MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-8

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000953	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000953	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000953	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000953	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000953	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000953	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000953	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000953	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000953	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000953	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000953	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000953	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000953	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000953	G	6	6	7816	7821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000953	TA	3	6	15167	15172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000953	TAAAAA	2	12	15182	15193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000953	ATA	2	6	16519	16524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000953	ACC	2	6	17102	17107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_000953	ATA	2	6	17131	17136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000953	TAA	3	9	17182	17190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000953	A	7	7	17189	17195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000953	TCC	2	6	18707	18712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_000953	TTGT	2	8	18713	18720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000953	TAA	2	6	18723	18728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000953	TA	3	6	18736	18741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000953	T	6	6	18763	18768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000953	A	8	8	18783	18790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000953	TAT	2	6	18811	18816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000953	CTA	2	6	18817	18822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000953	T	7	7	18851	18857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000953	TGTAG	2	10	18912	18921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000953	TTAAA	2	10	18929	18938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000953	TAA	2	6	18991	18996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000953	T	7	7	19010	19016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000953	ATT	2	6	19062	19067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000953	AAT	2	6	19068	19073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000953	TAT	2	6	21487	21492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000953	A	8	8	21493	21500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000953	T	6	6	21515	21520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000953	T	6	6	21534	21539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000953	TAAA	2	8	21553	21560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000953	A	6	6	21594	21599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000953	AGAT	2	8	21647	21654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000953	AGAAA	2	10	21669	21678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000953	GAAA	2	8	21710	21717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000953	A	6	6	21753	21758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000953	AAG	2	6	21835	21840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000953	AGA	2	6	21851	21856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000953	TAA	2	6	21895	21900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000953	AAAG	2	8	21906	21913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000953	A	6	6	21923	21928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000953	ATT	2	6	22034	22039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000953	A	6	6	22047	22052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000953	AAT	2	6	22055	22060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000953	AAT	2	6	22064	22069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000953	ATA	2	6	22097	22102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000953	TGA	2	6	22737	22742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000953	TAT	2	6	22747	22752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000953	T	6	6	22801	22806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000953	TTTTA	2	10	22830	22839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000953	ACAAAT	2	12	22840	22851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_000953	ATT	2	6	22882	22887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000953	ATT	2	6	22903	22908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000953	TAA	2	6	22910	22915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000953	TTA	2	6	22939	22944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000953	TAA	2	6	22965	22970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000953	ATTA	2	8	22978	22985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000953	TAA	2	6	22986	22991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000953	A	6	6	23010	23015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000953	ATT	2	6	23027	23032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000953	AGG	2	6	23044	23049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000953	TTA	2	6	23056	23061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000953	TTTG	2	8	23096	23103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000953	T	8	8	23121	23128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000953	TA	4	8	23169	23176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000953	A	6	6	23192	23197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000953	T	8	8	23277	23284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000953	A	6	6	23299	23304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000953	TA	3	6	23326	23331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000953	TATT	2	8	23336	23343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000953	ACAA	2	8	23347	23354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_000953	GGA	2	6	23355	23360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000953	A	6	6	24703	24708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000953	A	7	7	24711	24717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000953	AGG	2	6	24730	24735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000953	ATTA	2	8	24736	24743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000953	AAGTAA	2	12	25986	25997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000953	AAGA	2	8	26140	26147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000953	AT	3	6	26164	26169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000953	AATTT	2	10	26184	26193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000953	AGT	2	6	26221	26226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000953	GA	3	6	26239	26244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000953	GTT	2	6	26254	26259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000953	TA	3	6	26311	26316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000953	TAT	2	6	26341	26346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000953	GA	3	6	26919	26924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000953	AAC	2	6	28102	28107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_000953	A	7	7	28112	28118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000953	GTT	2	6	28125	28130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000953	T	7	7	28132	28138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000953	A	6	6	28191	28196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000953	TTTA	2	8	28224	28231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000953	TA	3	6	28230	28235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000953	CT	3	6	28236	28241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_000953	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000953	AAG	2	6	28881	28886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.