MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 3580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022659	TCGCC	2	10	2236	2245	0 %	20 %	20 %	60 %	556576571
2	NC_022659	TCCCG	2	10	3881	3890	0 %	20 %	20 %	60 %	556576316
3	NC_022659	CGTGG	2	10	4128	4137	0 %	20 %	60 %	20 %	556576316
4	NC_022659	CGGCG	2	10	4668	4677	0 %	0 %	60 %	40 %	556576316
5	NC_022659	CGCGC	2	10	6077	6086	0 %	0 %	40 %	60 %	556576396
6	NC_022659	CGACG	2	10	8944	8953	20 %	0 %	40 %	40 %	556575643
7	NC_022659	GGCGC	2	10	10303	10312	0 %	0 %	60 %	40 %	556576543
8	NC_022659	TCCGC	2	10	10480	10489	0 %	20 %	20 %	60 %	556576543
9	NC_022659	CGCGC	2	10	11842	11851	0 %	0 %	40 %	60 %	556576543
10	NC_022659	GCGCC	2	10	13213	13222	0 %	0 %	40 %	60 %	556575365
11	NC_022659	GCGCG	2	10	13436	13445	0 %	0 %	60 %	40 %	556575365
12	NC_022659	GCTCG	2	10	14815	14824	0 %	20 %	40 %	40 %	556574635
13	NC_022659	GCCGC	2	10	14846	14855	0 %	0 %	40 %	60 %	556574635
14	NC_022659	TCGCG	2	10	15877	15886	0 %	20 %	40 %	40 %	556577888
15	NC_022659	CGCGC	2	10	17768	17777	0 %	0 %	40 %	60 %	556575587
16	NC_022659	GCGTC	2	10	20684	20693	0 %	20 %	40 %	40 %	556576050
17	NC_022659	ACGCG	2	10	23155	23164	20 %	0 %	40 %	40 %	556574744
18	NC_022659	GCGCC	2	10	24067	24076	0 %	0 %	40 %	60 %	556575063
19	NC_022659	GCACC	2	10	25277	25286	20 %	0 %	20 %	60 %	556575378
20	NC_022659	GCGCG	2	10	26578	26587	0 %	0 %	60 %	40 %	556575378
21	NC_022659	CGCGG	2	10	26588	26597	0 %	0 %	60 %	40 %	556575378
22	NC_022659	CGTCG	2	10	26631	26640	0 %	20 %	40 %	40 %	556575378
23	NC_022659	CGGCG	2	10	28139	28148	0 %	0 %	60 %	40 %	556574698
24	NC_022659	CGACG	2	10	28166	28175	20 %	0 %	40 %	40 %	556574698
25	NC_022659	GCACG	2	10	28752	28761	20 %	0 %	40 %	40 %	556574787
26	NC_022659	GCGCC	2	10	28787	28796	0 %	0 %	40 %	60 %	556574787
27	NC_022659	ACGCG	2	10	33799	33808	20 %	0 %	40 %	40 %	556575388
28	NC_022659	GCCGA	2	10	34266	34275	20 %	0 %	40 %	40 %	556575388
29	NC_022659	GCGTA	2	10	37267	37276	20 %	20 %	40 %	20 %	556576955
30	NC_022659	ACGCG	2	10	37439	37448	20 %	0 %	40 %	40 %	556576955
31	NC_022659	CGCTG	2	10	38639	38648	0 %	20 %	40 %	40 %	556576955
32	NC_022659	GCGTC	2	10	39888	39897	0 %	20 %	40 %	40 %	556577538
33	NC_022659	CCGTG	2	10	39945	39954	0 %	20 %	40 %	40 %	556577538
34	NC_022659	GCCTT	2	10	40864	40873	0 %	40 %	20 %	40 %	556577804
35	NC_022659	CGCGC	2	10	43296	43305	0 %	0 %	40 %	60 %	556576764
36	NC_022659	CATCG	2	10	43387	43396	20 %	20 %	20 %	40 %	556576764
37	NC_022659	TCGCG	2	10	44566	44575	0 %	20 %	40 %	40 %	556575328
38	NC_022659	ACCGC	2	10	44949	44958	20 %	0 %	20 %	60 %	556575328
39	NC_022659	TCGGC	2	10	47576	47585	0 %	20 %	40 %	40 %	556576902
40	NC_022659	CGGCG	2	10	47679	47688	0 %	0 %	60 %	40 %	556576902
41	NC_022659	ACGAT	2	10	47867	47876	40 %	20 %	20 %	20 %	556576756
42	NC_022659	CCTTT	2	10	48676	48685	0 %	60 %	0 %	40 %	556577536
43	NC_022659	CGACG	2	10	49720	49729	20 %	0 %	40 %	40 %	556577536
44	NC_022659	CGGCG	2	10	50440	50449	0 %	0 %	60 %	40 %	556577536
45	NC_022659	GCGCC	2	10	50637	50646	0 %	0 %	40 %	60 %	556577536
46	NC_022659	CGGCC	2	10	51439	51448	0 %	0 %	40 %	60 %	556576488
47	NC_022659	CGGCT	2	10	53108	53117	0 %	20 %	40 %	40 %	556577608
48	NC_022659	GCTCG	2	10	53784	53793	0 %	20 %	40 %	40 %	556575319
49	NC_022659	CGCGC	2	10	54882	54891	0 %	0 %	40 %	60 %	556577699
50	NC_022659	GCGCC	2	10	55394	55403	0 %	0 %	40 %	60 %	556575252
51	NC_022659	GCGCC	2	10	56467	56476	0 %	0 %	40 %	60 %	556575252
52	NC_022659	GCGAC	2	10	57686	57695	20 %	0 %	40 %	40 %	556575697
53	NC_022659	CCGAG	2	10	57749	57758	20 %	0 %	40 %	40 %	556575697
54	NC_022659	CGGCG	2	10	58059	58068	0 %	0 %	60 %	40 %	556575697
55	NC_022659	GCGCG	2	10	58452	58461	0 %	0 %	60 %	40 %	556577586
56	NC_022659	GGCGC	2	10	60693	60702	0 %	0 %	60 %	40 %	556577754
57	NC_022659	GTGCT	2	10	60769	60778	0 %	40 %	40 %	20 %	556577754
58	NC_022659	TTCGC	2	10	64065	64074	0 %	40 %	20 %	40 %	556577907
59	NC_022659	GCGCC	2	10	64957	64966	0 %	0 %	40 %	60 %	556577146
60	NC_022659	GCGCG	2	10	65011	65020	0 %	0 %	60 %	40 %	556577146
61	NC_022659	CGCGG	2	10	67307	67316	0 %	0 %	60 %	40 %	556577622
62	NC_022659	CGAGC	2	10	68715	68724	20 %	0 %	40 %	40 %	556577948
63	NC_022659	TCGCG	2	10	70139	70148	0 %	20 %	40 %	40 %	556577948
64	NC_022659	CGCTG	2	10	70256	70265	0 %	20 %	40 %	40 %	556577948
65	NC_022659	TTCGA	2	10	70405	70414	20 %	40 %	20 %	20 %	556577948
66	NC_022659	CGTGC	2	10	71972	71981	0 %	20 %	40 %	40 %	556577079
67	NC_022659	ATCCG	2	10	72091	72100	20 %	20 %	20 %	40 %	556577079
68	NC_022659	GCGTT	2	10	72683	72692	0 %	40 %	40 %	20 %	556575246
69	NC_022659	TCGGC	2	10	75904	75913	0 %	20 %	40 %	40 %	556575204
70	NC_022659	GCGTC	2	10	78089	78098	0 %	20 %	40 %	40 %	556576929
71	NC_022659	GCGCC	2	10	78162	78171	0 %	0 %	40 %	60 %	556576929
72	NC_022659	TCGCG	2	10	78185	78194	0 %	20 %	40 %	40 %	556576929
73	NC_022659	CGACG	2	10	78720	78729	20 %	0 %	40 %	40 %	556576929
74	NC_022659	GCGTC	2	10	79865	79874	0 %	20 %	40 %	40 %	556576929
75	NC_022659	CGATC	2	10	80770	80779	20 %	20 %	20 %	40 %	556576265
76	NC_022659	GCCCG	2	10	82302	82311	0 %	0 %	40 %	60 %	556577225
77	NC_022659	GCGAA	2	10	85160	85169	40 %	0 %	40 %	20 %	556575477
78	NC_022659	CCCGA	2	10	86259	86268	20 %	0 %	20 %	60 %	556577748
79	NC_022659	GCTCG	2	10	87098	87107	0 %	20 %	40 %	40 %	556577748
80	NC_022659	CCGCG	2	10	87658	87667	0 %	0 %	40 %	60 %	556577706
81	NC_022659	CGGCT	2	10	88579	88588	0 %	20 %	40 %	40 %	556577706
82	NC_022659	ATCGC	2	10	89044	89053	20 %	20 %	20 %	40 %	556577706
83	NC_022659	TGACG	2	10	89371	89380	20 %	20 %	40 %	20 %	556574741
84	NC_022659	GCGCG	2	10	90004	90013	0 %	0 %	60 %	40 %	556574741
85	NC_022659	TCTCG	2	10	90820	90829	0 %	40 %	20 %	40 %	556574741
86	NC_022659	CGCAG	2	10	91942	91951	20 %	0 %	40 %	40 %	556577135
87	NC_022659	TCGCG	2	10	92194	92203	0 %	20 %	40 %	40 %	556577135
88	NC_022659	AGCGC	2	10	92275	92284	20 %	0 %	40 %	40 %	556577135
89	NC_022659	GCGCG	2	10	92722	92731	0 %	0 %	60 %	40 %	556577135
90	NC_022659	CCCGC	2	10	92995	93004	0 %	0 %	20 %	80 %	556577135
91	NC_022659	ACGTC	2	10	93091	93100	20 %	20 %	20 %	40 %	556577135
92	NC_022659	GCGCC	2	10	94713	94722	0 %	0 %	40 %	60 %	556575125
93	NC_022659	TCGCG	2	10	96108	96117	0 %	20 %	40 %	40 %	556576052
94	NC_022659	CCGCG	2	10	96285	96294	0 %	0 %	40 %	60 %	556576052
95	NC_022659	TCGCC	2	10	96834	96843	0 %	20 %	20 %	60 %	556576052
96	NC_022659	CGTGC	2	10	97597	97606	0 %	20 %	40 %	40 %	556576052
97	NC_022659	CAGCG	2	10	98086	98095	20 %	0 %	40 %	40 %	556575835
98	NC_022659	CGGCG	2	10	98571	98580	0 %	0 %	60 %	40 %	556575835
99	NC_022659	GCGCA	2	10	98599	98608	20 %	0 %	40 %	40 %	556575835
100	NC_022659	CGGCC	2	10	99133	99142	0 %	0 %	40 %	60 %	556576633
101	NC_022659	GACGT	2	10	99559	99568	20 %	20 %	40 %	20 %	556577452
102	NC_022659	CCGCT	2	10	100398	100407	0 %	20 %	20 %	60 %	556574643
103	NC_022659	TCGCC	2	10	101939	101948	0 %	20 %	20 %	60 %	556574746
104	NC_022659	CGCGC	2	10	101964	101973	0 %	0 %	40 %	60 %	556574746
105	NC_022659	CCGCG	2	10	104360	104369	0 %	0 %	40 %	60 %	556576850
106	NC_022659	TGACC	2	10	107352	107361	20 %	20 %	20 %	40 %	556576712
107	NC_022659	GCCGC	2	10	107429	107438	0 %	0 %	40 %	60 %	556576712
108	NC_022659	CGGTG	2	10	108322	108331	0 %	20 %	60 %	20 %	556576712
109	NC_022659	ACCAC	2	10	109971	109980	40 %	0 %	0 %	60 %	556577961
110	NC_022659	TCCAT	2	10	110652	110661	20 %	40 %	0 %	40 %	556577961
111	NC_022659	CGCTG	2	10	111514	111523	0 %	20 %	40 %	40 %	556577961
112	NC_022659	AGCCA	2	10	112045	112054	40 %	0 %	20 %	40 %	556577961
113	NC_022659	CACTC	2	10	112216	112225	20 %	20 %	0 %	60 %	556577961
114	NC_022659	TCGAG	2	10	113340	113349	20 %	20 %	40 %	20 %	556576762
115	NC_022659	GCACC	2	10	114103	114112	20 %	0 %	20 %	60 %	556576181
116	NC_022659	CACCC	2	10	114674	114683	20 %	0 %	0 %	80 %	556576181
117	NC_022659	CGGCG	2	10	115070	115079	0 %	0 %	60 %	40 %	556576181
118	NC_022659	CGCGC	2	10	115766	115775	0 %	0 %	40 %	60 %	556576181
119	NC_022659	GGCTC	2	10	118174	118183	0 %	20 %	40 %	40 %	556577259
120	NC_022659	CGCGC	2	10	119990	119999	0 %	0 %	40 %	60 %	556577169
121	NC_022659	CGGCC	2	10	120314	120323	0 %	0 %	40 %	60 %	556577169
122	NC_022659	GCCGC	2	10	121480	121489	0 %	0 %	40 %	60 %	556577169
123	NC_022659	TGCCC	2	10	126710	126719	0 %	20 %	20 %	60 %	556574852
124	NC_022659	CCCGC	2	10	130522	130531	0 %	0 %	20 %	80 %	556575917
125	NC_022659	GCGCG	2	10	132908	132917	0 %	0 %	60 %	40 %	556575231
126	NC_022659	CCTCG	2	10	136480	136489	0 %	20 %	20 %	60 %	556575310
127	NC_022659	CGATC	2	10	136927	136936	20 %	20 %	20 %	40 %	556575310
128	NC_022659	CGCTG	2	10	137370	137379	0 %	20 %	40 %	40 %	556575310
129	NC_022659	GCGTC	2	10	137517	137526	0 %	20 %	40 %	40 %	556575310
130	NC_022659	ACGGC	2	10	137907	137916	20 %	0 %	40 %	40 %	556575310
131	NC_022659	GGCGC	2	10	140852	140861	0 %	0 %	60 %	40 %	556574792
132	NC_022659	GCCGA	2	10	142194	142203	20 %	0 %	40 %	40 %	556575914
133	NC_022659	TCGGC	2	10	142349	142358	0 %	20 %	40 %	40 %	556575914
134	NC_022659	CGGCG	2	10	142362	142371	0 %	0 %	60 %	40 %	556575914
135	NC_022659	GGCCG	2	10	143357	143366	0 %	0 %	60 %	40 %	556577679
136	NC_022659	GCCGC	2	10	143907	143916	0 %	0 %	40 %	60 %	556577679
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