MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1051L

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187143	A	7	7	635	641	100 %	0 %	0 %	0 %	426202373
2	NT_187143	AAT	3	9	661	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202373
3	NT_187143	TTTA	2	8	673	680	25 %	75 %	0 %	0 %	426202373
4	NT_187143	GTA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202373
5	NT_187143	AGC	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202373
6	NT_187143	T	6	6	746	751	0 %	100 %	0 %	0 %	426202373
7	NT_187143	AT	3	6	786	791	50 %	50 %	0 %	0 %	426202373
8	NT_187143	ACT	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202373
9	NT_187143	AAC	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202373
10	NT_187143	CTAA	2	8	1037	1044	50 %	25 %	0 %	25 %	426202373
11	NT_187143	AAG	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202373
12	NT_187143	GTA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202373
13	NT_187143	GCA	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202373
14	NT_187143	TGC	2	6	1111	1116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202373
15	NT_187143	TAT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202373
16	NT_187143	TAT	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202373
17	NT_187143	TGC	3	9	1225	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202373
18	NT_187143	CTG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202373
19	NT_187143	TGC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202373
20	NT_187143	TGC	3	9	1267	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202373
21	NT_187143	AGC	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202373
22	NT_187143	TGAT	2	8	1335	1342	25 %	50 %	25 %	0 %	426202373
23	NT_187143	CTA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202373
24	NT_187143	GCA	2	6	1472	1477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202373
25	NT_187143	GGT	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202373
26	NT_187143	TGC	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202373
27	NT_187143	AGC	3	9	1549	1557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202373
28	NT_187143	AGTA	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	426202373
29	NT_187143	AGATA	2	10	1627	1636	60 %	20 %	20 %	0 %	426202373
30	NT_187143	CAAC	2	8	1706	1713	50 %	0 %	0 %	50 %	426202373
31	NT_187143	TAAA	2	8	1717	1724	75 %	25 %	0 %	0 %	426202373
32	NT_187143	A	8	8	13414	13421	100 %	0 %	0 %	0 %	426202374
33	NT_187143	AAT	3	9	13441	13449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202374
34	NT_187143	TTTA	2	8	13453	13460	25 %	75 %	0 %	0 %	426202374
35	NT_187143	T	6	6	13546	13551	0 %	100 %	0 %	0 %	426202374
36	NT_187143	CAT	2	6	13563	13568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202374
37	NT_187143	A	6	6	13612	13617	100 %	0 %	0 %	0 %	426202374
38	NT_187143	TAA	2	6	13681	13686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202374
39	NT_187143	AG	3	6	13704	13709	50 %	0 %	50 %	0 %	426202374
40	NT_187143	ATA	2	6	13761	13766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202374
41	NT_187143	GATAA	2	10	13772	13781	60 %	20 %	20 %	0 %	426202374
42	NT_187143	TGC	2	6	13855	13860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202374
43	NT_187143	AAG	2	6	13926	13931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202374
44	NT_187143	ATA	2	6	13950	13955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202374
45	NT_187143	GAG	2	6	13964	13969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202374
46	NT_187143	ATG	2	6	13986	13991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202374
47	NT_187143	TAC	2	6	14014	14019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202374
48	NT_187143	TGC	2	6	14023	14028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202374
49	NT_187143	GAT	2	6	14033	14038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202374
50	NT_187143	A	6	6	14039	14044	100 %	0 %	0 %	0 %	426202374
51	NT_187143	GCA	2	6	14057	14062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202374
52	NT_187143	TTGCTA	2	12	14151	14162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	426202374
53	NT_187143	AAT	2	6	14252	14257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202374
54	NT_187143	ATG	2	6	14262	14267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202374
55	NT_187143	AGC	2	6	14287	14292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202374
56	NT_187143	AC	3	6	14319	14324	50 %	0 %	0 %	50 %	426202374
57	NT_187143	AAG	2	6	14373	14378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202374
58	NT_187143	TAA	2	6	14443	14448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202374
59	NT_187143	ATAA	2	8	14452	14459	75 %	25 %	0 %	0 %	426202374
60	NT_187143	TTTA	2	8	14558	14565	25 %	75 %	0 %	0 %	426202375
61	NT_187143	GTT	2	6	14576	14581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202375
62	NT_187143	TAG	2	6	14595	14600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202375
63	NT_187143	TCT	2	6	14615	14620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202375
64	NT_187143	TAT	2	6	14686	14691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202375
65	NT_187143	TGC	2	6	14722	14727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202375
66	NT_187143	ACC	2	6	14779	14784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426202375
67	NT_187143	TCTT	2	8	14828	14835	0 %	75 %	0 %	25 %	426202375
68	NT_187143	GCAATA	2	12	14873	14884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	426202375
69	NT_187143	GCA	2	6	14888	14893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202375
70	NT_187143	CAT	2	6	14925	14930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202375
71	NT_187143	CAC	2	6	14961	14966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426202375
72	NT_187143	TGC	2	6	14989	14994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202375
73	NT_187143	TAT	2	6	15015	15020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202375
74	NT_187143	CTG	2	6	15066	15071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202375
75	NT_187143	TAG	2	6	15075	15080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202375
76	NT_187143	CAAG	2	8	15141	15148	50 %	0 %	25 %	25 %	426202375
77	NT_187143	GCA	2	6	15158	15163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202375
78	NT_187143	TAG	2	6	15192	15197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202375
79	NT_187143	CCA	2	6	15200	15205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426202375
80	NT_187143	TGC	2	6	15232	15237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202375
81	NT_187143	ACT	2	6	15290	15295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202375
82	NT_187143	T	6	6	15366	15371	0 %	100 %	0 %	0 %	426202375
83	NT_187143	CTA	2	6	15539	15544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202375
84	NT_187143	ATAA	2	8	15560	15567	75 %	25 %	0 %	0 %	426202375
85	NT_187143	ATT	3	9	15572	15580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202375
86	NT_187143	T	8	8	15600	15607	0 %	100 %	0 %	0 %	426202375
87	NT_187143	AAT	3	9	20636	20644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202376
88	NT_187143	TTTA	2	8	20648	20655	25 %	75 %	0 %	0 %	426202376
89	NT_187143	TAA	2	6	20672	20677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202376
90	NT_187143	CAA	2	6	20779	20784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202376
91	NT_187143	AAG	2	6	20791	20796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202376
92	NT_187143	GAAA	2	8	20842	20849	75 %	0 %	25 %	0 %	426202376
93	NT_187143	TGA	2	6	20873	20878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202376
94	NT_187143	ATAGT	2	10	20914	20923	40 %	40 %	20 %	0 %	426202376
95	NT_187143	CTG	2	6	20926	20931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202376
96	NT_187143	CTG	2	6	20998	21003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202376
97	NT_187143	GTG	2	6	21049	21054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202376
98	NT_187143	A	6	6	21063	21068	100 %	0 %	0 %	0 %	426202376
99	NT_187143	TGA	2	6	21077	21082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202376
100	NT_187143	A	7	7	21089	21095	100 %	0 %	0 %	0 %	426202376
101	NT_187143	GCT	2	6	21180	21185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202376
102	NT_187143	TAAC	2	8	21254	21261	50 %	25 %	0 %	25 %	426202376

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.