MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002929	GCC	2	6	1096465	1096470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_002929	GCC	2	6	1096473	1096478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_002929	G	6	6	1096499	1096504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_002929	GCCC	2	8	1096511	1096518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5005	NC_002929	G	8	8	1096533	1096540	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_002929	TCC	2	6	1096572	1096577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_002929	GGT	2	6	1096578	1096583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_002929	CAC	2	6	1096594	1096599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_002929	CTG	2	6	1096671	1096676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_002929	TGTA	2	8	1096717	1096724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_002929	GCGGG	2	10	1097804	1097813	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5012	NC_002929	TCC	2	6	1097937	1097942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_002929	GAT	2	6	1097950	1097955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_002929	GCGT	2	8	1097979	1097986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_002929	TGC	2	6	1098020	1098025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_002929	TTC	2	6	1098031	1098036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_002929	GGCG	2	8	1098061	1098068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_002929	GAG	2	6	1100827	1100832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_002929	GGA	2	6	1100847	1100852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_002929	GCC	2	6	1102426	1102431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_002929	CGGC	2	8	1102439	1102446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_002929	CGGG	2	8	1102464	1102471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_002929	GCG	2	6	1102489	1102494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_002929	CCGG	2	8	1102495	1102502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_002929	GTA	2	6	1102513	1102518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_002929	CAGC	2	8	1102520	1102527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_002929	GCC	2	6	1102544	1102549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_002929	ATG	2	6	1103336	1103341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_002929	CGG	2	6	1103697	1103702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_002929	CG	3	6	1103710	1103715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_002929	GGCG	2	8	1104521	1104528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_002929	GCC	2	6	1104535	1104540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_002929	CCT	2	6	1106151	1106156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_002929	AGG	2	6	1106169	1106174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_002929	GCCGG	2	10	1107011	1107020	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5036	NC_002929	CGC	3	9	1107035	1107043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_002929	GCGCG	2	10	1111519	1111528	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5038	NC_002929	CGCC	2	8	1111543	1111550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5039	NC_002929	GCG	3	9	1111575	1111583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_002929	CG	4	8	1111582	1111589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_002929	GC	3	6	1111605	1111610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_002929	CAT	2	6	1111618	1111623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_002929	CAT	2	6	1111672	1111677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_002929	GCG	3	9	1111706	1111714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_002929	GCG	2	6	1111759	1111764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_002929	GCTG	2	8	1111836	1111843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_002929	CTG	2	6	1111847	1111852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_002929	GCT	2	6	1111898	1111903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_002929	CAG	2	6	1111907	1111912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_002929	CTG	2	6	1111926	1111931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_002929	GC	3	6	1111971	1111976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_002929	GCG	2	6	1112020	1112025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_002929	GCGCC	2	10	1112081	1112090	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5054	NC_002929	GATC	2	8	1112108	1112115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_002929	CAT	2	6	1112117	1112122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_002929	TCG	2	6	1112127	1112132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_002929	GCG	2	6	1112191	1112196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_002929	GAC	2	6	1112283	1112288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_002929	ACCC	2	8	1112289	1112296	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5060	NC_002929	GAG	2	6	1112307	1112312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_002929	CGC	2	6	1112317	1112322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_002929	CGG	2	6	1112342	1112347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_002929	CGG	2	6	1112429	1112434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_002929	GCG	2	6	1112461	1112466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_002929	CCAG	2	8	1112490	1112497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_002929	GAC	2	6	1112528	1112533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_002929	GC	3	6	1112604	1112609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_002929	GCG	2	6	1112680	1112685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_002929	GAC	2	6	1112690	1112695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_002929	GTG	2	6	1112696	1112701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_002929	CGG	2	6	1113193	1113198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_002929	CCGG	2	8	1114167	1114174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_002929	G	7	7	1114191	1114197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_002929	CATG	2	8	1114322	1114329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_002929	GCG	2	6	1114425	1114430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_002929	GCCG	2	8	1114523	1114530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_002929	CGG	3	9	1115343	1115351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_002929	TCGC	2	8	1117330	1117337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_002929	GCAT	2	8	1118490	1118497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_002929	AAAAT	2	10	1118574	1118583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_002929	GCC	2	6	1118585	1118590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_002929	GGC	2	6	1118603	1118608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_002929	CG	3	6	1120771	1120776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_002929	CGC	2	6	1120866	1120871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_002929	ACTG	2	8	1120912	1120919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_002929	AGGTC	2	10	1122557	1122566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5087	NC_002929	GCT	2	6	1122581	1122586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_002929	CGC	2	6	1122616	1122621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_002929	GAC	2	6	1122638	1122643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_002929	CG	3	6	1123490	1123495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_002929	CGC	2	6	1123541	1123546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_002929	CAA	2	6	1123625	1123630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_002929	AGC	2	6	1125882	1125887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_002929	CAA	2	6	1127838	1127843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_002929	AGG	2	6	1127899	1127904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_002929	TCGTT	2	10	1127907	1127916	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5097	NC_002929	TCTG	2	8	1127938	1127945	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_002929	GCCA	2	8	1127982	1127989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_002929	GGCC	2	8	1129280	1129287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_002929	CCG	2	6	1129297	1129302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_002929	GCC	2	6	1129314	1129319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_002929	C	10	10	1129387	1129396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5103	NC_002929	CCGG	2	8	1129413	1129420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_002929	CGT	2	6	1130376	1130381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_002929	GCC	2	6	1130392	1130397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_002929	TGGC	2	8	1130409	1130416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_002929	CTGC	2	8	1130441	1130448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_002929	GCGCG	2	10	1130486	1130495	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5109	NC_002929	GCG	3	9	1130493	1130501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_002929	CG	4	8	1130511	1130518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_002929	GCA	2	6	1130586	1130591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_002929	GGC	2	6	1130592	1130597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_002929	GCC	2	6	1130607	1130612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_002929	GCT	2	6	1130628	1130633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_002929	GCCGC	2	10	1130667	1130676	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5116	NC_002929	GGC	2	6	1130694	1130699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_002929	GCCC	2	8	1130711	1130718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5118	NC_002929	GTT	2	6	1130931	1130936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_002929	GC	4	8	1130973	1130980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_002929	GCC	2	6	1131022	1131027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_002929	TCG	2	6	1131112	1131117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_002929	GGCGC	2	10	1131163	1131172	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5123	NC_002929	CAAC	2	8	1132009	1132016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_002929	GA	3	6	1133027	1133032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_002929	CGCTG	2	10	1133040	1133049	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5126	NC_002929	ACC	2	6	1133064	1133069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_002929	CGGC	2	8	1133083	1133090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_002929	GGCCC	2	10	1133091	1133100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5129	NC_002929	CCGG	2	8	1135105	1135112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_002929	G	6	6	1135129	1135134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_002929	ATA	2	6	1137032	1137037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_002929	TCC	2	6	1138907	1138912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_002929	TAA	2	6	1138932	1138937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_002929	GGC	3	9	1170210	1170218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5265	NC_002929	GCCCTG	2	12	1170219	1170230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_002929	GGC	2	6	1170252	1170257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_002929	GC	3	6	1170286	1170291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5268	NC_002929	GGCT	2	8	1170298	1170305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5389	NC_002929	GC	3	6	1202669	1202674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5390	NC_002929	AAG	2	6	1202687	1202692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_002929	GGC	2	6	1203027	1203032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_002929	GAG	2	6	1203037	1203042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_002929	GCG	2	6	1203252	1203257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_002929	GC	4	8	1203282	1203289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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