MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 17548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002928	CCA	2	6	1654281	1654286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_002928	CGTG	2	8	1654287	1654294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_002928	CGG	2	6	1654296	1654301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_002928	CGG	2	6	1654311	1654316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_002928	GCA	2	6	1654323	1654328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_002928	GCGCG	2	10	1654347	1654356	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_002928	GCG	2	6	1654403	1654408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_002928	AT	3	6	1654510	1654515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_002928	GCC	2	6	1654558	1654563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_002928	CTG	3	9	1654603	1654611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_002928	GCC	2	6	1654627	1654632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_002928	CTGG	2	8	1654647	1654654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_002928	TGGCA	2	10	1654666	1654675	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6014	NC_002928	TGG	2	6	1654678	1654683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_002928	TGG	2	6	1654693	1654698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_002928	GCT	2	6	1654700	1654705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_002928	GCT	2	6	1654709	1654714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_002928	CGC	2	6	1654757	1654762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_002928	GC	3	6	1654761	1654766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_002928	TGG	2	6	1654804	1654809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_002928	GC	3	6	1654852	1654857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_002928	GGCC	2	8	1654895	1654902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_002928	CAT	2	6	1654907	1654912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_002928	GCCG	2	8	1654952	1654959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_002928	CCG	2	6	1654977	1654982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_002928	GC	3	6	1655957	1655962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_002928	CTG	2	6	1656028	1656033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_002928	GCT	2	6	1656081	1656086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_002928	GTGCTG	2	12	1656130	1656141	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6030	NC_002928	GCT	3	9	1656147	1656155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_002928	GCC	2	6	1656183	1656188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_002928	TGGC	2	8	1656190	1656197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_002928	CGT	2	6	1656231	1656236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_002928	CCG	2	6	1656277	1656282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_002928	CTG	3	9	1656289	1656297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_002928	GGT	2	6	1656363	1656368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_002928	GCT	2	6	1656390	1656395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_002928	GGC	2	6	1656400	1656405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_002928	GCG	2	6	1656438	1656443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_002928	GCC	2	6	1656487	1656492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_002928	ATG	2	6	1656613	1656618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_002928	CATGAT	2	12	1656624	1656635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6043	NC_002928	CGAGCG	2	12	1656657	1656668	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_002928	CTG	2	6	1656697	1656702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_002928	TGG	2	6	1656715	1656720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_002928	GC	4	8	1656740	1656747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_002928	GCCG	2	8	1656759	1656766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_002928	CTG	2	6	1656773	1656778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_002928	CGC	2	6	1656826	1656831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_002928	TGC	2	6	1656843	1656848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_002928	GCT	2	6	1656874	1656879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_002928	GCG	2	6	1656885	1656890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_002928	CGGC	2	8	1656898	1656905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_002928	GCG	2	6	1656909	1656914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_002928	TTG	2	6	1656929	1656934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_002928	GC	3	6	1656991	1656996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_002928	CGG	2	6	1657012	1657017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_002928	GCG	2	6	1657041	1657046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_002928	CG	3	6	1657061	1657066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_002928	TGG	2	6	1657086	1657091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_002928	GCGG	2	8	1657093	1657100	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_002928	GCCG	2	8	1657127	1657134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_002928	GC	3	6	1657627	1657632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_002928	GCG	2	6	1658475	1658480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_002928	TTACGT	2	12	1658551	1658562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6066	NC_002928	GCC	2	6	1658580	1658585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_002928	GC	3	6	1660971	1660976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_002928	GGC	2	6	1661926	1661931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_002928	CGGCG	2	10	1662396	1662405	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6070	NC_002928	GC	3	6	1662417	1662422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_002928	GCC	2	6	1662431	1662436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_002928	ACGCGC	2	12	1664195	1664206	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_002928	CG	3	6	1664221	1664226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6074	NC_002928	GAT	2	6	1664243	1664248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_002928	GGC	2	6	1664255	1664260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_002928	GGGC	2	8	1664300	1664307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_002928	GCC	2	6	1664310	1664315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_002928	ATT	2	6	1667885	1667890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_002928	CTC	2	6	1668812	1668817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_002928	GCC	2	6	1668831	1668836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_002928	T	7	7	1668850	1668856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_002928	GAAT	2	8	1668891	1668898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_002928	A	6	6	1668903	1668908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_002928	AAT	2	6	1668921	1668926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_002928	ATCC	2	8	1669712	1669719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6086	NC_002928	TTC	2	6	1669728	1669733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_002928	CAT	2	6	1669765	1669770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_002928	GAC	2	6	1669771	1669776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_002928	CGC	2	6	1669778	1669783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_002928	CTG	2	6	1669787	1669792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_002928	CCG	2	6	1669794	1669799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_002928	CCCTGA	2	12	1669800	1669811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_002928	CCTGG	2	10	1669813	1669822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6094	NC_002928	GGCGCC	2	12	1669823	1669834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_002928	CGACG	2	10	1669867	1669876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6096	NC_002928	ATCGAC	2	12	1669976	1669987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_002928	GGCC	2	8	1670014	1670021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_002928	CCG	2	6	1670057	1670062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_002928	GTG	2	6	1670074	1670079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_002928	GCGG	2	8	1670101	1670108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_002928	TGG	2	6	1670111	1670116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_002928	AAG	2	6	1670125	1670130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_002928	GAA	2	6	1670250	1670255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_002928	CGG	2	6	1670297	1670302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_002928	CGG	2	6	1670315	1670320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_002928	GAGC	2	8	1670361	1670368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_002928	CAC	2	6	1670373	1670378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_002928	AAGTCC	2	12	1670404	1670415	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_002928	AAG	2	6	1670446	1670451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_002928	CAA	2	6	1670484	1670489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_002928	ATG	2	6	1670511	1670516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_002928	TGC	2	6	1670554	1670559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_002928	GCG	2	6	1670560	1670565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_002928	GTC	2	6	1670568	1670573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_002928	GC	3	6	1670593	1670598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_002928	TGC	2	6	1670599	1670604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_002928	CTG	2	6	1670622	1670627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_002928	GCC	2	6	1670638	1670643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_002928	CGC	2	6	1670657	1670662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_002928	CTG	2	6	1670690	1670695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_002928	CGC	2	6	1670709	1670714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_002928	TTC	2	6	1670738	1670743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_002928	GCG	2	6	1670784	1670789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_002928	GCG	2	6	1670838	1670843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_002928	GTCG	2	8	1670851	1670858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_002928	CGCT	2	8	1670882	1670889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_002928	CAT	3	9	1670917	1670925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_002928	CCG	2	6	1670954	1670959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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