MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp21

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000955	ATA	2	6	63	68	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000955	T	6	6	129	134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000955	T	6	6	202	207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000955	AAT	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000955	TA	3	6	237	242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000955	TA	3	6	245	250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000955	AAT	2	6	636	641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000955	AT	3	6	661	666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000955	A	7	7	678	684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000955	A	6	6	688	693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000955	TAATA	2	10	721	730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000955	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000955	TAA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000955	A	6	6	1198	1203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000955	TA	3	6	1204	1209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000955	TTA	3	9	1306	1314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000955	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000955	AAGAA	2	10	1391	1400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000955	ATA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000955	AT	3	6	2677	2682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000955	ATAA	2	8	2703	2710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000955	AAC	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000955	AT	3	6	2755	2760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000955	TAAT	2	8	2804	2811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000955	GTTTA	2	10	3662	3671	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000955	ATAA	2	8	3690	3697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000955	ATAA	2	8	3705	3712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000955	AAAT	2	8	3753	3760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000955	ATAA	2	8	3812	3819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000955	GTTTA	2	10	3847	3856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000955	AAAT	2	8	3877	3884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000955	GTTTA	2	10	3910	3919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000955	GTTTA	2	10	3973	3982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000955	AAAT	2	8	4003	4010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000955	GTTTA	2	10	4036	4045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000955	ATAA	2	8	4064	4071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000955	AAAT	2	8	4127	4134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000955	ATAA	2	8	4186	4193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000955	AAAT	2	8	4249	4256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000955	GTTTA	2	10	4282	4291	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000955	AAAT	2	8	4312	4319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000955	GTTTA	2	10	4345	4354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000955	AAAT	2	8	4375	4382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000955	AAAT	2	8	4436	4443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000955	GTTTA	2	10	4469	4478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000955	AAAT	2	8	4499	4506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000955	GTTTA	2	10	4532	4541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000955	AAAT	2	8	4562	4569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000955	GTTTA	2	10	4595	4604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000955	ATAA	2	8	4623	4630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000955	GTTTA	2	10	4658	4667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000955	AAAT	2	8	4688	4695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000955	GTTTA	2	10	4721	4730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000955	AAAT	2	8	4751	4758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000955	GTTTA	2	10	4784	4793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000955	AAAT	2	8	4814	4821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000955	AAAT	2	8	4875	4882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000955	GTTTA	2	10	4908	4917	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000955	AAAT	2	8	4938	4945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000955	ATAA	2	8	4951	4958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000955	GTTTA	2	10	4971	4980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000955	ATA	2	6	5018	5023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000955	GTTTA	2	10	5034	5043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000955	AAAT	2	8	5064	5071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000955	GTTTA	2	10	5097	5106	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000955	AAAT	2	8	5127	5134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000955	GTTTA	2	10	5160	5169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000955	ATAA	2	8	5188	5195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000955	GTTTA	2	10	5223	5232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000955	ATAA	2	8	5251	5258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000955	AAAT	2	8	5314	5321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000955	GTTTA	2	10	5347	5356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000955	AAAT	2	8	5377	5384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000955	ATAA	2	8	5390	5397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000955	AAAT	2	8	5438	5445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000955	GTTTA	2	10	5471	5480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000955	AAAT	2	8	5501	5508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000955	AAAT	2	8	5562	5569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000955	GTTTA	2	10	5595	5604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000955	AAAT	2	8	5625	5632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000955	ATAA	2	8	5638	5645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000955	GTTTA	2	10	5658	5667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000955	ATA	2	6	5705	5710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000955	GTTTA	2	10	5721	5730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000955	AAAT	2	8	5751	5758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000955	GTTTA	2	10	5784	5793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000955	AAAT	2	8	5814	5821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000955	GTTTA	2	10	5847	5856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000955	ATAA	2	8	5875	5882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000955	GTTTA	2	10	5910	5919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000955	ATAA	2	8	5938	5945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000955	AAAT	2	8	6001	6008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000955	GTTTA	2	10	6034	6043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000955	AAAT	2	8	6064	6071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000955	ATAA	2	8	6077	6084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000955	AAAT	2	8	6125	6132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000955	ATAA	2	8	6184	6191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000955	ATA	2	6	6203	6208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000955	GTTTA	2	10	6219	6228	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000955	ATAA	2	8	6247	6254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000955	GTTTA	2	10	6282	6291	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000955	AAAT	2	8	6312	6319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000955	ATAA	2	8	6371	6378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000955	ATAA	2	8	6432	6439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000955	GTTTA	2	10	6467	6476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000955	AAAT	2	8	6497	6504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000955	GTTTA	2	10	6530	6539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000955	GTTTA	2	10	6593	6602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000955	ATA	2	6	6640	6645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000955	AAAT	2	8	6684	6691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000955	AAAT	2	8	6745	6752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000955	ATAA	2	8	6804	6811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000955	GTTTA	2	10	6839	6848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000955	AAAT	2	8	6869	6876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000955	GTTTA	2	10	6902	6911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000955	AAAT	2	8	6932	6939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000955	GTTTA	2	10	6965	6974	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000955	ATAA	2	8	6993	7000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000955	GTTTA	2	10	7028	7037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000955	AAAT	2	8	7058	7065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000955	GTTTA	2	10	7091	7100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000955	AAAT	2	8	7121	7128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000955	GTTTA	2	10	7154	7163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000955	AAAT	2	8	7184	7191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000955	ATAA	2	8	7243	7250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000955	ATAA	2	8	7304	7311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000955	GTTTA	2	10	7339	7348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000955	AAAT	2	8	7369	7376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000955	GTTTA	2	10	7402	7411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000955	AAAT	2	8	7432	7439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000955	GTTTA	2	10	7465	7474	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000955	AAAT	2	8	7495	7502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000955	GTTTA	2	10	7528	7537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000955	ATAA	2	8	7556	7563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000955	AAAT	2	8	7619	7626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000955	GTTTA	2	10	7652	7661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000955	AAAT	2	8	7682	7689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000955	GTTTA	2	10	7715	7724	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000955	AAAT	2	8	7745	7752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000955	GTTTA	2	10	7778	7787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000955	ATAA	2	8	7806	7813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000955	GTTTA	2	10	7841	7850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000955	AAAT	2	8	7871	7878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000955	AAAT	2	8	7932	7939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000955	GTTTA	2	10	7965	7974	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000955	AAAT	2	8	7995	8002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000955	ATAA	2	8	8054	8061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000955	AAAT	2	8	8117	8124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000955	ATAA	2	8	8176	8183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000955	GTTTA	2	10	8211	8220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000955	AAAT	2	8	8241	8248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000955	GTTTA	2	10	8274	8283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000955	ATAA	2	8	8302	8309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000955	AAAT	2	8	8365	8372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_000955	GTTTA	2	10	8398	8407	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_000955	AAAT	2	8	8428	8435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_000955	ATAA	2	8	8441	8448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_000955	GTTTA	2	10	8461	8470	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_000955	GTTTA	2	10	13778	13787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
315	NC_000955	AAAT	2	8	13808	13815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_000955	GTTTA	2	10	13841	13850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
317	NC_000955	AAAT	2	8	13871	13878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_000955	AAAT	2	8	13932	13939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_000955	AAAT	2	8	14058	14065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_000955	AAAT	2	8	14119	14126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_000955	GTTTA	2	10	14467	14476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
332	NC_000955	AAAT	2	8	14558	14565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_000955	ATA	2	6	14575	14580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_000955	ATT	2	6	16133	16138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_000955	AT	5	10	16143	16152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_000955	TAAT	2	8	16561	16568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_000955	TAT	2	6	16593	16598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_000955	ATT	2	6	16860	16865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_000955	TAA	2	6	17904	17909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_000955	AT	3	6	17927	17932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NC_000955	A	7	7	17996	18002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_000955	TTAT	2	8	18004	18011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_000955	ATG	2	6	18043	18048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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355	NC_000955	T	9	9	18102	18110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_000955	A	6	6	18122	18127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_000955	A	8	8	18763	18770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.