MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 17548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002928	GCG	2	6	366509	366514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_002928	TGA	2	6	366528	366533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002928	GGC	2	6	366537	366542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_002928	AGGGC	2	10	366577	366586	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_002928	CCA	3	9	366600	366608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_002928	CGGC	2	8	366615	366622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_002928	GGC	2	6	366679	366684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_002928	GCC	2	6	366698	366703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_002928	GCC	2	6	366725	366730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_002928	GGGC	2	8	366758	366765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_002928	GC	3	6	366772	366777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_002928	CAG	2	6	366808	366813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_002928	CCA	2	6	366822	366827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_002928	GGC	2	6	366850	366855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002928	CAG	2	6	366952	366957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002928	CAC	2	6	366958	366963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_002928	CG	3	6	366982	366987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_002928	GCC	2	6	367000	367005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_002928	CAC	2	6	367015	367020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_002928	GGT	2	6	367069	367074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002928	CGC	4	12	367140	367151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_002928	GC	6	12	367164	367175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_002928	CCA	2	6	367176	367181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_002928	GGCG	2	8	367182	367189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_002928	CGG	2	6	367269	367274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_002928	CGT	2	6	367296	367301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_002928	GGCA	2	8	367304	367311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_002928	GTC	2	6	367337	367342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_002928	CG	3	6	367357	367362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_002928	TGG	2	6	367395	367400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002928	CG	3	6	367428	367433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_002928	CGA	2	6	367474	367479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_002928	GCA	2	6	367503	367508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002928	GCC	3	9	367519	367527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_002928	CG	3	6	367565	367570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_002928	GGC	2	6	367588	367593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002928	TCG	2	6	367601	367606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_002928	CG	3	6	367605	367610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_002928	CGT	2	6	367650	367655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_002928	CGC	2	6	367674	367679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1042	NC_002928	TG	3	6	367781	367786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002928	TA	3	6	367811	367816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002928	GCGG	2	8	367882	367889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_002928	GCCC	2	8	367905	367912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1046	NC_002928	GGC	2	6	367940	367945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_002928	CAG	2	6	368858	368863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_002928	CG	3	6	368918	368923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_002928	CGGC	2	8	368928	368935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_002928	GCC	2	6	368984	368989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_002928	GGCG	2	8	369931	369938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_002928	GCC	2	6	369986	369991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_002928	GCG	3	9	372035	372043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_002928	CTT	2	6	374267	374272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_002928	GCGCC	2	10	374290	374299	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1057	NC_002928	CGG	3	9	374308	374316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_002928	GTT	2	6	375311	375316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002928	GTAC	2	8	375339	375346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_002928	AGGC	2	8	375365	375372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_002928	GC	3	6	375375	375380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_002928	A	6	6	375391	375396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_002928	G	8	8	375403	375410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002928	GAAC	2	8	375413	375420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_002928	AGG	2	6	375430	375435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_002928	CGG	2	6	375445	375450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_002928	TGCG	2	8	375470	375477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_002928	GGC	2	6	376536	376541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_002928	GCA	2	6	376551	376556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1071	NC_002928	ATT	2	6	378496	378501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_002928	GC	3	6	379366	379371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_002928	GC	4	8	379375	379382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_002928	GTC	2	6	380775	380780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_002928	GC	3	6	380888	380893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_002928	CGT	3	9	381942	381950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1080	NC_002928	GCCC	2	8	383726	383733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1081	NC_002928	CAA	2	6	383775	383780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_002928	ACA	2	6	383786	383791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_002928	CGG	2	6	385013	385018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_002928	GGA	2	6	385029	385034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002928	G	6	6	385035	385040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_002928	CGCC	2	8	388315	388322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1087	NC_002928	CGG	2	6	388329	388334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_002928	GCCG	2	8	389434	389441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_002928	CAA	2	6	389449	389454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_002928	GGCCG	2	10	391437	391446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1091	NC_002928	CGC	2	6	391517	391522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_002928	CCT	2	6	391536	391541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_002928	CGCC	2	8	391542	391549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1094	NC_002928	G	7	7	391593	391599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002928	GCC	2	6	391610	391615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_002928	GCA	2	6	392423	392428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_002928	TGC	2	6	392442	392447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_002928	CATT	2	8	392458	392465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_002928	GC	3	6	392524	392529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_002928	CGC	2	6	392571	392576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_002928	TGG	2	6	392605	392610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002928	AGA	2	6	393206	393211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002928	GA	3	6	396922	396927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002928	GC	3	6	396932	396937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_002928	GCC	2	6	396986	396991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_002928	CGA	2	6	397000	397005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002928	AGC	2	6	397077	397082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_002928	CG	3	6	397128	397133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_002928	GCC	2	6	397143	397148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_002928	CGG	2	6	397219	397224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_002928	GCG	2	6	397296	397301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_002928	TAT	2	6	397451	397456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002928	GCGG	2	8	399110	399117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_002928	TGT	2	6	399170	399175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002928	GTC	2	6	399189	399194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_002928	GCC	2	6	399206	399211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_002928	ATG	2	6	399221	399226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002928	TGCTG	2	10	399245	399254	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1119	NC_002928	C	7	7	399281	399287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1120	NC_002928	T	6	6	399343	399348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_002928	CGGG	2	8	400246	400253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_002928	TGG	2	6	400377	400382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_002928	ACC	2	6	400399	400404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_002928	CG	3	6	400494	400499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_002928	CCGC	2	8	400500	400507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1126	NC_002928	TG	3	6	400509	400514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_002928	A	6	6	400515	400520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_002928	GCG	2	6	400551	400556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002928	CCG	2	6	400579	400584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_002928	GC	3	6	400591	400596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_002928	AGC	2	6	400668	400673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_002928	GC	4	8	401984	401991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_002928	CGG	2	6	402007	402012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_002928	C	6	6	404004	404009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1135	NC_002928	CCGC	2	8	404915	404922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1137	NC_002928	AATT	2	8	405035	405042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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