MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1046T

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187139	ATT	2	6	365	370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202336
2	NT_187139	TTA	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202336
3	NT_187139	TTC	2	6	388	393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202336
4	NT_187139	TTA	2	6	396	401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202336
5	NT_187139	TGT	2	6	558	563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202336
6	NT_187139	TCT	2	6	569	574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202336
7	NT_187139	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202336
8	NT_187139	ACA	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202337
9	NT_187139	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202337
10	NT_187139	TAA	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202337
11	NT_187139	ATT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202337
12	NT_187139	TAG	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202337
13	NT_187139	CCT	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426202337
14	NT_187139	TTA	2	6	1432	1437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202337
15	NT_187139	AAT	3	9	3524	3532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202338
16	NT_187139	CAG	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
17	NT_187139	GTT	2	6	3810	3815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202338
18	NT_187139	TTG	2	6	3823	3828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202338
19	NT_187139	GCA	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
20	NT_187139	AGC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
21	NT_187139	TAG	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202338
22	NT_187139	CTG	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202338
23	NT_187139	AAG	2	6	4056	4061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202338
24	NT_187139	AGA	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202338
25	NT_187139	AGC	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
26	NT_187139	TTC	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202338
27	NT_187139	GCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
28	NT_187139	ACT	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202338
29	NT_187139	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
30	NT_187139	AGC	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
31	NT_187139	AGC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
32	NT_187139	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202338
33	NT_187139	CAG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
34	NT_187139	CAA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202338
35	NT_187139	AAT	2	6	4572	4577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202338
36	NT_187139	AAT	3	9	11438	11446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
37	NT_187139	CAT	2	6	11560	11565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202339
38	NT_187139	TAA	2	6	11678	11683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
39	NT_187139	ATA	2	6	11758	11763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
40	NT_187139	TGC	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202339
41	NT_187139	TGG	2	6	11846	11851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202339
42	NT_187139	TAA	2	6	11896	11901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
43	NT_187139	AGT	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202339
44	NT_187139	AAG	2	6	11935	11940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202339

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.