MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002929	CAGC	2	8	313319	313326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_002929	CGA	2	6	313340	313345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_002929	GGC	2	6	313403	313408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_002929	GGC	2	6	313428	313433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_002929	GGT	2	6	313442	313447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002929	CCG	2	6	313462	313467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_002929	GCC	2	6	313503	313508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_002929	GTG	2	6	313518	313523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_002929	CG	3	6	313533	313538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_002929	GC	3	6	313554	313559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_002929	CGTG	2	8	313610	313617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_002929	CGAGGC	2	12	313655	313666	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_002929	GC	4	8	313665	313672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_002929	CTGG	2	8	313739	313746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_002929	GGCCA	2	10	313773	313782	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1516	NC_002929	CGG	2	6	313793	313798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_002929	GCG	2	6	315877	315882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_002929	CAT	2	6	315890	315895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_002929	AAC	2	6	315908	315913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_002929	CCG	2	6	318488	318493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_002929	GCCCG	2	10	318510	318519	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1522	NC_002929	CG	3	6	320174	320179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_002929	AATC	2	8	320258	320265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_002929	T	7	7	320304	320310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_002929	CAAAA	2	10	320315	320324	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1526	NC_002929	A	6	6	320321	320326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_002929	GGGCC	2	10	320357	320366	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1528	NC_002929	CGG	2	6	320377	320382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_002929	AGCT	2	8	323188	323195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_002929	CAG	2	6	323280	323285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_002929	AG	3	6	323290	323295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_002929	GCC	2	6	323495	323500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_002929	CCG	2	6	326692	326697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_002929	GCCG	2	8	326699	326706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_002929	ATG	2	6	326745	326750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_002929	TGG	2	6	326776	326781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_002929	GCG	2	6	327560	327565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_002929	GCC	2	6	327570	327575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_002929	CGG	2	6	327578	327583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_002929	CGG	2	6	329648	329653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_002929	CGG	2	6	330369	330374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_002929	TGA	2	6	330375	330380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_002929	GGC	2	6	330396	330401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_002929	GC	3	6	330400	330405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_002929	GGGC	2	8	330421	330428	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_002929	C	6	6	330513	330518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1547	NC_002929	CCGG	2	8	330535	330542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_002929	GGGC	2	8	336194	336201	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_002929	CG	3	6	336230	336235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_002929	CTGT	2	8	336236	336243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_002929	GC	3	6	336262	336267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_002929	TGG	2	6	338178	338183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_002929	GTT	2	6	338217	338222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_002929	TGC	2	6	338333	338338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_002929	CGC	2	6	338346	338351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1557	NC_002929	CG	3	6	338456	338461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_002929	GC	3	6	338507	338512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_002929	CTG	2	6	338519	338524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_002929	GC	3	6	338538	338543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_002929	GC	3	6	338557	338562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_002929	GCG	2	6	338577	338582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_002929	GCG	2	6	338719	338724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_002929	GGC	2	6	338748	338753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_002929	CGG	2	6	338757	338762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_002929	AGG	2	6	338787	338792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_002929	GCG	2	6	338842	338847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1569	NC_002929	TGC	2	6	338889	338894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_002929	CGA	2	6	338910	338915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_002929	GC	3	6	338940	338945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_002929	AGC	2	6	338971	338976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_002929	AGC	2	6	338981	338986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_002929	GGC	2	6	339217	339222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1590	NC_002929	GGCC	2	8	339423	339430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_002929	GC	3	6	339432	339437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_002929	TCGA	2	8	339448	339455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_002929	GC	3	6	339468	339473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1595	NC_002929	GGC	2	6	339535	339540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_002929	GC	3	6	339543	339548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_002929	GCCG	2	8	339584	339591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_002929	GGCG	2	8	339597	339604	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_002929	GC	3	6	339663	339668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_002929	GC	3	6	339682	339687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_002929	GAGC	2	8	339688	339695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_002929	ACG	2	6	339725	339730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_002929	GC	4	8	339740	339747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_002929	CAG	2	6	339754	339759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1606	NC_002929	GCG	2	6	339788	339793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_002929	CGG	2	6	339807	339812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_002929	GCG	3	9	339818	339826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_002929	CCA	2	6	339828	339833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_002929	GCG	2	6	341835	341840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1613	NC_002929	CG	3	6	343939	343944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_002929	CGG	2	6	343959	343964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_002929	CGCGCC	2	12	343991	344002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1618	NC_002929	TGC	2	6	345365	345370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_002929	CAG	2	6	346312	346317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_002929	CAG	3	9	346333	346341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_002929	GC	3	6	348298	348303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_002929	GGC	2	6	350872	350877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_002929	GCG	2	6	350889	350894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_002929	ACC	2	6	350973	350978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_002929	T	8	8	351009	351016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_002929	TGGC	2	8	351039	351046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_002929	CGT	2	6	351989	351994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_002929	AGGC	2	8	352520	352527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_002929	TGA	2	6	352529	352534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_002929	CG	3	6	352567	352572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_002929	TGCC	2	8	352584	352591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_002929	GC	3	6	352593	352598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_002929	CGC	2	6	352613	352618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_002929	GGCC	3	12	352672	352683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_002929	TTTA	2	8	352898	352905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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