MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002929	GCC	2	6	1233678	1233683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_002929	GC	3	6	1233720	1233725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_002929	CAG	2	6	1233738	1233743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_002929	CAG	2	6	1233753	1233758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_002929	GC	3	6	1233769	1233774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_002929	A	6	6	1233778	1233783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_002929	CGA	2	6	1233790	1233795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_002929	GTGGC	2	10	1233852	1233861	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5509	NC_002929	CG	3	6	1233894	1233899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_002929	GCC	2	6	1234713	1234718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_002929	CGAT	2	8	1235734	1235741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_002929	GCCG	2	8	1238281	1238288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_002929	GC	3	6	1238289	1238294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_002929	GCCA	2	8	1238304	1238311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_002929	TCG	2	6	1238314	1238319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_002929	GC	3	6	1238344	1238349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_002929	GCC	2	6	1238399	1238404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_002929	GC	3	6	1238443	1238448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_002929	GCGTC	2	10	1238465	1238474	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5520	NC_002929	CGC	2	6	1238485	1238490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_002929	GCA	2	6	1238504	1238509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_002929	GC	3	6	1238511	1238516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_002929	GCC	2	6	1238534	1238539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_002929	GCC	2	6	1238553	1238558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_002929	CGG	2	6	1238580	1238585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_002929	CCG	2	6	1238621	1238626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_002929	GCG	2	6	1238639	1238644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_002929	ACC	2	6	1238677	1238682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5531	NC_002929	GGC	2	6	1238753	1238758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_002929	CGC	2	6	1238765	1238770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5535	NC_002929	CGC	2	6	1238854	1238859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_002929	GC	3	6	1238872	1238877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_002929	CAC	2	6	1238902	1238907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_002929	GC	3	6	1238945	1238950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_002929	TCC	2	6	1239014	1239019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_002929	CCA	2	6	1239051	1239056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_002929	GCG	2	6	1239059	1239064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_002929	CGGC	2	8	1239092	1239099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_002929	GCA	2	6	1239102	1239107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_002929	GCA	2	6	1239111	1239116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_002929	GCGCG	2	10	1239123	1239132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5546	NC_002929	CG	3	6	1239159	1239164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_002929	GCGCC	2	10	1239172	1239181	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5548	NC_002929	CGC	2	6	1239220	1239225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5551	NC_002929	CGGC	2	8	1239349	1239356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_002929	CCA	2	6	1239360	1239365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_002929	TCA	2	6	1239366	1239371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5555	NC_002929	CCA	3	9	1239381	1239389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_002929	CGG	2	6	1239390	1239395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_002929	TCA	2	6	1239396	1239401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_002929	CGG	2	6	1239429	1239434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_002929	CGAG	2	8	1239447	1239454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_002929	CGCC	2	8	1239515	1239522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5561	NC_002929	GCC	3	9	1239520	1239528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_002929	CAG	2	6	1239580	1239585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_002929	GCCC	2	8	1239591	1239598	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5564	NC_002929	GC	3	6	1239630	1239635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_002929	GCG	2	6	1239651	1239656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_002929	CAC	2	6	1239667	1239672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_002929	CAG	2	6	1239688	1239693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5571	NC_002929	CGGCAT	2	12	1239874	1239885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_002929	GC	4	8	1239902	1239909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_002929	AAT	2	6	1240591	1240596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_002929	CGC	2	6	1241065	1241070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5583	NC_002929	CAT	2	6	1242128	1242133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5585	NC_002929	CCGG	2	8	1242261	1242268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5588	NC_002929	GCC	2	6	1244179	1244184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5591	NC_002929	GGC	2	6	1244221	1244226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_002929	GCG	2	6	1244236	1244241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_002929	CGG	2	6	1244293	1244298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_002929	GCC	2	6	1244383	1244388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5601	NC_002929	GGT	2	6	1244445	1244450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_002929	TACAC	2	10	1244468	1244477	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5603	NC_002929	CGG	2	6	1244486	1244491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_002929	ACCAT	2	10	1245464	1245473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5610	NC_002929	GC	3	6	1247735	1247740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_002929	GC	3	6	1247761	1247766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_002929	CGC	2	6	1248493	1248498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_002929	GC	3	6	1248497	1248502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_002929	TCG	2	6	1248510	1248515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_002929	GCCC	2	8	1250862	1250869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5631	NC_002929	GCG	2	6	1250899	1250904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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