518958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004061	ATATA	2	10	519035	519044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004061	AAATT	2	10	521094	521103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004061	TTAAT	2	10	528487	528496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004061	ATTTA	2	10	528507	528516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004061	ATTTT	2	10	533968	533977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004061	CACTA	2	10	540235	540244	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_004061	TAACC	2	10	541822	541831	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_004061	TCGGT	2	10	542529	542538	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_004061	TAAAT	2	10	545763	545772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004061	ATTTT	2	10	561080	561089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004061	TATAA	2	10	561313	561322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004061	ATTAA	2	10	565264	565273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004061	TAAAT	2	10	565295	565304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004061	AAAAT	2	10	569477	569486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004061	TTAAT	2	10	572791	572800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_004061	AAATA	2	10	626779	626788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.