MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002528	AAAGA	2	10	81	90	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002528	ATATA	2	10	14086	14095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002528	ATTAA	2	10	18311	18320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002528	TTTAT	2	10	20369	20378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002528	TATTT	2	10	20681	20690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002528	TACTT	2	10	20917	20926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_002528	ATTTT	2	10	23582	23591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002528	TTTTA	2	10	30719	30728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002528	TTGTA	2	10	30868	30877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002528	TGATA	2	10	30941	30950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002528	TATAA	2	10	33489	33498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002528	ATTTT	2	10	44789	44798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002528	TAAAA	2	10	48386	48395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002528	ATTAT	2	10	48893	48902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002528	TGTAA	2	10	52231	52240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002528	TTTAT	2	10	58908	58917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002528	AGAAT	2	10	66236	66245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002528	ATTTT	2	10	68361	68370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002528	GCATG	2	10	76377	76386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002528	GATAT	2	10	81735	81744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002528	TTAAA	2	10	87594	87603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002528	AATAT	2	10	87705	87714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002528	TAATA	2	10	87737	87746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002528	AATAT	2	10	91529	91538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002528	CCATG	2	10	93142	93151	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_002528	AATAT	2	10	101424	101433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002528	AATTA	2	10	101799	101808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002528	TAAAT	2	10	103224	103233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002528	TATTT	2	10	103915	103924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002528	TTTTA	2	10	111496	111505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002528	TAATT	2	10	116991	117000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002528	ATATA	2	10	117137	117146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002528	TTGTA	2	10	127661	127670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002528	TATAA	2	10	127795	127804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002528	TTATT	2	10	133222	133231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002528	AAAAT	2	10	179673	179682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002528	AATTT	2	10	180451	180460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002528	ATTAT	2	10	181851	181860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002528	TTATT	2	10	201227	201236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002528	ACTTT	2	10	202935	202944	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_002528	ATATA	2	10	205170	205179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002528	TAATT	2	10	211899	211908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002528	ATTTT	2	10	212228	212237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002528	TAATA	2	10	212283	212292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002528	TTATT	2	10	215231	215240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002528	TAATC	2	10	223775	223784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002528	TCTTT	2	10	229236	229245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_002528	GTATT	2	10	235396	235405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002528	TGATT	2	10	236155	236164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002528	TAAAA	2	10	246995	247004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002528	ATGTT	2	10	250672	250681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002528	GGAAA	2	10	251425	251434	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002528	AGATT	2	10	252122	252131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002528	TTAAT	2	10	256334	256343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002528	TAAAA	2	10	258001	258010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002528	TAAAA	2	10	266364	266373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002528	AATTT	2	10	268269	268278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002528	ATTTT	2	10	276562	276571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002528	ACATG	2	10	276867	276876	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_002528	ATAAA	2	10	277829	277838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002528	AAAAT	2	10	279268	279277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002528	TTTTA	2	10	280333	280342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002528	TAAAT	2	10	280362	280371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002528	ATTAG	2	10	283504	283513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002528	ATGTA	2	10	295949	295958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002528	AATTT	2	10	297407	297416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002528	ATAAA	2	10	298190	298199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002528	TTTAT	2	10	306461	306470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002528	ATAAA	2	10	312043	312052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002528	ATAAA	2	10	314257	314266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002528	TAAAA	2	10	318975	318984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002528	TTAAA	2	10	325125	325134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002528	ATATT	2	10	325148	325157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002528	ATCGA	2	10	325472	325481	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002528	TAAAA	2	10	325482	325491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002528	TAATT	2	10	328439	328448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002528	TTTAA	2	10	329888	329897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002528	TAATT	2	10	329996	330005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002528	CAATT	2	10	343569	343578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_002528	ATTAT	2	10	352805	352814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002528	TTTAT	2	10	353706	353715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002528	TATAA	2	10	358311	358320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002528	AATTA	2	10	363360	363369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002528	TAAAA	3	15	364770	364784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002528	AAATT	2	10	367893	367902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002528	TATTT	2	10	372116	372125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002528	TAAAA	2	10	377465	377474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002528	TAAAA	2	10	385628	385637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002528	TAAAA	2	10	395375	395384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002528	TATAT	2	10	396572	396581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002528	ATATA	2	10	396582	396591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002528	TAAAT	2	10	411260	411269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002528	TAAAA	2	10	411433	411442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002528	AAATT	2	10	411531	411540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002528	TTTAT	2	10	413826	413835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002528	TTTAT	2	10	415195	415204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002528	TCTAT	2	10	420692	420701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002528	AAAAT	2	10	422291	422300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002528	AATTA	2	10	430415	430424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002528	AAATA	2	10	431845	431854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002528	TAAAA	3	15	443235	443249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002528	ATATA	2	10	446581	446590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002528	TTATT	2	10	448881	448890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002528	GTGCT	2	10	449360	449369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002528	TTATA	2	10	451232	451241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002528	TAATA	2	10	469623	469632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002528	TAAAT	2	10	475132	475141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002528	AAATT	2	10	475255	475264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002528	CAAAT	2	10	475307	475316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002528	AAATT	2	10	480984	480993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002528	TTAAT	2	10	504000	504009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002528	TCTAT	2	10	508558	508567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002528	ACTAT	2	10	508568	508577	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002528	TAATA	2	10	524509	524518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002528	TAATT	2	10	526598	526607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002528	TAATA	2	10	526717	526726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002528	TAAAA	2	10	532567	532576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002528	TAATA	2	10	535811	535820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002528	ATTTT	2	10	538296	538305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002528	CACTA	2	10	539408	539417	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_002528	TTCAG	2	10	540554	540563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002528	TCGGT	2	10	541709	541718	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_002528	CTTTT	2	10	542535	542544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002528	ATTTA	2	10	546474	546483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002528	TATAA	2	10	560436	560445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002528	TAAAA	2	10	564948	564957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002528	TAAAT	2	10	565000	565009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002528	ATAAA	2	10	567329	567338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002528	AAAAT	2	10	567354	567363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002528	CAAAA	2	10	579247	579256	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_002528	ATTGC	2	10	579578	579587	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002528	TAATT	2	10	579633	579642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002528	AAATA	2	10	580504	580513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002528	TTGAT	2	10	580853	580862	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002528	TAAAA	2	10	581568	581577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002528	TTTAA	2	10	587721	587730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002528	TTATA	2	10	587794	587803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002528	GAAAA	2	10	590023	590032	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002528	AATAA	2	10	591434	591443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002528	TTTAA	2	10	592126	592135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002528	AAATT	2	10	593332	593341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002528	TTAAA	2	10	593343	593352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002528	TAAAA	2	10	601426	601435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002528	ATTTC	2	10	610337	610346	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_002528	TTTTA	2	10	611768	611777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002528	ACCTT	2	10	614139	614148	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_002528	TAATT	2	10	623434	623443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002528	AAAAT	2	10	626128	626137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002528	ATTGT	2	10	630075	630084	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002528	ATTAT	2	10	633653	633662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002528	ATTAT	2	10	633837	633846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002528	ATATT	2	10	635650	635659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002528	ATTTT	2	10	639797	639806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002528	CAATT	2	10	640496	640505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.