MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187140	CTTT	2	8	1542	1549	0 %	75 %	0 %	25 %	426202341
2	NT_187140	TTTA	2	8	8009	8016	25 %	75 %	0 %	0 %	426202342
3	NT_187140	GAAA	2	8	8203	8210	75 %	0 %	25 %	0 %	426202342
4	NT_187140	GGAA	2	8	8303	8310	50 %	0 %	50 %	0 %	426202342
5	NT_187140	TAGA	2	8	8470	8477	50 %	25 %	25 %	0 %	426202342
6	NT_187140	TTTA	2	8	9042	9049	25 %	75 %	0 %	0 %	426202343
7	NT_187140	AATT	2	8	9392	9399	50 %	50 %	0 %	0 %	426202343
8	NT_187140	CTAA	2	8	9406	9413	50 %	25 %	0 %	25 %	426202343
9	NT_187140	ATAA	2	8	11200	11207	75 %	25 %	0 %	0 %	426202344
10	NT_187140	CAAT	2	8	14703	14710	50 %	25 %	0 %	25 %	426202346
11	NT_187140	TACT	2	8	15061	15068	25 %	50 %	0 %	25 %	426202346
12	NT_187140	TTTA	2	8	16752	16759	25 %	75 %	0 %	0 %	426202347
13	NT_187140	AAAG	2	8	17076	17083	75 %	0 %	25 %	0 %	426202347
14	NT_187140	GTAT	2	8	19472	19479	25 %	50 %	25 %	0 %	426202348
15	NT_187140	TGTT	2	8	19493	19500	0 %	75 %	25 %	0 %	426202348
16	NT_187140	AATT	2	8	19863	19870	50 %	50 %	0 %	0 %	426202348
17	NT_187140	AGAT	2	8	19891	19898	50 %	25 %	25 %	0 %	426202348
18	NT_187140	ACTT	2	8	20880	20887	25 %	50 %	0 %	25 %	426202349
19	NT_187140	GCAA	2	8	20896	20903	50 %	0 %	25 %	25 %	426202349
20	NT_187140	TAAT	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	426202349

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.