MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	AGGA	2	8	1949	1956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001318	TCCC	2	8	2257	2264	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_001318	AATT	2	8	2344	2351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001318	TAAA	2	8	2414	2421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001318	GGCA	2	8	2456	2463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_001318	AAAT	2	8	2624	2631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001318	AAAT	2	8	2647	2654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001318	AAAG	2	8	2949	2956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001318	AAGT	2	8	7442	7449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001318	TTAT	2	8	8356	8363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001318	TAAT	2	8	19991	19998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001318	TTTA	2	8	20104	20111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001318	ATAA	2	8	20245	20252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001318	AATA	2	8	20590	20597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001318	ATCT	2	8	20615	20622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_001318	ATTT	2	8	25698	25705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001318	ATTT	2	8	38126	38133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001318	ATTT	2	8	40725	40732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001318	AATT	2	8	46424	46431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001318	GCTA	2	8	46454	46461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_001318	AAGC	2	8	46850	46857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_001318	ATTT	2	8	46968	46975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001318	CTGC	2	8	46998	47005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_001318	AATC	2	8	47879	47886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_001318	ATTT	2	8	59020	59027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001318	ATTT	2	8	59053	59060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001318	CAAA	2	8	60551	60558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001318	ATCA	2	8	74635	74642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_001318	ATAA	2	8	74768	74775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001318	AAAT	2	8	75085	75092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001318	ATTA	2	8	75156	75163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001318	AATT	2	8	75199	75206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001318	GAAT	2	8	75251	75258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001318	AGCA	2	8	75317	75324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_001318	ATTC	2	8	75450	75457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_001318	AAAT	2	8	79375	79382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001318	CAAA	2	8	94078	94085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_001318	ATTT	2	8	101378	101385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001318	TTTA	2	8	108233	108240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001318	TTAG	2	8	112818	112825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001318	TACT	2	8	114671	114678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_001318	CAAG	2	8	114709	114716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_001318	ATAA	2	8	114773	114780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001318	TAAA	2	8	116833	116840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001318	TAAA	2	8	117400	117407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001318	AATA	2	8	117563	117570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001318	TTAA	2	8	135866	135873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001318	ATTT	2	8	138287	138294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001318	CAAA	2	8	138331	138338	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_001318	AAAT	2	8	138761	138768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001318	AAGC	2	8	140277	140284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_001318	TCAT	2	8	141028	141035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_001318	AAAG	2	8	141363	141370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001318	TTAA	2	8	144245	144252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001318	ATTA	2	8	144270	144277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001318	AAAT	2	8	150852	150859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001318	TAAA	2	8	150948	150955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001318	TAAA	2	8	158503	158510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001318	CTTA	2	8	163053	163060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_001318	ATTA	2	8	169406	169413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001318	TAAA	2	8	169420	169427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001318	ATTT	2	8	171518	171525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001318	TAAT	2	8	182863	182870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001318	AAAT	2	8	188503	188510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001318	TTTA	2	8	188542	188549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001318	TATT	2	8	189289	189296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001318	TCAA	2	8	190010	190017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_001318	CAAA	2	8	190129	190136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_001318	AAAT	2	8	191488	191495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001318	TAAA	2	8	191501	191508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001318	TATT	2	8	193652	193659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001318	AATT	2	8	199954	199961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001318	TTTA	2	8	206123	206130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001318	ATTT	2	8	206400	206407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001318	ATTT	2	8	206491	206498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001318	TACA	2	8	208603	208610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_001318	TAAA	2	8	208611	208618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001318	AGCC	2	8	208788	208795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_001318	ATTA	2	8	221647	221654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001318	ATAC	2	8	228880	228887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_001318	AATA	2	8	229161	229168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001318	AATA	2	8	231583	231590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001318	TCAA	2	8	238279	238286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_001318	TAAT	2	8	240274	240281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001318	TAAA	2	8	245392	245399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001318	TTAA	2	8	245561	245568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001318	TTAA	2	8	245684	245691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001318	ATTT	2	8	252274	252281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001318	ATTA	2	8	263902	263909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001318	AATA	2	8	267527	267534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001318	GAAA	2	8	267739	267746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001318	AGAA	2	8	267886	267893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001318	TAAT	2	8	268149	268156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001318	AATT	2	8	268561	268568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001318	ATTG	2	8	268610	268617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001318	GCTT	2	8	268930	268937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_001318	CAAA	2	8	269175	269182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_001318	AATT	2	8	269370	269377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001318	TAAA	2	8	269494	269501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001318	TGAA	2	8	276521	276528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001318	TTAC	2	8	291628	291635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_001318	ATTT	2	8	303319	303326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001318	ATTA	2	8	326294	326301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001318	TAAA	2	8	326332	326339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001318	ATAA	2	8	330754	330761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001318	TTTA	2	8	334558	334565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001318	AATA	2	8	334595	334602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001318	CATA	2	8	334811	334818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_001318	AAAT	2	8	334834	334841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001318	GAAA	2	8	336550	336557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001318	AAAC	2	8	336583	336590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_001318	TAAA	2	8	338232	338239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001318	TTTA	2	8	340047	340054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001318	TAAA	2	8	346383	346390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001318	TCAT	2	8	347325	347332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_001318	TATT	2	8	355336	355343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001318	ATAG	2	8	365605	365612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001318	ATTT	2	8	365663	365670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001318	CAAT	2	8	365941	365948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_001318	TCTG	2	8	366183	366190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_001318	AATT	2	8	373549	373556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001318	AATA	2	8	374189	374196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001318	ATTT	2	8	374197	374204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001318	ATAG	2	8	384206	384213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001318	TATT	2	8	391835	391842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001318	AATA	2	8	391850	391857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001318	CAAA	2	8	392966	392973	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_001318	TTTA	2	8	393020	393027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001318	TTTA	2	8	395236	395243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001318	AATT	2	8	395460	395467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001318	TATT	2	8	413047	413054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001318	TTAT	2	8	416548	416555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001318	AATT	2	8	416556	416563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001318	CTTA	2	8	416568	416575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_001318	AAGC	2	8	418355	418362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_001318	AGAT	2	8	422954	422961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001318	AAAT	2	8	424508	424515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001318	TTAT	2	8	424638	424645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001318	AAAT	2	8	435134	435141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001318	TACG	2	8	436477	436484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_001318	ACCT	2	8	436541	436548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_001318	CTAC	2	8	436611	436618	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_001318	GTTT	2	8	437372	437379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001318	CTAA	2	8	437507	437514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_001318	TCGC	2	8	437997	438004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_001318	TAGC	2	8	438096	438103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_001318	ATTT	2	8	438275	438282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001318	TACG	2	8	439722	439729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_001318	ACCT	2	8	439786	439793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_001318	CTAC	2	8	439856	439863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_001318	GTTT	2	8	440617	440624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001318	CTAA	2	8	440752	440759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_001318	TCGC	2	8	441242	441249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.