MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 17548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002928	GTG	2	6	1435227	1435232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_002928	AGC	2	6	1435285	1435290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_002928	GCG	2	6	1435313	1435318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_002928	GCG	2	6	1435328	1435333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_002928	TCG	2	6	1435360	1435365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_002928	GGC	2	6	1435391	1435396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_002928	AAG	2	6	1435398	1435403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_002928	CAA	2	6	1435487	1435492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_002928	CGC	2	6	1435507	1435512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_002928	CGG	2	6	1435554	1435559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_002928	CTG	2	6	1435570	1435575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_002928	CGG	2	6	1435600	1435605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_002928	CTG	2	6	1435616	1435621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_002928	CCT	2	6	1435895	1435900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_002928	GCT	2	6	1435958	1435963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_002928	AGC	2	6	1435973	1435978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_002928	GCC	2	6	1437402	1437407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_002928	A	6	6	1437416	1437421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_002928	CGG	2	6	1437445	1437450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_002928	TCT	2	6	1437451	1437456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_002928	CGGC	2	8	1438390	1438397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_002928	GC	3	6	1438396	1438401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_002928	CG	4	8	1440107	1440114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_002928	CTC	2	6	1440834	1440839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_002928	GCGCG	2	10	1440844	1440853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5026	NC_002928	CGC	2	6	1440925	1440930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_002928	GCC	2	6	1440938	1440943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_002928	C	6	6	1440953	1440958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5029	NC_002928	CGGG	2	8	1440972	1440979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_002928	G	6	6	1440977	1440982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_002928	GC	3	6	1441065	1441070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_002928	CTGC	2	8	1441588	1441595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_002928	GCG	2	6	1441596	1441601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_002928	GC	3	6	1443309	1443314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_002928	GTG	2	6	1443332	1443337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_002928	GCG	2	6	1445229	1445234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_002928	CGG	2	6	1445238	1445243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_002928	GC	3	6	1445244	1445249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_002928	GCC	2	6	1446062	1446067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_002928	TCC	2	6	1448340	1448345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_002928	GTGGG	2	10	1448364	1448373	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_002928	TCA	2	6	1448470	1448475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_002928	G	6	6	1450853	1450858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_002928	CGG	3	9	1454176	1454184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5048	NC_002928	CGGT	2	8	1454259	1454266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_002928	GC	3	6	1454280	1454285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_002928	GCG	3	9	1454292	1454300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_002928	CTG	2	6	1454360	1454365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5053	NC_002928	GCG	2	6	1454414	1454419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_002928	CAG	2	6	1454555	1454560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_002928	TTCC	2	8	1454628	1454635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_002928	GC	3	6	1454647	1454652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_002928	GGC	2	6	1454656	1454661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_002928	GC	3	6	1454660	1454665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_002928	GGC	2	6	1454699	1454704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_002928	TGC	2	6	1454714	1454719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_002928	CTTG	2	8	1454726	1454733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_002928	CGG	2	6	1454754	1454759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_002928	GC	4	8	1455188	1455195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_002928	CG	4	8	1455196	1455203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_002928	GCCGG	2	10	1455207	1455216	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5066	NC_002928	CGGCG	2	10	1455222	1455231	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5067	NC_002928	GAT	2	6	1455241	1455246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_002928	GCG	2	6	1456215	1456220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_002928	CGG	2	6	1458432	1458437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_002928	CG	3	6	1458464	1458469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_002928	GCCGG	2	10	1458480	1458489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5073	NC_002928	GCG	2	6	1458503	1458508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_002928	G	6	6	1458525	1458530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_002928	GC	3	6	1459193	1459198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_002928	CGG	2	6	1459256	1459261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_002928	GCAA	2	8	1459328	1459335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_002928	GGC	2	6	1460759	1460764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_002928	CG	3	6	1460765	1460770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_002928	CAAC	2	8	1460797	1460804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_002928	GGCG	2	8	1460820	1460827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_002928	CAG	2	6	1460845	1460850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5087	NC_002928	CAGGG	2	10	1461208	1461217	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5089	NC_002928	GCG	2	6	1462478	1462483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_002928	GTC	2	6	1462521	1462526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5094	NC_002928	GCG	2	6	1462612	1462617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_002928	TCG	2	6	1462762	1462767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5103	NC_002928	TGG	2	6	1462894	1462899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_002928	GCG	3	9	1463060	1463068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_002928	CAG	2	6	1463070	1463075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_002928	GCG	2	6	1463080	1463085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_002928	CAC	2	6	1463100	1463105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5114	NC_002928	AGCGC	2	10	1463120	1463129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5115	NC_002928	CAG	2	6	1463187	1463192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_002928	CGCA	2	8	1463194	1463201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_002928	TGA	2	6	1463231	1463236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_002928	GC	3	6	1463244	1463249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_002928	CGC	2	6	1463261	1463266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_002928	GC	3	6	1463265	1463270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_002928	GCC	2	6	1463272	1463277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5124	NC_002928	AGGT	2	8	1463434	1463441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_002928	GCGCG	2	10	1463448	1463457	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5126	NC_002928	CG	3	6	1463482	1463487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_002928	CGC	2	6	1463505	1463510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_002928	CG	4	8	1463514	1463521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_002928	CG	3	6	1463532	1463537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_002928	CGG	2	6	1463588	1463593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_002928	GGC	2	6	1463669	1463674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_002928	GGC	2	6	1502273	1502278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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