MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus ATCC 10987

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003909	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003909	TTTCGT	2	12	10904	10915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003909	TTTCGT	2	12	30676	30687	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003909	AAGAAA	2	12	50948	50959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003909	CTTTTT	2	12	74469	74480	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003909	TTATAT	2	12	82129	82140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003909	AGTCAA	2	12	87385	87396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003909	TGACAT	2	12	103703	103714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003909	CTAGTT	2	12	168043	168054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_003909	GTATGT	2	12	205472	205483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003909	TATGTT	2	12	210450	210461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003909	ATATGT	2	12	223067	223078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003909	AAAATA	2	12	238855	238866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003909	AGAGGT	2	12	243997	244008	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003909	TTTCAT	2	12	260015	260026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_003909	ATTTTT	2	12	263816	263827	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003909	ATATAG	2	12	321477	321488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003909	AATAGA	2	12	382670	382681	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003909	TTGTTT	2	12	384209	384220	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003909	TGGCAG	2	12	417966	417977	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_003909	ATTTGA	2	12	439488	439499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003909	ATATTT	2	12	442779	442790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003909	GTGTAA	2	12	455433	455444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003909	TTTGCA	2	12	504161	504172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_003909	AGCTGA	2	12	514581	514592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_003909	AATGGA	2	12	515913	515924	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003909	AATGAA	2	12	516785	516796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003909	AAAAAT	2	12	520097	520108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003909	ATTTTT	2	12	544984	544995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003909	TTTTCT	2	12	566967	566978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_003909	ATCGGT	2	12	611343	611354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_003909	TAAAAA	2	12	618080	618091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003909	ATCATT	2	12	624267	624278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003909	TGTATA	2	12	678108	678119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003909	AATACG	2	12	749386	749397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003909	ACTTAA	2	12	789315	789326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_003909	AGGTGG	2	12	790861	790872	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003909	TTTTTG	2	12	797266	797277	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003909	TTTTTA	2	12	800950	800961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003909	CCATTG	2	12	808806	808817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003909	TAAATT	2	12	809765	809776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003909	AGTTTA	2	12	810345	810356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003909	ACATTT	2	12	810591	810602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003909	TTAAAA	2	12	810719	810730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003909	ATCAAT	2	12	857738	857749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_003909	TGTATA	2	12	866882	866893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003909	TTATAA	2	12	873150	873161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003909	GTATAT	2	12	896569	896580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003909	TAACTG	2	12	914037	914048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003909	AGAAAT	2	12	915609	915620	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003909	ATGTAA	2	12	919064	919075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003909	TTAAAG	2	12	934034	934045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003909	AAATGT	2	12	960680	960691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003909	AAGTAG	2	12	995890	995901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003909	CTTAAA	2	12	999492	999503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_003909	CTTTTT	2	12	1082357	1082368	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003909	TACTTT	2	12	1105307	1105318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_003909	ATATTT	2	12	1111338	1111349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003909	AATTAA	2	12	1127785	1127796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003909	TCTTTT	2	12	1130192	1130203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003909	TCATTT	2	12	1136299	1136310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_003909	AAATTT	2	12	1163372	1163383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003909	TAATAT	2	12	1197288	1197299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003909	AATAAA	2	12	1224515	1224526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003909	TTTTAT	2	12	1246649	1246660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003909	CTTTTT	2	12	1299035	1299046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003909	TCCAGC	2	12	1308321	1308332	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_003909	CCGCTT	2	12	1308422	1308433	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_003909	AAATAT	2	12	1318171	1318182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003909	TCTTTT	2	12	1328248	1328259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_003909	AAGTAT	2	12	1347269	1347280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003909	CGGATG	2	12	1377962	1377973	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_003909	GGAGAG	2	12	1392167	1392178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003909	AAATAA	2	12	1394720	1394731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003909	AAATTT	2	12	1400587	1400598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003909	TTTAAG	2	12	1407466	1407477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003909	AAATAT	2	12	1408990	1409001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003909	TGAAGA	2	12	1428407	1428418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003909	GGATAA	2	12	1448900	1448911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003909	AATGAA	2	12	1459843	1459854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003909	ATTATA	2	12	1493709	1493720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003909	GAAAGG	2	12	1504262	1504273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003909	ATACAA	2	12	1518463	1518474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_003909	GTTTTT	2	12	1540022	1540033	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003909	TTATCA	2	12	1555164	1555175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003909	AATGTG	2	12	1568740	1568751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003909	ATCGGT	2	12	1580900	1580911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_003909	TTTTAT	2	12	1598063	1598074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003909	AAAACA	2	12	1625898	1625909	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_003909	GTATCC	2	12	1690385	1690396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_003909	AGAAAA	2	12	1696422	1696433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003909	TTTCTA	2	12	1719448	1719459	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003909	TATAAC	2	12	1733335	1733346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_003909	ACGGCA	2	12	1738967	1738978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_003909	TGAAGA	2	12	1740700	1740711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003909	TAAAGA	2	12	1743659	1743670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003909	GAGAAA	2	12	1761429	1761440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003909	TTCATA	2	12	1763372	1763383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_003909	TTTATT	2	12	1763524	1763535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003909	GAATAG	2	12	1773918	1773929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003909	ATTTGA	2	12	1776008	1776019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003909	TTTCTT	2	12	1813539	1813550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_003909	ATGTTT	2	12	1828782	1828793	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003909	TACGTA	2	12	1828887	1828898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003909	TTTTTA	2	12	1866592	1866603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003909	AGAAAA	2	12	1867042	1867053	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003909	TAATGG	2	12	1888083	1888094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003909	GATAAA	2	12	1907883	1907894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003909	AAAATC	2	12	1923137	1923148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_003909	GAAAGA	2	12	1988080	1988091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003909	TATGAA	2	12	2005346	2005357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003909	TATAAT	2	12	2016018	2016029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003909	CATATA	2	12	2060340	2060351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_003909	TACATG	2	12	2072482	2072493	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003909	ATTATA	2	12	2084312	2084323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003909	AAATCA	2	12	2103339	2103350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_003909	TGCAAG	2	12	2132792	2132803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_003909	TAGAAA	2	12	2153263	2153274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003909	TGGAAA	2	12	2163858	2163869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003909	CTGTAT	2	12	2172969	2172980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_003909	TTCTTT	2	12	2174520	2174531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_003909	TTTAAT	2	12	2177504	2177515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003909	TTAATT	2	12	2179133	2179144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003909	CAGAAA	2	12	2184522	2184533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_003909	AGGAGA	2	12	2191338	2191349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003909	AGTATA	2	12	2224166	2224177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003909	TCTGCT	2	12	2245859	2245870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003909	CGTGAT	2	12	2246439	2246450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_003909	GAAAAA	2	12	2255499	2255510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003909	TTATTT	2	12	2264457	2264468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003909	TGTAAT	2	12	2276181	2276192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_003909	ATTATC	2	12	2354001	2354012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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251	NC_003909	TCCTCA	2	12	4280151	4280162	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
252	NC_003909	TCCAAT	2	12	4285578	4285589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_003909	CAAAAA	2	12	4301765	4301776	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_003909	GCTTTC	2	12	4306680	4306691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.