MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_002929	TG	3	6	524036	524041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_002929	GCA	2	6	524081	524086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_002929	AGG	2	6	524096	524101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_002929	CAA	2	6	524121	524126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_002929	CCGG	2	8	525101	525108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_002929	G	6	6	525125	525130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2509	NC_002929	CGG	2	6	525658	525663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_002929	GGCG	2	8	525703	525710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2514	NC_002929	GCG	2	6	526512	526517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_002929	G	6	6	526523	526528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_002929	TTG	2	6	526541	526546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_002929	GT	3	6	526566	526571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2519	NC_002929	TGG	2	6	526658	526663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_002929	CTAT	2	8	526665	526672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2533	NC_002929	TTC	2	6	530048	530053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2544	NC_002929	CGC	2	6	530363	530368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_002929	GACGCC	2	12	530484	530495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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2549	NC_002929	CAT	2	6	530628	530633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2555	NC_002929	GC	4	8	530772	530779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_002929	TGG	2	6	530803	530808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2558	NC_002929	GC	3	6	530848	530853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_002929	GC	3	6	530855	530860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2560	NC_002929	GC	3	6	530894	530899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_002929	TGC	2	6	530906	530911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2563	NC_002929	CGA	2	6	530967	530972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_002929	CGC	2	6	531250	531255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_002929	GC	3	6	531641	531646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_002929	CG	3	6	531650	531655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2567	NC_002929	T	6	6	531710	531715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_002929	GA	3	6	532030	532035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_002929	GCA	2	6	532075	532080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2581	NC_002929	CGG	2	6	538962	538967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2606	NC_002929	TGG	2	6	545140	545145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2608	NC_002929	GCCG	2	8	545169	545176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_002929	GCG	2	6	545197	545202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_002929	CAA	2	6	545205	545210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_002929	CCGG	2	8	546221	546228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_002929	CGGC	2	8	546323	546330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_002929	GC	3	6	546329	546334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_002929	CCGG	2	8	548675	548682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_002929	AAC	2	6	550320	550325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2618	NC_002929	GAA	2	6	551409	551414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_002929	CG	3	6	551431	551436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_002929	GC	3	6	551438	551443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2621	NC_002929	CGG	2	6	551496	551501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_002929	ATG	2	6	552853	552858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2624	NC_002929	CG	3	6	552891	552896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_002929	ATACGT	2	12	552922	552933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2635	NC_002929	GGC	3	9	557997	558005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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