MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 17548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002928	TCG	2	6	500638	500643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_002928	CAG	2	6	500752	500757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_002928	CGGC	2	8	500760	500767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_002928	GGC	2	6	500799	500804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_002928	GGC	2	6	500865	500870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_002928	GC	3	6	500869	500874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_002928	GATCGA	2	12	500952	500963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_002928	GGC	2	6	500974	500979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_002928	CGGC	2	8	500996	501003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_002928	CGC	2	6	501015	501020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_002928	CCTG	2	8	501140	501147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_002928	GCC	2	6	502688	502693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_002928	CCAT	2	8	502709	502716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_002928	CCGC	2	8	502737	502744	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1515	NC_002928	GCG	2	6	502753	502758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_002928	ACA	2	6	502799	502804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_002928	ATGG	2	8	503959	503966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_002928	GGCAG	2	10	503974	503983	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_002928	GCG	2	6	503984	503989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_002928	ATC	2	6	504066	504071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_002928	CG	4	8	504120	504127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_002928	CTT	2	6	504129	504134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_002928	GCG	2	6	504141	504146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_002928	TGC	2	6	504149	504154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_002928	GC	3	6	504181	504186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_002928	TTC	2	6	504199	504204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_002928	GCG	3	9	504269	504277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_002928	ATG	2	6	504296	504301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_002928	CAGG	2	8	504356	504363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_002928	CGT	2	6	504437	504442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_002928	GCG	2	6	504490	504495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_002928	TGCT	2	8	504622	504629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_002928	CGCGAG	2	12	504668	504679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_002928	GC	3	6	504766	504771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_002928	TGC	2	6	504782	504787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_002928	CGG	2	6	504788	504793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_002928	TCT	2	6	504875	504880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_002928	GGC	2	6	504882	504887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_002928	TGCA	2	8	504915	504922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_002928	GC	3	6	504960	504965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_002928	GCG	2	6	504968	504973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_002928	GCCG	2	8	505046	505053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_002928	GCG	2	6	505056	505061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_002928	G	13	13	505123	505135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_002928	GC	3	6	505149	505154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_002928	GCCG	2	8	505176	505183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_002928	GCC	2	6	505188	505193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_002928	CCA	2	6	505232	505237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_002928	CCG	2	6	505311	505316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_002928	CGG	2	6	505317	505322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_002928	TCCTT	2	10	505393	505402	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1552	NC_002928	CT	3	6	505410	505415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_002928	GCC	2	6	505719	505724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_002928	GC	3	6	505751	505756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_002928	CGG	3	9	505776	505784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_002928	AT	3	6	505809	505814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_002928	CG	3	6	510428	510433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_002928	GCG	3	9	510431	510439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_002928	GGC	2	6	510440	510445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_002928	GCGA	2	8	510465	510472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_002928	AGCCA	2	10	510494	510503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_002928	GC	4	8	510570	510577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_002928	GATT	2	8	510583	510590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_002928	ATT	2	6	510615	510620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_002928	GTTT	2	8	510622	510629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_002928	ATC	2	6	511670	511675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_002928	GGCC	2	8	511699	511706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_002928	ACGT	2	8	511717	511724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_002928	GC	3	6	514394	514399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_002928	CGC	2	6	514437	514442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_002928	CG	3	6	515666	515671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_002928	CGC	2	6	515678	515683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_002928	CAG	2	6	515723	515728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_002928	TTGAA	2	10	516366	516375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_002928	T	6	6	516403	516408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_002928	GCG	2	6	516440	516445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_002928	GCAG	2	8	516470	516477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_002928	CTGTAC	2	12	516832	516843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_002928	GCC	2	6	516882	516887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_002928	TTA	2	6	517021	517026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_002928	TCGT	2	8	518645	518652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_002928	T	6	6	519633	519638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_002928	TGCA	2	8	519664	519671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_002928	TAT	2	6	519727	519732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_002928	TCT	2	6	519827	519832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_002928	T	7	7	519840	519846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_002928	CTTAC	2	10	520230	520239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1588	NC_002928	ACC	2	6	520332	520337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_002928	TTC	2	6	520344	520349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_002928	T	8	8	520628	520635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_002928	AAAAG	2	10	522298	522307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_002928	AGC	2	6	522365	522370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_002928	TGA	2	6	522384	522389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_002928	GC	3	6	522394	522399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_002928	GTC	2	6	522406	522411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_002928	AGG	2	6	522416	522421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_002928	GAT	2	6	522423	522428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_002928	ACA	2	6	522521	522526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_002928	AG	3	6	522689	522694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_002928	TG	3	6	522767	522772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_002928	GTA	2	6	522827	522832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_002928	AGG	2	6	522853	522858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_002928	CGC	2	6	529135	529140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_002928	CGT	2	6	529173	529178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_002928	GGCC	2	8	529185	529192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_002928	GAA	2	6	529228	529233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_002928	TCT	2	6	529352	529357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_002928	AGA	2	6	529374	529379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_002928	GCG	2	6	529423	529428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_002928	CAC	2	6	529461	529466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_002928	GGAA	2	8	529505	529512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_002928	T	6	6	529610	529615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_002928	CG	3	6	531572	531577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_002928	ACG	2	6	531617	531622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_002928	GAGG	2	8	531653	531660	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_002928	GGA	2	6	531696	531701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_002928	GGA	2	6	531739	531744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_002928	GGA	2	6	531782	531787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_002928	GTCG	2	8	531788	531795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_002928	TTG	2	6	533078	533083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_002928	TCC	2	6	533118	533123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_002928	GCG	2	6	533139	533144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_002928	GC	3	6	535773	535778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_002928	A	8	8	535782	535789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_002928	ATCG	2	8	535814	535821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_002928	CGC	2	6	536450	536455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_002928	GGC	2	6	536470	536475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_002928	CGGC	2	8	539404	539411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_002928	TCCA	2	8	539416	539423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_002928	CGG	2	6	541653	541658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_002928	AACA	2	8	541681	541688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_002928	GCCC	2	8	542708	542715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1633	NC_002928	CG	3	6	542718	542723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_002928	GC	3	6	542725	542730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_002928	GGC	2	6	542731	542736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_002928	CGG	2	6	542779	542784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_002928	CGG	2	6	542816	542821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1769	NC_002928	GC	3	6	585543	585548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1770	NC_002928	GGC	2	6	585600	585605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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