MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 11005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002927	C	6	6	292823	292828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
502	NC_002927	TGAGTG	2	12	292888	292899	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_002927	A	6	6	292924	292929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002927	ATG	2	6	292940	292945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_002927	TCT	2	6	292972	292977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_002927	CGG	2	6	294349	294354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_002927	GC	3	6	295442	295447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_002927	CGG	2	6	295451	295456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_002927	GCC	2	6	295476	295481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_002927	TGAA	2	8	299328	299335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_002927	GGC	2	6	299349	299354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_002927	GCG	2	6	299355	299360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_002927	CCACGG	2	12	300024	300035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
514	NC_002927	CGA	2	6	300036	300041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_002927	GTT	2	6	300049	300054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_002927	G	6	6	300096	300101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
517	NC_002927	CGGCC	2	10	300122	300131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
518	NC_002927	GGGC	2	8	300145	300152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
519	NC_002927	CGG	2	6	304834	304839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_002927	GCC	2	6	304845	304850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_002927	CGGCG	2	10	304878	304887	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
522	NC_002927	GC	3	6	304888	304893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_002927	GAA	2	6	304913	304918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_002927	CG	4	8	307086	307093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_002927	GCGG	2	8	307104	307111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
526	NC_002927	TGCCG	2	10	307124	307133	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
527	NC_002927	AAG	2	6	309109	309114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002927	GGAT	2	8	309131	309138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_002927	CT	3	6	309212	309217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_002927	T	6	6	309344	309349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002927	CT	3	6	309384	309389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_002927	GAA	2	6	309397	309402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002927	GCCG	2	8	309986	309993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_002927	CGGC	3	12	309998	310009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_002927	GGC	2	6	310063	310068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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537	NC_002927	GC	4	8	313287	313294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_002927	ATT	2	6	313316	313321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_002927	TTC	2	6	313761	313766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002927	CAGG	2	8	313848	313855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_002927	GCG	2	6	313859	313864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_002927	TGG	2	6	314362	314367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_002927	TTA	2	6	314374	314379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002927	TGC	2	6	315190	315195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_002927	GCC	2	6	315201	315206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_002927	GC	3	6	315242	315247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_002927	GTTG	2	8	315322	315329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_002927	CG	3	6	316522	316527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_002927	GCG	2	6	316532	316537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002927	TGG	2	6	317700	317705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002927	GGCG	2	8	317727	317734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
552	NC_002927	CGG	2	6	317747	317752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_002927	AT	3	6	318452	318457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002927	GTGCG	2	10	318581	318590	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
555	NC_002927	CGA	2	6	318625	318630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_002927	GCG	2	6	318686	318691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_002927	GCG	2	6	318702	318707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_002927	CG	3	6	318711	318716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_002927	GCG	2	6	318739	318744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002927	CGC	2	6	318751	318756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_002927	GCG	2	6	318771	318776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_002927	CG	3	6	318796	318801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_002927	TTC	2	6	318803	318808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_002927	GGC	2	6	318811	318816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_002927	CGG	2	6	320027	320032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_002927	TGCG	2	8	320075	320082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
567	NC_002927	GCC	2	6	320101	320106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_002927	GAA	2	6	321121	321126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_002927	A	6	6	321125	321130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002927	GTG	2	6	321321	321326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002927	T	6	6	321332	321337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002927	CGC	2	6	321345	321350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_002927	CGGCG	2	10	321356	321365	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
574	NC_002927	ATG	2	6	322306	322311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_002927	GC	3	6	331067	331072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_002927	GCC	2	6	331080	331085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_002927	CAT	2	6	331090	331095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_002927	TTC	2	6	331252	331257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_002927	GCC	2	6	343571	343576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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603	NC_002927	GC	3	6	351930	351935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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605	NC_002927	TGGCG	2	10	351969	351978	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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610	NC_002927	CG	3	6	353921	353926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_002927	CGC	2	6	353930	353935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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614	NC_002927	GC	3	6	358436	358441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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618	NC_002927	TG	3	6	363176	363181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002927	TA	3	6	363206	363211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_002927	GCGG	2	8	363277	363284	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
621	NC_002927	GCCC	2	8	363300	363307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
622	NC_002927	GGC	2	6	363335	363340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_002927	CG	3	6	364313	364318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_002927	CGGC	2	8	364323	364330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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638	NC_002927	A	6	6	370786	370791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_002927	G	11	11	370798	370808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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