MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 2696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	A	8	8	21	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001318	TAA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001318	A	6	6	52	57	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001318	TATAA	2	10	65	74	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001318	TAT	3	9	75	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001318	AT	3	6	82	87	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001318	ACT	2	6	99	104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001318	T	7	7	681	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001318	T	7	7	698	704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001318	ATT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001318	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001318	ACA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_001318	AT	3	6	1900	1905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001318	TAA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001318	AGGA	2	8	1949	1956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001318	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_001318	AT	3	6	2037	2042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001318	T	6	6	2083	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001318	TAT	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001318	TCA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_001318	T	6	6	2106	2111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001318	CAG	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_001318	GAA	2	6	2196	2201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001318	C	6	6	2204	2209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_001318	TCCC	2	8	2257	2264	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_001318	GCTTT	2	10	2274	2283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_001318	AGA	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001318	AATT	2	8	2344	2351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001318	AT	4	8	2379	2386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001318	TAAA	2	8	2414	2421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001318	GGCA	2	8	2456	2463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_001318	TAT	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001318	TCT	2	6	2574	2579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_001318	T	6	6	2579	2584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001318	AAAT	2	8	2624	2631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001318	AAAT	2	8	2647	2654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001318	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001318	TTG	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001318	CCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_001318	AAAG	2	8	2949	2956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001318	AAG	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001318	A	6	6	3001	3006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001318	CTT	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_001318	T	7	7	3059	3065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001318	TTG	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001318	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001318	AAAACC	2	12	3255	3266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_001318	TTA	2	6	3280	3285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001318	A	7	7	3294	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001318	TAA	2	6	3315	3320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001318	ATT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001318	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001318	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001318	ATA	2	6	5204	5209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001318	AAT	2	6	5243	5248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001318	T	7	7	7413	7419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001318	AAGT	2	8	7442	7449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001318	AATTT	2	10	8328	8337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001318	AAT	2	6	8338	8343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001318	TTAT	2	8	8356	8363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001318	AT	3	6	8362	8367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001318	TAT	2	6	8372	8377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001318	TAA	2	6	8390	8395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001318	A	8	8	15743	15750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001318	A	7	7	15752	15758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001318	T	8	8	15772	15779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001318	GAAAAA	2	12	15847	15858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001318	A	8	8	15854	15861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001318	A	9	9	15881	15889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001318	TAT	2	6	15897	15902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001318	TACTAA	2	12	15903	15914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_001318	A	7	7	15916	15922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001318	TCC	2	6	19985	19990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_001318	TAAT	2	8	19991	19998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001318	TAAAT	2	10	20016	20025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001318	AAT	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001318	TA	3	6	20051	20056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001318	A	7	7	20088	20094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001318	TTTA	2	8	20104	20111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001318	CTT	2	6	20115	20120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_001318	GAA	2	6	20156	20161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001318	GT	3	6	20187	20192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001318	CAA	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_001318	ATAA	2	8	20245	20252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001318	TTA	2	6	20294	20299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001318	AAG	2	6	20359	20364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001318	A	6	6	20405	20410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001318	TTC	2	6	20431	20436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_001318	GAA	2	6	20457	20462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001318	AATA	2	8	20590	20597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001318	ATCT	2	8	20615	20622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_001318	AAT	2	6	20677	20682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001318	ATT	2	6	20693	20698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001318	AAC	2	6	20711	20716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_001318	ACT	2	6	20720	20725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001318	T	6	6	20727	20732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001318	AAT	2	6	20780	20785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001318	T	6	6	20790	20795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001318	AT	3	6	20882	20887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001318	TTA	2	6	20910	20915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001318	TA	3	6	20930	20935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001318	T	6	6	20971	20976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001318	T	6	6	21016	21021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001318	A	6	6	22132	22137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001318	TAA	2	6	22139	22144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001318	AATTA	2	10	22741	22750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001318	CAA	2	6	22775	22780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_001318	A	7	7	22802	22808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001318	ATTT	2	8	25698	25705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001318	TAA	2	6	25713	25718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001318	ATA	2	6	25725	25730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001318	ATA	2	6	29492	29497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001318	TAA	2	6	31537	31542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001318	TTA	2	6	32099	32104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001318	A	6	6	32139	32144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001318	ATTT	2	8	38126	38133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001318	AAC	2	6	39640	39645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_001318	TAA	2	6	39649	39654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001318	TAA	2	6	39665	39670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001318	ACT	2	6	39675	39680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_001318	ATT	2	6	39700	39705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001318	TAT	2	6	39742	39747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001318	A	7	7	39754	39760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001318	A	6	6	39798	39803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001318	TAA	2	6	40702	40707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001318	TAT	2	6	40714	40719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001318	ATTT	2	8	40725	40732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001318	ATA	2	6	40751	40756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001318	AATTAA	2	12	45364	45375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001318	TAA	2	6	45411	45416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001318	A	7	7	45430	45436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001318	ATA	2	6	46000	46005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001318	TCC	2	6	46384	46389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_001318	AATT	2	8	46424	46431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001318	A	10	10	46442	46451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001318	GCTA	2	8	46454	46461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_001318	T	8	8	46500	46507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001318	ATT	2	6	46518	46523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001318	ATG	2	6	46571	46576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001318	ACA	2	6	46611	46616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_001318	TTG	2	6	46639	46644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001318	A	8	8	46670	46677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001318	AATAA	2	10	46679	46688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001318	ATA	2	6	46724	46729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001318	TTA	2	6	46760	46765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001318	ACC	2	6	46793	46798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_001318	AAGC	2	8	46850	46857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_001318	CAA	2	6	46900	46905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_001318	AGC	2	6	46923	46928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_001318	TTA	2	6	46954	46959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001318	T	6	6	46960	46965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001318	ATTT	2	8	46968	46975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_001318	A	6	6	47860	47865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_001318	AATC	2	8	47879	47886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_001318	TAA	2	6	72612	72617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_001318	TA	3	6	112826	112831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_001318	T	7	7	112843	112849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_001318	TAA	2	6	141529	141534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_001318	TGC	2	6	141691	141696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_001318	T	6	6	141723	141728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_001318	TAA	2	6	150809	150814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_001318	A	6	6	150964	150969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_001318	TAAAG	2	10	153059	153068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_001318	ATA	2	6	164839	164844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_001318	AT	3	6	164863	164868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_001318	AAT	2	6	164891	164896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_001318	TAAA	2	8	169420	169427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_001318	TAA	2	6	169449	169454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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