MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 11005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002927	GGC	2	6	2606071	2606076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_002927	ATA	2	6	2607831	2607836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_002927	GGC	2	6	2607851	2607856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_002927	GC	3	6	2607868	2607873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_002927	TCA	2	6	2607950	2607955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_002927	AGCG	2	8	2607986	2607993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_002927	CCA	2	6	2608021	2608026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_002927	CA	3	6	2608032	2608037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_002927	GGA	2	6	2608038	2608043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_002927	GC	3	6	2610718	2610723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_002927	CTC	2	6	2611739	2611744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_002927	TCC	2	6	2613366	2613371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_002927	GGCA	2	8	2613381	2613388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_002927	TTG	2	6	2616288	2616293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_002927	GCAT	2	8	2616321	2616328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_002927	TCA	2	6	2616333	2616338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_002927	GCG	2	6	2617164	2617169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_002927	CGCC	2	8	2617203	2617210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5519	NC_002927	CAG	3	9	2617983	2617991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_002927	GGC	2	6	2617995	2618000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_002927	GCC	2	6	2618007	2618012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_002927	TCA	2	6	2618033	2618038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_002927	TTC	2	6	2618050	2618055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_002927	GC	4	8	2618095	2618102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_002927	GGC	2	6	2618111	2618116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_002927	GC	3	6	2618115	2618120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_002927	GCC	2	6	2618257	2618262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_002927	GCGCC	2	10	2618283	2618292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5529	NC_002927	CGGC	2	8	2618294	2618301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_002927	GCG	2	6	2618759	2618764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_002927	CG	3	6	2618820	2618825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_002927	GCC	2	6	2618857	2618862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_002927	GCAC	2	8	2621046	2621053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_002927	TCG	2	6	2621063	2621068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_002927	GC	3	6	2622699	2622704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_002927	GAG	2	6	2622716	2622721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_002927	CGG	2	6	2624240	2624245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_002927	CGGG	2	8	2624253	2624260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_002927	G	6	6	2624274	2624279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_002927	GGC	2	6	2624303	2624308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_002927	GCG	2	6	2624313	2624318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_002927	CGG	2	6	2624351	2624356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_002927	CG	3	6	2624470	2624475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_002927	ATT	2	6	2624505	2624510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_002927	GGC	2	6	2624631	2624636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_002927	GCA	3	9	2624709	2624717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_002927	AAAG	2	8	2624718	2624725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_002927	T	8	8	2626290	2626297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_002927	GGCC	2	8	2626811	2626818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_002927	CG	3	6	2626840	2626845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_002927	CGGG	2	8	2626851	2626858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_002927	AGA	2	6	2626880	2626885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_002927	T	6	6	2627590	2627595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_002927	T	6	6	2628551	2628556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_002927	TACG	2	8	2628569	2628576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_002927	CGG	2	6	2628593	2628598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_002927	CGC	2	6	2629190	2629195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_002927	GCCGC	3	15	2629191	2629205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5559	NC_002927	GCC	2	6	2629228	2629233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_002927	GC	3	6	2629754	2629759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_002927	GGCGC	2	10	2630629	2630638	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_002927	CGG	2	6	2632550	2632555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_002927	CGC	2	6	2632576	2632581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_002927	C	6	6	2632587	2632592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5565	NC_002927	G	7	7	2634420	2634426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_002927	GCCGC	2	10	2636150	2636159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5567	NC_002927	CGC	2	6	2636171	2636176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_002927	GC	4	8	2636260	2636267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_002927	GC	4	8	2636289	2636296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_002927	GC	4	8	2636303	2636310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_002927	TGGC	2	8	2636336	2636343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_002927	GCC	2	6	2636350	2636355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_002927	GAT	2	6	2636552	2636557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5575	NC_002927	TG	3	6	2636652	2636657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_002927	CG	3	6	2636675	2636680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_002927	GCG	3	9	2636678	2636686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_002927	TCG	2	6	2640231	2640236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_002927	A	6	6	2642574	2642579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_002927	ATA	2	6	2642636	2642641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_002927	CGGT	2	8	2642649	2642656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_002927	GTT	2	6	2642660	2642665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_002927	TG	3	6	2642789	2642794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_002927	TGA	2	6	2642806	2642811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_002927	G	6	6	2642857	2642862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_002927	GAT	2	6	2644919	2644924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_002927	GGTAC	2	10	2645207	2645216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5590	NC_002927	GTT	2	6	2645243	2645248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_002927	TGA	2	6	2645251	2645256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_002927	GCCTG	2	10	2645438	2645447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5594	NC_002927	ATGA	2	8	2645448	2645455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_002927	GCA	2	6	2645566	2645571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_002927	AGGCC	2	10	2645674	2645683	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5599	NC_002927	GCG	2	6	2645768	2645773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_002927	GCCT	2	8	2645792	2645799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_002927	GCC	2	6	2645809	2645814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_002927	ACG	2	6	2645846	2645851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5604	NC_002927	TAC	2	6	2646359	2646364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5608	NC_002927	TAT	2	6	2646464	2646469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_002927	GTA	2	6	2646473	2646478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5611	NC_002927	ACC	2	6	2648453	2648458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_002927	A	6	6	2648459	2648464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5619	NC_002927	A	6	6	2648797	2648802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_002927	TGG	2	6	2648847	2648852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_002927	GGA	3	9	2648856	2648864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_002927	CGGC	2	8	2648966	2648973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_002927	GCC	2	6	2648998	2649003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5628	NC_002927	GCG	2	6	2653570	2653575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_002927	CAGCC	2	10	2653622	2653631	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5630	NC_002927	GCGG	2	8	2655402	2655409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5631	NC_002927	GCG	2	6	2655416	2655421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5633	NC_002927	CGG	3	9	2655436	2655444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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