MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002929	CTC	2	6	639328	639333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_002929	CGC	2	6	639339	639344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_002929	GCG	2	6	639365	639370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_002929	GCA	2	6	639375	639380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_002929	CAGCGT	2	12	639406	639417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_002929	CGC	2	6	639437	639442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_002929	CAG	3	9	639448	639456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_002929	CAC	2	6	639580	639585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_002929	GCC	2	6	639586	639591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_002929	GCA	2	6	639606	639611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_002929	GGC	2	6	639616	639621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_002929	CCA	2	6	639633	639638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_002929	GCG	2	6	639651	639656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_002929	CGG	2	6	639696	639701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_002929	CGG	2	6	639708	639713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_002929	GCA	2	6	639726	639731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_002929	CGGC	2	8	639767	639774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_002929	GC	4	8	639773	639780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_002929	CGG	2	6	639784	639789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_002929	CGG	2	6	639792	639797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_002929	GCC	2	6	639818	639823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_002929	CGGC	2	8	639867	639874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_002929	GC	3	6	639898	639903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_002929	GAT	2	6	639952	639957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_002929	GGTG	2	8	639963	639970	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_002929	GC	3	6	639976	639981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_002929	CGA	2	6	640029	640034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_002929	ACG	2	6	640109	640114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_002929	GGC	2	6	640138	640143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_002929	AGG	2	6	640152	640157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_002929	GCG	2	6	640197	640202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002929	TCG	2	6	640229	640234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_002929	GCC	2	6	640252	640257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_002929	CCG	2	6	640279	640284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_002929	GC	3	6	640315	640320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_002929	CAT	2	6	640327	640332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_002929	GC	3	6	640356	640361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3041	NC_002929	GC	3	6	640407	640412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_002929	GGC	2	6	640423	640428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_002929	CGC	2	6	640429	640434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_002929	GC	3	6	640496	640501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_002929	GC	3	6	640503	640508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_002929	CG	3	6	640557	640562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_002929	CGG	2	6	640596	640601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_002929	CATT	2	8	640613	640620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_002929	GGT	2	6	640624	640629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_002929	GC	3	6	640689	640694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_002929	GCC	2	6	640717	640722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3055	NC_002929	GC	4	8	640829	640836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_002929	GCGCC	2	10	640860	640869	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3057	NC_002929	CGG	2	6	640923	640928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_002929	CGGC	2	8	640962	640969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_002929	CGA	2	6	640974	640979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_002929	GCC	2	6	641006	641011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_002929	CGA	2	6	641076	641081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_002929	CG	3	6	641085	641090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_002929	CGGC	3	12	641107	641118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_002929	CGG	2	6	641133	641138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_002929	CGA	2	6	641145	641150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_002929	GC	3	6	641161	641166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_002929	CCG	3	9	641175	641183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_002929	CG	4	8	641182	641189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_002929	GCG	2	6	641205	641210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_002929	CCT	2	6	642249	642254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_002929	A	7	7	642326	642332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_002929	GCCA	2	8	642360	642367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_002929	T	6	6	642379	642384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3075	NC_002929	GAG	2	6	647973	647978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_002929	GCC	2	6	651122	651127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_002929	AAT	2	6	651143	651148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_002929	CG	3	6	651164	651169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_002929	C	7	7	652223	652229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3082	NC_002929	CCGG	2	8	652246	652253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_002929	C	6	6	653273	653278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3084	NC_002929	CCGG	2	8	653295	653302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_002929	CCG	2	6	654692	654697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_002929	GCG	2	6	654699	654704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3088	NC_002929	TGGT	2	8	654904	654911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_002929	CGC	2	6	655022	655027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_002929	CGG	2	6	655091	655096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_002929	CGC	2	6	655103	655108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3093	NC_002929	TCG	2	6	655210	655215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_002929	GAT	2	6	655281	655286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_002929	GC	3	6	655295	655300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_002929	CCGCG	2	10	655351	655360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3097	NC_002929	GC	4	8	655438	655445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_002929	TTCCTC	2	12	655597	655608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_002929	ATGC	2	8	655642	655649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_002929	GGCAC	2	10	655670	655679	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3101	NC_002929	GGTC	2	8	655692	655699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_002929	TGC	2	6	655712	655717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_002929	CATGGG	2	12	655755	655766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3104	NC_002929	GAA	2	6	655792	655797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_002929	CGC	2	6	655851	655856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_002929	GCA	2	6	655857	655862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_002929	TTC	2	6	655870	655875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_002929	GC	3	6	656941	656946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_002929	TCTT	2	8	662208	662215	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_002929	CGTCCA	2	12	662242	662253	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_002929	CCT	2	6	662264	662269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_002929	A	6	6	662286	662291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_002929	CGAAC	2	10	662326	662335	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3114	NC_002929	CGC	2	6	662372	662377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_002929	GGACC	2	10	663446	663455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3116	NC_002929	G	7	7	663477	663483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_002929	CAC	2	6	663489	663494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_002929	CGC	2	6	663520	663525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_002929	TCT	2	6	667117	667122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_002929	GC	3	6	667155	667160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_002929	CATCGG	2	12	667188	667199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_002929	GCA	2	6	667228	667233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_002929	A	6	6	667242	667247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_002929	CG	3	6	667251	667256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_002929	ATGCC	2	10	667300	667309	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3126	NC_002929	GCC	3	9	667432	667440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_002929	ACC	2	6	667454	667459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_002929	GAG	2	6	667467	667472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_002929	CCG	2	6	668477	668482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_002929	CGG	2	6	669577	669582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_002929	GC	3	6	669614	669619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_002929	GCC	2	6	669628	669633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_002929	CCG	2	6	672622	672627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_002929	CCT	2	6	672633	672638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3136	NC_002929	AT	3	6	672819	672824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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