MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002929	GCC	2	6	220027	220032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_002929	AAC	2	6	223031	223036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_002929	AGC	2	6	223044	223049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_002929	TGC	2	6	223075	223080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_002929	T	6	6	223105	223110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002929	GC	3	6	223147	223152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_002929	CCG	2	6	223175	223180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_002929	GAT	2	6	223246	223251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002929	ATC	2	6	223261	223266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_002929	CTC	2	6	223296	223301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_002929	CCGT	2	8	223323	223330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_002929	GC	3	6	223371	223376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_002929	GGC	2	6	223381	223386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002929	GGC	2	6	223400	223405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002929	GGC	2	6	223412	223417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002929	GGC	2	6	223427	223432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_002929	GGC	2	6	223439	223444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_002929	CCG	2	6	223538	223543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_002929	TCC	2	6	223567	223572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_002929	CGC	2	6	223575	223580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_002929	CCGC	2	8	226598	226605	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1022	NC_002929	GC	3	6	226634	226639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_002929	AAAT	2	8	226702	226709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002929	CGC	2	6	226806	226811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_002929	CGC	2	6	226828	226833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_002929	C	6	6	227799	227804	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1027	NC_002929	GCC	2	6	227811	227816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_002929	C	6	6	227849	227854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1029	NC_002929	ACGCAA	2	12	227860	227871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_002929	CGC	3	9	229251	229259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_002929	CCTT	2	8	229261	229268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_002929	CG	5	10	230043	230052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_002929	GCCG	3	12	230913	230924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_002929	CGC	2	6	230925	230930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_002929	ACC	2	6	230955	230960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_002929	TTC	2	6	230972	230977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002929	AGA	2	6	230978	230983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002929	GTT	2	6	230987	230992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002929	CGA	2	6	231028	231033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_002929	CGGC	2	8	232385	232392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_002929	CTGC	2	8	233028	233035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_002929	GGGC	2	8	233039	233046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_002929	GTCT	2	8	234938	234945	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_002929	TCC	2	6	235327	235332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_002929	GCC	2	6	235338	235343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_002929	GCG	2	6	235362	235367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_002929	CGGC	2	8	235389	235396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_002929	CTG	2	6	235436	235441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_002929	CCA	2	6	235462	235467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_002929	CCGG	2	8	236430	236437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_002929	G	7	7	236454	236460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_002929	GCC	2	6	237326	237331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_002929	CAC	2	6	237373	237378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_002929	GCC	2	6	237468	237473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_002929	CCG	2	6	237516	237521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_002929	CGT	2	6	237531	237536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_002929	TGGC	2	8	237557	237564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_002929	GCC	2	6	237617	237622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_002929	GCC	2	6	237629	237634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_002929	CGGC	2	8	237693	237700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_002929	CGT	2	6	237736	237741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_002929	GGC	2	6	237818	237823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_002929	GGTG	2	8	237862	237869	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002929	CAG	2	6	237935	237940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_002929	GC	3	6	237956	237961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_002929	CCA	2	6	237985	237990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_002929	TCG	2	6	237999	238004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_002929	GTA	2	6	238025	238030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_002929	GC	3	6	238103	238108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_002929	TCC	2	6	238154	238159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_002929	ATA	2	6	238190	238195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_002929	TAT	2	6	238202	238207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_002929	AGT	2	6	238208	238213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_002929	CGC	2	6	238246	238251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_002929	AC	3	6	238268	238273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_002929	CAT	2	6	238736	238741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_002929	GGC	2	6	238812	238817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_002929	CGG	2	6	238874	238879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_002929	GC	3	6	238883	238888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_002929	GC	4	8	238894	238901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_002929	GGC	3	9	238904	238912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_002929	GCC	2	6	238917	238922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_002929	TGC	2	6	238936	238941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_002929	GGC	2	6	238961	238966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_002929	GC	3	6	239008	239013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_002929	TCA	2	6	239017	239022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_002929	CCA	2	6	239029	239034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_002929	GCATGC	2	12	239083	239094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_002929	GCT	2	6	239141	239146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_002929	GC	3	6	239164	239169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_002929	GC	4	8	239178	239185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_002929	GCT	2	6	239195	239200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_002929	GCG	2	6	239227	239232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_002929	GCG	2	6	239239	239244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_002929	CG	3	6	239248	239253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_002929	GGT	2	6	239258	239263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_002929	CAA	2	6	239264	239269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_002929	TGC	2	6	239416	239421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_002929	GCG	2	6	239422	239427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_002929	CGG	2	6	239434	239439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_002929	GGC	2	6	239489	239494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_002929	GC	3	6	239493	239498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_002929	CGG	2	6	239545	239550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_002929	CG	4	8	239551	239558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_002929	GCG	2	6	239676	239681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_002929	GC	3	6	239691	239696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_002929	CG	3	6	239697	239702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_002929	GTGC	2	8	240454	240461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_002929	CTC	2	6	241542	241547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_002929	GCG	2	6	241561	241566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_002929	CAT	2	6	241627	241632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_002929	GAG	2	6	241638	241643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002929	CT	3	6	241652	241657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_002929	CG	3	6	241673	241678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_002929	GCCGC	2	10	241679	241688	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1116	NC_002929	GT	3	6	241689	241694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002929	GAG	2	6	241696	241701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002929	CGC	2	6	243829	243834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_002929	GC	3	6	243867	243872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_002929	CCA	2	6	243880	243885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_002929	GGA	2	6	243893	243898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002929	GGC	2	6	243962	243967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_002929	CG	4	8	243968	243975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_002929	CG	3	6	244025	244030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_002929	TGG	2	6	244039	244044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_002929	CG	4	8	244047	244054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_002929	GGC	2	6	244094	244099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_002929	CGA	2	6	244115	244120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002929	CAT	2	6	244136	244141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_002929	CGG	2	6	244156	244161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_002929	GCG	2	6	244201	244206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_002929	GCT	2	6	244211	244216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_002929	GC	3	6	244284	244289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_002929	GCG	2	6	244312	244317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_002929	GCGCC	2	10	244324	244333	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1136	NC_002929	GC	3	6	244334	244339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_002929	TGG	2	6	244365	244370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_002929	CG	3	6	307020	307025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_002929	GGC	3	9	307026	307034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_002929	GGC	2	6	307056	307061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_002929	GCG	2	6	310478	310483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_002929	CTTC	2	8	310500	310507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_002929	TA	3	6	310590	310595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_002929	CG	3	6	310639	310644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1415	NC_002929	GCG	2	6	310652	310657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1417	NC_002929	CTG	2	6	310729	310734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_002929	GAC	2	6	311044	311049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1431	NC_002929	TCG	2	6	311283	311288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_002929	GCG	2	6	311628	311633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_002929	GCGCG	2	10	311638	311647	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1443	NC_002929	GCA	2	6	311650	311655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_002929	GCG	2	6	311734	311739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_002929	GC	3	6	311930	311935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1453	NC_002929	GCG	2	6	312045	312050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_002929	TGG	2	6	312063	312068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_002929	GGC	2	6	312664	312669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1494	NC_002929	CGG	2	6	313152	313157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1500	NC_002929	CAA	2	6	313298	313303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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