MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 17548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002928	TGGGCC	2	12	188242	188253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_002928	TTG	2	6	188271	188276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002928	GAT	2	6	188319	188324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002928	CG	3	6	188353	188358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_002928	GGA	2	6	188364	188369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_002928	GGCG	2	8	188700	188707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
507	NC_002928	CGG	2	6	188711	188716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_002928	GGTC	2	8	190059	190066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_002928	TTCC	2	8	190621	190628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_002928	GAA	2	6	190739	190744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_002928	ACGGG	2	10	190746	190755	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
512	NC_002928	CTGG	2	8	191279	191286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_002928	T	6	6	191331	191336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002928	GCGAA	2	10	192485	192494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
515	NC_002928	GCC	2	6	192546	192551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_002928	GC	3	6	192642	192647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_002928	AGA	2	6	192681	192686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_002928	CGG	2	6	192726	192731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_002928	GTA	2	6	193277	193282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002928	ATTG	2	8	193371	193378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_002928	GCC	2	6	193405	193410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_002928	CCG	2	6	193491	193496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_002928	TGC	2	6	193504	193509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002928	GC	3	6	193508	193513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_002928	GC	3	6	193522	193527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_002928	GGC	2	6	193532	193537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_002928	GCC	3	9	193548	193556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_002928	GC	3	6	196143	196148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_002928	CGGC	2	8	196155	196162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_002928	CGG	2	6	197725	197730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002928	GCC	2	6	202577	202582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_002928	GC	3	6	204569	204574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_002928	CGG	2	6	205843	205848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002928	CGG	2	6	206153	206158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_002928	CG	3	6	206180	206185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_002928	GCC	2	6	207315	207320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_002928	GAG	2	6	207328	207333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_002928	CGA	2	6	207339	207344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_002928	CGCGC	2	10	207398	207407	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
540	NC_002928	CG	3	6	207410	207415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_002928	GCA	2	6	207421	207426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_002928	GC	3	6	207511	207516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_002928	GGGGC	2	10	208979	208988	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
544	NC_002928	GC	3	6	210217	210222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_002928	GC	3	6	210229	210234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_002928	A	6	6	211263	211268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_002928	GGC	2	6	211269	211274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_002928	GCC	2	6	211279	211284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_002928	GCC	2	6	213716	213721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_002928	GTT	2	6	213722	213727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002928	CCA	2	6	213734	213739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_002928	TATT	3	12	213759	213770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_002928	GC	3	6	213795	213800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_002928	GC	3	6	213804	213809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_002928	CGC	3	9	213807	213815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_002928	GGCC	2	8	213835	213842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_002928	CCG	2	6	213878	213883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_002928	CGGC	2	8	213905	213912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_002928	GGA	2	6	213952	213957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_002928	GCC	2	6	213961	213966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_002928	GGTT	2	8	219170	219177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002928	GAAAG	2	10	220971	220980	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002928	TGCAG	2	10	221086	221095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
564	NC_002928	TC	3	6	223412	223417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_002928	CTTC	2	8	223462	223469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_002928	AGG	2	6	223554	223559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_002928	CAAGC	2	10	225204	225213	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
568	NC_002928	CAT	2	6	225228	225233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_002928	TCA	2	6	225236	225241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_002928	GAT	2	6	225267	225272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002928	GCG	2	6	227423	227428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_002928	CGC	2	6	227467	227472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_002928	GGC	2	6	227484	227489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002928	GGA	2	6	229920	229925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002928	CGG	2	6	231454	231459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_002928	GCG	2	6	232335	232340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_002928	CAT	2	6	232371	232376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_002928	TTA	2	6	232378	232383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002928	ATATT	2	10	232388	232397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_002928	GCC	2	6	233224	233229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_002928	GGCCTG	2	12	233242	233253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002928	GGCG	2	8	233340	233347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
583	NC_002928	GC	3	6	233380	233385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_002928	GC	3	6	233392	233397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_002928	CGG	2	6	233424	233429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_002928	CTG	2	6	233450	233455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002928	GGC	2	6	233456	233461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_002928	GC	3	6	233463	233468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_002928	GCT	2	6	233515	233520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002928	GGC	2	6	233560	233565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002928	GGC	2	6	233569	233574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_002928	GCC	2	6	233617	233622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_002928	GCG	2	6	233625	233630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002928	GTT	2	6	234930	234935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002928	CGGG	2	8	234957	234964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
596	NC_002928	GGC	2	6	235820	235825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_002928	CGG	2	6	235843	235848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_002928	TTC	2	6	235887	235892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_002928	CGC	2	6	235907	235912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_002928	GGAC	2	8	235936	235943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_002928	ACC	2	6	235968	235973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_002928	TGC	2	6	235981	235986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_002928	GC	3	6	236003	236008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_002928	GTC	2	6	236012	236017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_002928	TCAGGT	2	12	236095	236106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
606	NC_002928	CCTTGC	2	12	236143	236154	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
607	NC_002928	GCG	2	6	236169	236174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_002928	GCA	2	6	236191	236196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_002928	ATC	2	6	236202	236207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_002928	CG	3	6	236212	236217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_002928	CCA	2	6	236396	236401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_002928	ATG	2	6	236466	236471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_002928	CAG	2	6	236483	236488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_002928	GCT	2	6	236503	236508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_002928	AGC	2	6	236565	236570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_002928	CCTT	2	8	236580	236587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_002928	GGC	2	6	236588	236593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_002928	GC	3	6	236592	236597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_002928	GCA	2	6	236602	236607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002928	TCT	2	6	236656	236661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_002928	GCC	2	6	236681	236686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_002928	TTCT	2	8	236687	236694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_002928	CGG	3	9	236719	236727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_002928	CAG	2	6	236741	236746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_002928	CCA	2	6	236824	236829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_002928	CG	3	6	236896	236901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_002928	CGC	2	6	236926	236931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_002928	GCC	2	6	236983	236988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_002928	CAG	2	6	237076	237081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_002928	GCC	2	6	237101	237106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_002928	GGCG	2	8	237109	237116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
632	NC_002928	GC	3	6	237132	237137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_002928	GCG	2	6	237143	237148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_002928	GCC	2	6	237155	237160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_002928	CCT	2	6	237196	237201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_002928	GTG	2	6	237204	237209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_002928	GCC	2	6	237278	237283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_002928	TCC	2	6	242104	242109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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772	NC_002928	CTGGA	2	10	292603	292612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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