MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis bv. 1 str. 16M chromosome II

Total Repeats: 408

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003318	GAAG	2	8	4928	4935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003318	GCCC	2	8	8365	8372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_003318	CTGG	2	8	20290	20297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003318	TCAT	2	8	22724	22731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003318	CGGC	2	8	22935	22942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_003318	TTTG	2	8	25750	25757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003318	AGCA	2	8	25955	25962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003318	CTGG	2	8	30034	30041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003318	CCAT	2	8	35979	35986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_003318	GTTT	2	8	37350	37357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003318	ATTC	2	8	45373	45380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003318	GACA	2	8	45477	45484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003318	TATG	2	8	45658	45665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003318	GAAC	2	8	48874	48881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003318	CATT	2	8	51985	51992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003318	AGGC	2	8	52823	52830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003318	TGTC	2	8	61898	61905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003318	AAGG	2	8	64145	64152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003318	TGTT	2	8	64168	64175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003318	CGGT	2	8	64768	64775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003318	TTTC	2	8	64949	64956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003318	ATCA	2	8	71410	71417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003318	ATCG	2	8	83097	83104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003318	TTTC	2	8	91963	91970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003318	TCCT	2	8	92120	92127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003318	TTCT	2	8	94640	94647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_003318	GAAA	2	8	103814	103821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003318	GATG	2	8	103862	103869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003318	TCCC	2	8	104943	104950	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_003318	TATT	2	8	107357	107364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003318	AAAT	2	8	107379	107386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003318	GCAG	2	8	110989	110996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003318	GGCT	2	8	112660	112667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003318	GCAC	2	8	114908	114915	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003318	CCAT	2	8	118036	118043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_003318	TTTG	2	8	126408	126415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003318	GGCA	2	8	129804	129811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003318	AATA	2	8	145333	145340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003318	AGCA	2	8	150036	150043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003318	ATTT	2	8	150063	150070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003318	TGTT	2	8	151445	151452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003318	CCGC	2	8	159778	159785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_003318	CCAA	2	8	161665	161672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003318	GAAT	2	8	163393	163400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003318	CGCA	2	8	170143	170150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_003318	ATTC	3	12	170257	170268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003318	TATT	2	8	170394	170401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003318	TTCC	2	8	171318	171325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003318	AAAC	2	8	177064	177071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003318	GGCA	2	8	181119	181126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003318	CCTC	2	8	181168	181175	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_003318	CTGC	2	8	184827	184834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003318	GGCA	2	8	186068	186075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003318	TTCA	2	8	187446	187453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003318	ACAA	2	8	188004	188011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003318	CCCG	2	8	188111	188118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_003318	TGTT	2	8	189276	189283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003318	GGTT	2	8	189390	189397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003318	GAAC	2	8	189789	189796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003318	GTGA	2	8	190132	190139	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003318	TCTT	2	8	191372	191379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003318	AAGA	2	8	191731	191738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003318	TGAT	2	8	191857	191864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003318	GCGA	2	8	192421	192428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003318	CGTC	2	8	193126	193133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_003318	AAAG	2	8	193249	193256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003318	TCGT	2	8	194349	194356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_003318	GCCT	2	8	194374	194381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_003318	TCGA	2	8	194909	194916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003318	TCAA	2	8	195454	195461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003318	GACA	2	8	197761	197768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003318	ATTG	2	8	197850	197857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003318	TCGA	2	8	202880	202887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003318	TTGG	2	8	214437	214444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003318	GAAG	2	8	219646	219653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003318	ATGG	2	8	224707	224714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003318	AATA	2	8	224804	224811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003318	TTTC	2	8	224913	224920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003318	AATT	2	8	242257	242264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003318	CAAA	2	8	243844	243851	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003318	ACTG	2	8	244023	244030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003318	GAAT	2	8	252619	252626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003318	CAGG	2	8	252702	252709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_003318	ATAG	2	8	255216	255223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003318	CAAA	2	8	257504	257511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003318	TGAA	2	8	257587	257594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003318	TGAT	2	8	259217	259224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003318	CAGC	2	8	261450	261457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003318	CGCC	2	8	266145	266152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_003318	GGAC	2	8	266708	266715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003318	TTGT	2	8	275230	275237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003318	GTTA	2	8	281535	281542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003318	TTCA	2	8	289244	289251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003318	GCGA	2	8	291293	291300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003318	GGAA	2	8	291361	291368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003318	CAGG	2	8	291465	291472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_003318	CCGT	2	8	293267	293274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_003318	AGGG	2	8	297826	297833	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003318	TGGC	2	8	303943	303950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003318	GGAG	2	8	304007	304014	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003318	TATT	2	8	305445	305452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003318	TTTG	2	8	305482	305489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003318	AGCC	2	8	307395	307402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_003318	CGCC	2	8	307428	307435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_003318	GCCA	2	8	309554	309561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_003318	GATG	2	8	310134	310141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003318	GGCG	2	8	314767	314774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_003318	GGAA	2	8	315543	315550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003318	GAAG	2	8	322030	322037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003318	TCAT	2	8	331219	331226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003318	TGGG	2	8	335279	335286	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003318	CCGC	2	8	342673	342680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_003318	CGGC	2	8	344187	344194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_003318	GTTC	2	8	356089	356096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003318	CAAA	2	8	357861	357868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_003318	AACA	2	8	361141	361148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_003318	GGAT	2	8	367052	367059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003318	GAAA	2	8	386065	386072	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003318	TAGG	2	8	387473	387480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003318	TCGG	2	8	392412	392419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003318	CAAA	2	8	396815	396822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_003318	TAAA	2	8	407186	407193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003318	CATG	2	8	409605	409612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_003318	TTTG	2	8	412072	412079	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003318	TCTG	2	8	419973	419980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003318	CAGG	2	8	420922	420929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_003318	TCGC	2	8	423073	423080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_003318	TTCC	2	8	423322	423329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_003318	TCCA	2	8	427873	427880	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_003318	CGAA	2	8	427902	427909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_003318	CCTG	2	8	429815	429822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_003318	GAAG	2	8	432800	432807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003318	TTTG	2	8	439290	439297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003318	TCGC	2	8	449751	449758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_003318	CTGT	2	8	449820	449827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_003318	GGGA	2	8	449897	449904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003318	TATT	2	8	449966	449973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003318	ATTT	2	8	449976	449983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003318	GGCG	2	8	450007	450014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_003318	GAAA	2	8	450717	450724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003318	GCAA	2	8	454932	454939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003318	AGAA	2	8	464043	464050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003318	ATTA	2	8	464145	464152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003318	GCAG	2	8	465446	465453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003318	CGAA	2	8	470145	470152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_003318	CGGA	2	8	470367	470374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_003318	AAAG	2	8	476714	476721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003318	ACGA	2	8	476893	476900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003318	TTCA	2	8	476953	476960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003318	TTGC	2	8	477233	477240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003318	TAGT	2	8	477256	477263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.