MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 11005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002927	ATTT	2	8	515426	515433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002927	AGT	2	6	515434	515439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002927	CCT	2	6	518447	518452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_002927	AAG	2	6	518476	518481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002927	GGT	2	6	518518	518523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002927	CGG	2	6	521713	521718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_002927	CTT	2	6	521727	521732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_002927	CGTT	2	8	521778	521785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_002927	AGT	2	6	521833	521838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002927	CGG	2	6	524770	524775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_002927	GCA	2	6	524783	524788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_002927	TCGGTA	2	12	524815	524826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1013	NC_002927	TCA	2	6	524888	524893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002927	CAA	2	6	524910	524915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002927	AGT	2	6	524925	524930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002927	GTT	2	6	525003	525008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002927	AAAT	2	8	525111	525118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002927	AG	3	6	525187	525192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002927	GCAT	2	8	525315	525322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_002927	AT	3	6	528873	528878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002927	TC	3	6	528880	528885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_002927	AGC	2	6	528907	528912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_002927	ATC	2	6	528947	528952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002927	TTC	2	6	529760	529765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_002927	ACC	2	6	529774	529779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_002927	T	6	6	529834	529839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002927	TCT	2	6	530703	530708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_002927	AGA	2	6	530725	530730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002927	GCG	2	6	530774	530779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_002927	CAC	2	6	530812	530817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_002927	GGAA	2	8	530857	530864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002927	T	6	6	530962	530967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002927	GCG	2	6	532913	532918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002927	CG	3	6	532924	532929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_002927	ACG	2	6	532969	532974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_002927	GAGG	2	8	533005	533012	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_002927	GGA	2	6	533049	533054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002927	GGA	2	6	533092	533097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002927	GGA	2	6	533135	533140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002927	GTCG	2	8	533141	533148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_002927	TTG	2	6	534431	534436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_002927	TCC	2	6	534471	534476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_002927	GCG	2	6	534492	534497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_002927	TGA	2	6	535590	535595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002927	CGCC	2	8	535635	535642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1046	NC_002927	GGC	2	6	535643	535648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_002927	GGC	2	6	535661	535666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_002927	TCAA	2	8	535672	535679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_002927	GC	3	6	537127	537132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_002927	A	7	7	537136	537142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_002927	ATCG	2	8	537167	537174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_002927	GCC	2	6	537191	537196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_002927	CGC	2	6	537803	537808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_002927	GGC	2	6	537823	537828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_002927	CGGC	2	8	540757	540764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_002927	TCCA	2	8	540769	540776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_002927	CG	3	6	542098	542103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_002927	GC	3	6	542120	542125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_002927	CGA	2	6	542138	542143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_002927	CG	3	6	542183	542188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_002927	CG	3	6	542264	542269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_002927	CGT	2	6	542279	542284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_002927	CG	3	6	542322	542327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_002927	CGA	2	6	542342	542347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_002927	CG	3	6	542404	542409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_002927	CGA	2	6	542420	542425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_002927	GCC	2	6	542430	542435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_002927	GCGCC	2	10	542441	542450	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1069	NC_002927	CGTGC	2	10	542462	542471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_002927	CGA	2	6	542525	542530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_002927	GC	3	6	542544	542549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_002927	ACC	2	6	542592	542597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_002927	CCCA	2	8	542610	542617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_002927	CG	3	6	542621	542626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_002927	GC	3	6	542645	542650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_002927	CG	3	6	542689	542694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_002927	GCC	2	6	542718	542723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_002927	CGC	3	9	542750	542758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_002927	CGG	2	6	542759	542764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_002927	GGC	2	6	542769	542774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_002927	GAA	2	6	542814	542819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_002927	GCG	2	6	542909	542914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_002927	GGC	2	6	542936	542941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_002927	CCAC	2	8	542956	542963	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1085	NC_002927	GCC	2	6	542966	542971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_002927	CTGG	2	8	542975	542982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_002927	GCC	2	6	542997	543002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_002927	CGG	2	6	543006	543011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_002927	AACA	2	8	543034	543041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_002927	CCGC	3	12	544047	544058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1091	NC_002927	CG	3	6	544059	544064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_002927	GC	3	6	544066	544071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1094	NC_002927	CGG	2	6	544120	544125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_002927	CGG	2	6	544157	544162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_002927	CATC	2	8	544219	544226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_002927	TTTG	2	8	544278	544285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_002927	TG	3	6	544306	544311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_002927	CT	3	6	544721	544726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_002927	CCT	2	6	544746	544751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_002927	T	6	6	544856	544861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002927	TCA	2	6	545705	545710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_002927	GCG	2	6	548688	548693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_002927	AATTT	2	10	549246	549255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_002927	T	6	6	551681	551686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002927	A	6	6	551699	551704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_002927	TAA	2	6	551718	551723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002927	GGCC	2	8	552649	552656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_002927	TCC	2	6	553925	553930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_002927	GCA	2	6	553971	553976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_002927	CG	3	6	554516	554521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_002927	AG	4	8	554523	554530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002927	CCT	2	6	556170	556175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_002927	ATT	2	6	556213	556218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002927	TGC	2	6	556461	556466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_002927	AAG	2	6	557525	557530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002927	CCT	2	6	557556	557561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_002927	CAAT	2	8	557572	557579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_002927	GC	3	6	560736	560741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_002927	GCG	2	6	561515	561520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_002927	GC	4	8	561533	561540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_002927	CGGG	2	8	562570	562577	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_002927	ATT	2	6	562664	562669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_002927	AAT	2	6	562705	562710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002927	ATA	2	6	562713	562718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_002927	AAG	2	6	562721	562726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_002927	TCC	2	6	562738	562743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_002927	GGC	2	6	562764	562769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002927	GC	4	8	562826	562833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_002927	CGC	3	9	562860	562868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_002927	GC	3	6	562867	562872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_002927	ATG	2	6	562887	562892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002927	ATTG	2	8	562894	562901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_002927	GGCA	2	8	562925	562932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_002927	AAT	2	6	562949	562954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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