MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002929	GAA	3	9	108711	108719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_002929	ATG	3	9	108748	108756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002929	GC	3	6	108770	108775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_002929	CG	3	6	108776	108781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_002929	CCG	4	12	108802	108813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_002929	GC	4	8	108821	108828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_002929	GGC	2	6	108858	108863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_002929	GGC	2	6	108888	108893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_002929	GGC	2	6	108900	108905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_002929	CGG	2	6	108911	108916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_002929	CGG	2	6	108935	108940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_002929	ACG	2	6	108973	108978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_002929	CGGCC	2	10	108989	108998	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
514	NC_002929	CCGGG	2	10	109034	109043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
515	NC_002929	CAG	2	6	109054	109059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_002929	GCA	2	6	109098	109103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_002929	TGG	2	6	109104	109109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_002929	GCCC	2	8	109126	109133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
519	NC_002929	CAT	2	6	109152	109157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_002929	GGCC	2	8	109230	109237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_002929	GCC	4	12	109235	109246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_002929	CCCG	2	8	109252	109259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
523	NC_002929	GGC	2	6	110533	110538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002929	GCC	2	6	110543	110548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_002929	CG	3	6	114281	114286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_002929	TCC	2	6	114775	114780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_002929	GGT	2	6	114781	114786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002929	CAC	2	6	114797	114802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_002929	CG	3	6	114803	114808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_002929	CTG	2	6	114874	114879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002929	TGTA	2	8	114920	114927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002929	TCC	2	6	116030	116035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_002929	A	6	6	119025	119030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_002929	GC	3	6	119034	119039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_002929	GGT	2	6	119049	119054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002929	TTGT	2	8	120104	120111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_002929	CGC	2	6	120173	120178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_002929	GCG	3	9	120186	120194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_002929	GCC	2	6	121052	121057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_002929	CAC	2	6	121060	121065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_002929	GGC	2	6	121111	121116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_002929	CCGG	2	8	122074	122081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_002929	G	6	6	122098	122103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002929	CGT	2	6	122177	122182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_002929	GCC	2	6	122208	122213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_002929	GAA	2	6	122217	122222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_002929	GGCG	2	8	122270	122277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
548	NC_002929	GCGG	2	8	122282	122289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
549	NC_002929	TCG	2	6	122302	122307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002929	CAG	2	6	122316	122321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_002929	CG	3	6	122327	122332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_002929	CG	3	6	122337	122342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_002929	CGA	2	6	122372	122377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_002929	CCG	2	6	122435	122440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_002929	CAT	2	6	122466	122471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_002929	GAT	2	6	122496	122501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_002929	GGT	2	6	122502	122507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_002929	GCA	2	6	122522	122527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_002929	CAG	3	9	122592	122600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002929	CG	3	6	122603	122608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_002929	GC	5	10	122621	122630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_002929	CGCTGG	2	12	122641	122652	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002929	CCG	2	6	122653	122658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_002929	GCG	2	6	122673	122678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_002929	CG	3	6	122723	122728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_002929	GC	3	6	122733	122738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_002929	CGCGTA	2	12	122753	122764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_002929	TCG	2	6	122869	122874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_002929	GCT	2	6	122903	122908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_002929	GCA	2	6	122927	122932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_002929	CAG	2	6	122961	122966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_002929	CGC	2	6	122978	122983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_002929	GC	4	8	123011	123018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_002929	GCC	2	6	123021	123026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_002929	GC	5	10	123935	123944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_002929	GCC	3	9	124007	124015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_002929	GCA	2	6	124062	124067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_002929	TGG	2	6	124115	124120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002929	GGCGCC	2	12	124131	124142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_002929	CAG	2	6	124143	124148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_002929	CGA	2	6	124178	124183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002929	GCG	2	6	124185	124190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_002929	CG	3	6	124198	124203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_002929	GCC	2	6	124216	124221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_002929	CAG	2	6	124224	124229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_002929	CTG	2	6	124242	124247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002929	CGC	3	9	124248	124256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_002929	GCCC	2	8	124310	124317	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
589	NC_002929	GGC	2	6	124382	124387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002929	CAG	2	6	124392	124397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002929	GAT	2	6	124398	124403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_002929	CAG	2	6	124446	124451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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595	NC_002929	GCCAG	2	10	124487	124496	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
596	NC_002929	GCA	2	6	124673	124678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_002929	CGGC	2	8	124703	124710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_002929	AAC	2	6	124717	124722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_002929	GCG	3	9	125782	125790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_002929	GC	3	6	125823	125828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_002929	CAG	2	6	125862	125867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_002929	CG	3	6	125978	125983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_002929	CAG	2	6	126030	126035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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607	NC_002929	GC	4	8	126169	126176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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609	NC_002929	GGC	2	6	126205	126210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_002929	GCG	2	6	126235	126240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_002929	CG	4	8	126273	126280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_002929	GCG	3	9	126278	126286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_002929	CGAC	2	8	126294	126301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_002929	TGG	2	6	126422	126427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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616	NC_002929	CAT	2	6	126484	126489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_002929	CGGCG	2	10	126501	126510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
618	NC_002929	AGC	3	9	126566	126574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_002929	CGGC	2	8	126593	126600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_002929	GC	3	6	126599	126604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_002929	AGC	2	6	126683	126688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_002929	GC	3	6	126704	126709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_002929	GGCG	2	8	126718	126725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
624	NC_002929	GAT	2	6	126731	126736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002929	GGC	2	6	126750	126755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_002929	GCA	2	6	126818	126823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_002929	GCGCG	2	10	126939	126948	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
628	NC_002929	CG	4	8	126945	126952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_002929	GCG	2	6	126970	126975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_002929	CAT	2	6	127010	127015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_002929	TAA	2	6	130225	130230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_002929	GTA	2	6	130310	130315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002929	GGCC	2	8	130349	130356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_002929	GGC	2	6	130404	130409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_002929	GCGCA	2	10	130438	130447	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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637	NC_002929	GC	3	6	130468	130473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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