MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 11005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002927	TGGAT	2	10	802744	802753	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_002927	GATA	2	8	802761	802768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_002927	TATT	2	8	802777	802784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_002927	GCG	2	6	802811	802816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_002927	CGG	2	6	802817	802822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_002927	CGC	2	6	802823	802828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_002927	GCC	2	6	802829	802834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_002927	GCG	2	6	803680	803685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_002927	GCC	2	6	803690	803695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_002927	CGT	2	6	803720	803725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_002927	CCG	2	6	803732	803737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_002927	AAC	2	6	806157	806162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_002927	TGT	2	6	807152	807157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_002927	GTG	2	6	807242	807247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_002927	GTTT	2	8	810944	810951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_002927	AATT	2	8	810980	810987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_002927	GCC	2	6	820207	820212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_002927	CGT	2	6	820216	820221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_002927	CGG	3	9	820242	820250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_002927	GTC	2	6	825596	825601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_002927	GGC	2	6	828009	828014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_002927	G	6	6	828837	828842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_002927	TGCCG	2	10	829896	829905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1524	NC_002927	GC	3	6	829906	829911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_002927	GC	3	6	829916	829921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1531	NC_002927	AGG	2	6	830108	830113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_002927	CG	3	6	830961	830966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_002927	TG	3	6	830971	830976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_002927	CGG	2	6	830977	830982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_002927	CGT	2	6	830995	831000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1541	NC_002927	CGC	2	6	839263	839268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1544	NC_002927	ACC	2	6	839351	839356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_002927	GAA	2	6	839371	839376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1553	NC_002927	TGCC	2	8	851881	851888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_002927	CG	3	6	851889	851894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_002927	GC	3	6	851895	851900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_002927	CG	3	6	853193	853198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_002927	TG	3	6	853212	853217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_002927	AAT	2	6	853261	853266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_002927	GGCGC	2	10	853298	853307	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_002927	CGC	2	6	853969	853974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_002927	GCC	2	6	860989	860994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1564	NC_002927	GAC	2	6	862232	862237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_002927	GAC	2	6	862260	862265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_002927	GC	3	6	863452	863457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_002927	CG	3	6	863484	863489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_002927	GTCC	2	8	863505	863512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_002927	CGG	2	6	863515	863520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_002927	GCT	2	6	863524	863529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_002927	CGC	2	6	863548	863553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_002927	GCG	2	6	863571	863576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_002927	GCGG	2	8	863591	863598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1589	NC_002927	CG	3	6	872548	872553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_002927	GCA	2	6	872560	872565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1592	NC_002927	AT	3	6	872603	872608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_002927	CGTCG	2	10	874291	874300	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1602	NC_002927	CTA	2	6	874865	874870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_002927	TAGA	2	8	874872	874879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_002927	T	6	6	874902	874907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_002927	CCG	2	6	874914	874919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_002927	GCC	2	6	874923	874928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1608	NC_002927	AGC	2	6	875380	875385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1610	NC_002927	GCCG	2	8	875409	875416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_002927	CG	3	6	875791	875796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_002927	CAGGC	2	10	878489	878498	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1613	NC_002927	GC	3	6	880710	880715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1616	NC_002927	CGG	2	6	881586	881591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_002927	CG	3	6	881607	881612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_002927	CATG	2	8	881652	881659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_002927	AT	4	8	881673	881680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_002927	CGTG	2	8	881711	881718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_002927	GCC	2	6	881719	881724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_002927	GCC	2	6	881738	881743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_002927	G	6	6	881777	881782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_002927	CGCGG	2	10	882374	882383	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1626	NC_002927	CG	3	6	882392	882397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_002927	GCC	2	6	882438	882443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1629	NC_002927	TTCG	2	8	883319	883326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1634	NC_002927	CG	3	6	886245	886250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_002927	G	6	6	886287	886292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_002927	G	6	6	886310	886315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_002927	TGG	2	6	1036246	1036251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1951	NC_002927	CGC	2	6	1037534	1037539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1952	NC_002927	GC	3	6	1037588	1037593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1953	NC_002927	GTC	2	6	1037640	1037645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_002927	GCC	2	6	1039346	1039351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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