MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-7

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000952	ATA	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000952	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000952	AGG	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000952	AGG	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000952	AGG	2	6	7817	7822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000952	TA	3	6	15174	15179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000952	TAAAAA	2	12	15189	15200	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000952	CAAT	2	8	16506	16513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_000952	CTA	2	6	17140	17145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000952	ATA	2	6	17171	17176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000952	TAA	3	9	17222	17230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000952	A	7	7	17229	17235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000952	AGC	2	6	17671	17676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000952	T	6	6	18788	18793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000952	A	6	6	18808	18813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000952	TAT	3	9	18868	18876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000952	T	6	6	18876	18881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000952	GTA	2	6	18939	18944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000952	TAA	2	6	19016	19021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000952	ATT	2	6	19087	19092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000952	A	6	6	19111	19116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000952	AAG	2	6	22078	22083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000952	CTTT	2	8	22766	22773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000952	T	6	6	22795	22800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000952	TTTTA	2	10	22824	22833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000952	ACAAAT	2	12	22834	22845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_000952	TTG	2	6	22877	22882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000952	TTTA	2	8	22890	22897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000952	TAA	2	6	22901	22906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000952	TA	4	8	22941	22948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000952	A	7	7	22983	22989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000952	T	6	6	23050	23055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000952	T	6	6	23062	23067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000952	A	6	6	23070	23075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000952	A	6	6	24472	24477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000952	A	7	7	24480	24486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000952	AGG	2	6	24499	24504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000952	ATTA	2	8	24505	24512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000952	AAGTAA	2	12	25755	25766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000952	TAA	2	6	25775	25780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000952	T	6	6	25890	25895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000952	AAGA	2	8	25909	25916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000952	AT	3	6	25933	25938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000952	GTG	2	6	25991	25996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000952	GA	3	6	26008	26013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000952	TA	3	6	26080	26085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000952	TATT	2	8	26106	26113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000952	TAA	2	6	28752	28757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000952	AATA	2	8	28763	28770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000952	ATA	2	6	28800	28805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000952	GTT	2	6	28852	28857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.