MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	ATA	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679221
2	NT_167351	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679221
3	NT_167351	AGC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679221
4	NT_167351	TAA	2	6	203	208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679222
5	NT_167351	CAA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679222
6	NT_167351	TGT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679223
7	NT_167351	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
8	NT_167351	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
9	NT_167351	ATT	2	6	1638	1643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
10	NT_167351	AAC	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
11	NT_167351	TAT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
12	NT_167351	CTA	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679224
13	NT_167351	TAA	2	6	1837	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
14	NT_167351	GAG	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679224
15	NT_167351	TAA	3	9	1873	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
16	NT_167351	ATA	2	6	1884	1889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
17	NT_167351	AAG	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679224
18	NT_167351	TAA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
19	NT_167351	CAA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
20	NT_167351	TAT	2	6	1987	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
21	NT_167351	ACA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
22	NT_167351	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
23	NT_167351	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
24	NT_167351	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679225
25	NT_167351	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679225
26	NT_167351	ATT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679225
27	NT_167351	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679225
28	NT_167351	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679225
29	NT_167351	AAG	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679225
30	NT_167351	GGA	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679225
31	NT_167351	AAT	2	6	3099	3104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679225
32	NT_167351	ATA	2	6	3340	3345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679226
33	NT_167351	ATT	2	6	3359	3364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679226
34	NT_167351	ATA	3	9	3763	3771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679227
35	NT_167351	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679228
36	NT_167351	TAG	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679228
37	NT_167351	AAC	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679228
38	NT_167351	AAT	2	6	4489	4494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679228
39	NT_167351	TTA	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679228
40	NT_167351	ACC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679228
41	NT_167351	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679228
42	NT_167351	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679228
43	NT_167351	TTA	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679228
44	NT_167351	ATT	3	9	5899	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679229
45	NT_167351	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679229
46	NT_167351	GAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679229
47	NT_167351	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679229
48	NT_167351	CCA	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679231
49	NT_167351	GAA	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679231
50	NT_167351	GCT	2	6	7497	7502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679232
51	NT_167351	GAG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679232
52	NT_167351	ATG	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679234
53	NT_167351	AAG	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679235
54	NT_167351	TGA	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679235
55	NT_167351	AGA	2	6	8418	8423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679235
56	NT_167351	GTT	2	6	9296	9301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679237
57	NT_167351	AAG	2	6	9327	9332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679237
58	NT_167351	CTT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
59	NT_167351	ATC	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679237
60	NT_167351	TTC	2	6	9729	9734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
61	NT_167351	CTT	2	6	9754	9759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
62	NT_167351	TAT	3	9	9774	9782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679237
63	NT_167351	TAA	2	6	9888	9893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679238
64	NT_167351	AAT	2	6	10055	10060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679238
65	NT_167351	ATT	2	6	10082	10087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
66	NT_167351	TTA	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
67	NT_167351	TGA	2	6	10199	10204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679238
68	NT_167351	GGA	2	6	10212	10217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679238
69	NT_167351	AAT	2	6	10249	10254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679238
70	NT_167351	CTT	2	6	10297	10302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679238
71	NT_167351	AAC	2	6	10364	10369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679238
72	NT_167351	GAT	2	6	10438	10443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679238
73	NT_167351	TTA	2	6	10512	10517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
74	NT_167351	ATT	2	6	10533	10538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679238
75	NT_167351	GAA	2	6	10539	10544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679238
76	NT_167351	CTC	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679238
77	NT_167351	AAT	2	6	10700	10705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679239
78	NT_167351	AAC	2	6	10742	10747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679239
79	NT_167351	ATA	2	6	10891	10896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679239
80	NT_167351	TTC	2	6	10942	10947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679239
81	NT_167351	AAT	2	6	10964	10969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679239
82	NT_167351	CTT	2	6	10970	10975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679239
83	NT_167351	TTA	2	6	11003	11008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679239
84	NT_167351	CAT	2	6	11029	11034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679239
85	NT_167351	TTA	2	6	11130	11135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679239
86	NT_167351	CTT	2	6	11172	11177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679240
87	NT_167351	ATT	2	6	11191	11196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
88	NT_167351	TAA	2	6	11215	11220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679240
89	NT_167351	TAT	2	6	11247	11252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
90	NT_167351	ATA	2	6	11462	11467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679240
91	NT_167351	TTA	2	6	11637	11642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
92	NT_167351	ATT	2	6	11672	11677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
93	NT_167351	TAA	2	6	11710	11715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679240
94	NT_167351	AGA	2	6	11720	11725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679240
95	NT_167351	TTG	2	6	11750	11755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679240
96	NT_167351	TCT	3	9	11798	11806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679240
97	NT_167351	ATT	3	9	11815	11823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
98	NT_167351	TAT	2	6	11826	11831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
99	NT_167351	TTA	2	6	11864	11869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
100	NT_167351	TAG	2	6	12020	12025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679240
101	NT_167351	GTT	2	6	12029	12034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679240
102	NT_167351	ATT	2	6	12100	12105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679240
103	NT_167351	CTT	2	6	12154	12159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679240
104	NT_167351	TTG	2	6	12218	12223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679240
105	NT_167351	AAT	2	6	12787	12792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679241
106	NT_167351	ATT	2	6	12870	12875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679241
107	NT_167351	ATT	2	6	13090	13095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679242
108	NT_167351	TTC	2	6	13690	13695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679243
109	NT_167351	TGA	2	6	13742	13747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679243
110	NT_167351	TAA	2	6	13796	13801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679243
111	NT_167351	CTT	2	6	13867	13872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679243
112	NT_167351	CTA	2	6	13995	14000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679243
113	NT_167351	GAG	2	6	14107	14112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679243
114	NT_167351	ACC	2	6	14159	14164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679243
115	NT_167351	AAG	2	6	14233	14238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679243
116	NT_167351	AAT	2	6	15246	15251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679244
117	NT_167351	TAG	2	6	15328	15333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679244

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.