MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047R

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187141	GTAG	2	8	1543	1550	25 %	25 %	50 %	0 %	426202351
2	NT_187141	AGTT	2	8	1583	1590	25 %	50 %	25 %	0 %	426202351
3	NT_187141	AAAG	2	8	1626	1633	75 %	0 %	25 %	0 %	426202351
4	NT_187141	ATAA	2	8	1990	1997	75 %	25 %	0 %	0 %	426202351
5	NT_187141	CTAA	2	8	2886	2893	50 %	25 %	0 %	25 %	426202352
6	NT_187141	TGAT	2	8	3187	3194	25 %	50 %	25 %	0 %	426202352
7	NT_187141	AGTA	2	8	3470	3477	50 %	25 %	25 %	0 %	426202352
8	NT_187141	TGAG	2	8	9326	9333	25 %	25 %	50 %	0 %	426202353
9	NT_187141	AGAT	2	8	12072	12079	50 %	25 %	25 %	0 %	426202354
10	NT_187141	AGAT	2	8	12105	12112	50 %	25 %	25 %	0 %	426202354
11	NT_187141	TTGA	2	8	12197	12204	25 %	50 %	25 %	0 %	426202354
12	NT_187141	TAGT	2	8	12970	12977	25 %	50 %	25 %	0 %	426202356
13	NT_187141	TTTA	2	8	13115	13122	25 %	75 %	0 %	0 %	426202356
14	NT_187141	TGTC	3	12	13303	13314	0 %	50 %	25 %	25 %	426202356
15	NT_187141	AAGA	2	8	13557	13564	75 %	0 %	25 %	0 %	426202356
16	NT_187141	ATAA	2	8	14620	14627	75 %	25 %	0 %	0 %	426202357
17	NT_187141	ACAA	2	8	14873	14880	75 %	0 %	0 %	25 %	426202357
18	NT_187141	TAGC	2	8	15086	15093	25 %	25 %	25 %	25 %	426202357
19	NT_187141	AAAG	2	8	15903	15910	75 %	0 %	25 %	0 %	426202357
20	NT_187141	TTAA	2	8	16138	16145	50 %	50 %	0 %	0 %	426202357
21	NT_187141	TATT	3	12	16612	16623	25 %	75 %	0 %	0 %	426202357
22	NT_187141	AGAC	2	8	16817	16824	50 %	0 %	25 %	25 %	426202357

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.