MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 11005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002927	TGT	2	6	2153876	2153881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_002927	C	6	6	2153952	2153957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4503	NC_002927	TTTC	2	8	2153981	2153988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_002927	GTAA	2	8	2154033	2154040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_002927	GCC	2	6	2154072	2154077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_002927	CGC	2	6	2154412	2154417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_002927	GGT	2	6	2154476	2154481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_002927	CCG	2	6	2167971	2167976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_002927	GGCA	2	8	2168007	2168014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_002927	GTTG	2	8	2171923	2171930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_002927	GGA	2	6	2172116	2172121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_002927	CGG	2	6	2173283	2173288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_002927	C	7	7	2173294	2173300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4514	NC_002927	GCGCC	2	10	2173305	2173314	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4515	NC_002927	GCCGC	2	10	2173328	2173337	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4516	NC_002927	CG	3	6	2173348	2173353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_002927	GAAC	2	8	2173407	2173414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_002927	CGCA	2	8	2176971	2176978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_002927	TTC	2	6	2176989	2176994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_002927	CGTA	2	8	2178344	2178351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_002927	TTCG	2	8	2179025	2179032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_002927	T	9	9	2179058	2179066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_002927	GGGAG	2	10	2179067	2179076	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_002927	TGC	2	6	2179084	2179089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_002927	CGTA	2	8	2179108	2179115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_002927	AT	3	6	2179142	2179147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_002927	GCA	2	6	2179200	2179205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_002927	T	6	6	2179207	2179212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_002927	CCT	2	6	2179229	2179234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_002927	CAA	2	6	2182234	2182239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_002927	TGA	2	6	2182248	2182253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_002927	GTT	2	6	2182258	2182263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_002927	T	6	6	2183947	2183952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_002927	CGGCCC	2	12	2183961	2183972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_002927	GGC	2	6	2183978	2183983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_002927	GC	3	6	2183999	2184004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_002927	GCC	2	6	2184067	2184072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_002927	T	6	6	2184093	2184098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_002927	GCT	2	6	2184102	2184107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_002927	TGC	2	6	2184137	2184142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_002927	GTT	2	6	2184156	2184161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_002927	GC	3	6	2184176	2184181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_002927	GCCG	2	8	2184233	2184240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_002927	CG	3	6	2184251	2184256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_002927	GAA	2	6	2184335	2184340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_002927	GGC	2	6	2184355	2184360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_002927	CCGTT	2	10	2184408	2184417	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4548	NC_002927	GCT	2	6	2184440	2184445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_002927	GGC	2	6	2184494	2184499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_002927	T	8	8	2184516	2184523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_002927	GC	3	6	2184906	2184911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_002927	GGGAC	2	10	2186486	2186495	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4553	NC_002927	T	6	6	2186587	2186592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_002927	GCC	2	6	2186633	2186638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_002927	AGC	2	6	2186692	2186697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_002927	ATC	2	6	2186802	2186807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_002927	TACA	2	8	2187386	2187393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_002927	CGC	2	6	2191759	2191764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_002927	TTC	2	6	2191769	2191774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_002927	CGG	2	6	2191781	2191786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_002927	GTGC	2	8	2191853	2191860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_002927	CCG	2	6	2191958	2191963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_002927	AGT	2	6	2191972	2191977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_002927	ATCAC	2	10	2191994	2192003	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4565	NC_002927	CGC	2	6	2192060	2192065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_002927	T	6	6	2193248	2193253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_002927	AAGGG	2	10	2193279	2193288	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_002927	CG	3	6	2193342	2193347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_002927	GC	3	6	2194039	2194044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_002927	GC	3	6	2194053	2194058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_002927	G	6	6	2194081	2194086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_002927	GAT	2	6	2194126	2194131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4574	NC_002927	CGG	2	6	2194194	2194199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4579	NC_002927	GTT	2	6	2194315	2194320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4581	NC_002927	AGC	2	6	2194415	2194420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_002927	GC	3	6	2194433	2194438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_002927	GCA	2	6	2194453	2194458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_002927	GAT	2	6	2194462	2194467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_002927	GAG	2	6	2194470	2194475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_002927	A	6	6	2194478	2194483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_002927	GCG	2	6	2194515	2194520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_002927	TCG	2	6	2196227	2196232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_002927	CGC	2	6	2198168	2198173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4593	NC_002927	GCGG	2	8	2199265	2199272	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_002927	TCGC	2	8	2200894	2200901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_002927	CGGGG	2	10	2200963	2200972	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4596	NC_002927	GCC	2	6	2200977	2200982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_002927	GGC	2	6	2200991	2200996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4599	NC_002927	CG	3	6	2201042	2201047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_002927	TGG	2	6	2201085	2201090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_002927	GC	3	6	2201134	2201139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_002927	GGC	3	9	2201143	2201151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_002927	GC	3	6	2201185	2201190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_002927	GCTG	2	8	2201194	2201201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4608	NC_002927	TCGCAG	2	12	2201369	2201380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_002927	GC	3	6	2201385	2201390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_002927	GCG	2	6	2201396	2201401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_002927	CTT	2	6	2201405	2201410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_002927	AGG	2	6	2201465	2201470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4616	NC_002927	GC	4	8	2202736	2202743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_002927	TGCT	2	8	2202761	2202768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_002927	CGC	2	6	2202779	2202784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4620	NC_002927	GGC	2	6	2203002	2203007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_002927	AGCC	2	8	2203010	2203017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_002927	GCC	2	6	2203030	2203035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_002927	GGC	2	6	2203055	2203060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_002927	TCCG	2	8	2203088	2203095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_002927	TA	3	6	2203994	2203999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_002927	A	6	6	2204003	2204008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_002927	CGT	2	6	2204016	2204021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_002927	T	6	6	2204021	2204026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_002927	AAT	2	6	2204033	2204038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_002927	TCC	2	6	2204063	2204068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_002927	GCC	2	6	2204074	2204079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4633	NC_002927	GACAC	2	10	2206385	2206394	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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