MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 108493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022659	CGGC	2	8	145630	145637	0 %	0 %	50 %	50 %	556577679
4002	NC_022659	TTCGTG	2	12	145647	145658	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556577679
4003	NC_022659	CGATCG	2	12	145660	145671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556577679
4004	NC_022659	CGAT	2	8	145702	145709	25 %	25 %	25 %	25 %	556577679
4005	NC_022659	CGCC	2	8	145783	145790	0 %	0 %	25 %	75 %	556577679
4006	NC_022659	TCG	2	6	145819	145824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577679
4007	NC_022659	AGC	2	6	145908	145913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577679
4008	NC_022659	CCA	2	6	145984	145989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556577679
4009	NC_022659	CA	3	6	146415	146420	50 %	0 %	0 %	50 %	556575311
4010	NC_022659	GCG	2	6	146480	146485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575311
4011	NC_022659	TCC	2	6	146544	146549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556575311
4012	NC_022659	CG	3	6	146555	146560	0 %	0 %	50 %	50 %	556575311
4013	NC_022659	TGA	2	6	146575	146580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575311
4014	NC_022659	CG	3	6	146613	146618	0 %	0 %	50 %	50 %	556575311
4015	NC_022659	CGA	2	6	146626	146631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575311
4016	NC_022659	GC	3	6	146682	146687	0 %	0 %	50 %	50 %	556575311
4017	NC_022659	GCC	2	6	146708	146713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575311
4018	NC_022659	TTGC	2	8	146735	146742	0 %	50 %	25 %	25 %	556575311
4019	NC_022659	CG	3	6	146750	146755	0 %	0 %	50 %	50 %	556575311
4020	NC_022659	GCG	3	9	146753	146761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575311
4021	NC_022659	CGA	2	6	146779	146784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575311
4022	NC_022659	GGC	2	6	146799	146804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575311
4023	NC_022659	GTC	2	6	146816	146821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575311
4024	NC_022659	CGA	2	6	146842	146847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575311
4025	NC_022659	GCG	2	6	146890	146895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575311
4026	NC_022659	GAT	2	6	146918	146923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575311
4027	NC_022659	CG	3	6	146978	146983	0 %	0 %	50 %	50 %	556575311
4028	NC_022659	CG	3	6	146999	147004	0 %	0 %	50 %	50 %	556575311
4029	NC_022659	TGC	2	6	147042	147047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575311
4030	NC_022659	TCG	2	6	147078	147083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575311
4031	NC_022659	CAC	2	6	147104	147109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556575311
4032	NC_022659	GCC	2	6	148102	148107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577742
4033	NC_022659	CGG	2	6	148112	148117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577742
4034	NC_022659	CCG	2	6	148138	148143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577742
4035	NC_022659	CGC	2	6	148152	148157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577742
4036	NC_022659	TCG	2	6	148187	148192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577742
4037	NC_022659	TCGG	2	8	148244	148251	0 %	25 %	50 %	25 %	556577742
4038	NC_022659	GC	4	8	148314	148321	0 %	0 %	50 %	50 %	556577742
4039	NC_022659	CGG	3	9	148368	148376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577742
4040	NC_022659	GCA	2	6	148388	148393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577742
4041	NC_022659	TGCGCG	2	12	148403	148414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	556577742
4042	NC_022659	CGC	2	6	148417	148422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577742
4043	NC_022659	CAAT	2	8	148428	148435	50 %	25 %	0 %	25 %	556577742
4044	NC_022659	GCC	2	6	148442	148447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577742
4045	NC_022659	CGG	2	6	148485	148490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575653
4046	NC_022659	CG	3	6	148491	148496	0 %	0 %	50 %	50 %	556575653
4047	NC_022659	GCGCC	2	10	148516	148525	0 %	0 %	40 %	60 %	556575653
4048	NC_022659	GCC	2	6	148541	148546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575653
4049	NC_022659	AGC	2	6	148548	148553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575653
4050	NC_022659	GCA	2	6	148573	148578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575653
4051	NC_022659	GC	3	6	148637	148642	0 %	0 %	50 %	50 %	556575653
4052	NC_022659	CGA	2	6	148660	148665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575653
4053	NC_022659	CAG	2	6	148883	148888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4054	NC_022659	GCA	2	6	148894	148899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4055	NC_022659	TCGCC	2	10	148900	148909	0 %	20 %	20 %	60 %	556576375
4056	NC_022659	GCC	3	9	148907	148915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576375
4057	NC_022659	CGT	2	6	148933	148938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4058	NC_022659	TA	3	6	149002	149007	50 %	50 %	0 %	0 %	556576375
4059	NC_022659	TCG	2	6	149097	149102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4060	NC_022659	GAC	2	6	149144	149149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4061	NC_022659	CAT	2	6	149168	149173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576375
4062	NC_022659	CCG	2	6	149259	149264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576375
4063	NC_022659	GCG	2	6	149297	149302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576375
4064	NC_022659	CAT	2	6	149303	149308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576375
4065	NC_022659	CGC	2	6	149309	149314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576375
4066	NC_022659	CG	3	6	149338	149343	0 %	0 %	50 %	50 %	556576375
4067	NC_022659	TCG	2	6	149361	149366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4068	NC_022659	CCG	2	6	149371	149376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576375
4069	NC_022659	CGA	2	6	149386	149391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4070	NC_022659	A	6	6	149439	149444	100 %	0 %	0 %	0 %	556576375
4071	NC_022659	ACG	2	6	149505	149510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4072	NC_022659	CCT	2	6	149521	149526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556576375
4073	NC_022659	CG	3	6	149584	149589	0 %	0 %	50 %	50 %	556576375
4074	NC_022659	TCG	2	6	149622	149627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4075	NC_022659	CGA	2	6	149632	149637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4076	NC_022659	GCA	2	6	149638	149643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4077	NC_022659	GCA	2	6	149652	149657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576375
4078	NC_022659	TCA	2	6	149659	149664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576375
4079	NC_022659	ACG	2	6	150140	150145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
4080	NC_022659	ATCG	2	8	150157	150164	25 %	25 %	25 %	25 %	556576231
4081	NC_022659	TCA	2	6	150177	150182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576231
4082	NC_022659	CGA	2	6	150189	150194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
4083	NC_022659	CG	3	6	150197	150202	0 %	0 %	50 %	50 %	556576231
4084	NC_022659	CGGC	2	8	150204	150211	0 %	0 %	50 %	50 %	556576231
4085	NC_022659	AGC	2	6	150212	150217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
4086	NC_022659	CGA	2	6	150267	150272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
4087	NC_022659	CG	3	6	150293	150298	0 %	0 %	50 %	50 %	556576231
4088	NC_022659	CGC	2	6	150310	150315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576231
4089	NC_022659	CTG	2	6	150424	150429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576231
4090	NC_022659	CGG	2	6	150438	150443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576231
4091	NC_022659	CG	3	6	150551	150556	0 %	0 %	50 %	50 %	556576231
4092	NC_022659	AGG	2	6	150560	150565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556576231
4093	NC_022659	CCG	2	6	150640	150645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576231
4094	NC_022659	CGC	2	6	150651	150656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576231
4095	NC_022659	GTC	2	6	150664	150669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576231
4096	NC_022659	CACG	2	8	150718	150725	25 %	0 %	25 %	50 %	556576231
4097	NC_022659	ACGCGA	2	12	150738	150749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576231
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4100	NC_022659	CGC	2	6	150856	150861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576231
4101	NC_022659	GC	3	6	150972	150977	0 %	0 %	50 %	50 %	556576231
4102	NC_022659	CGG	2	6	150981	150986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576231
4103	NC_022659	CCAT	2	8	151077	151084	25 %	25 %	0 %	50 %	556576231
4104	NC_022659	CCGG	2	8	151433	151440	0 %	0 %	50 %	50 %	556577454
4105	NC_022659	GCG	2	6	151448	151453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577454
4106	NC_022659	CGT	2	6	151530	151535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577454
4107	NC_022659	GC	4	8	151546	151553	0 %	0 %	50 %	50 %	556577454
4108	NC_022659	GCT	2	6	151563	151568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577454
4109	NC_022659	CGC	3	9	151628	151636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577454
4110	NC_022659	CCG	2	6	151673	151678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577454
4111	NC_022659	CGCC	2	8	151702	151709	0 %	0 %	25 %	75 %	556577454
4112	NC_022659	AGAT	2	8	151726	151733	50 %	25 %	25 %	0 %	556577454
4113	NC_022659	GTA	2	6	151737	151742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577454
4114	NC_022659	CGC	2	6	151755	151760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577454
4115	NC_022659	CGG	2	6	151769	151774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577454
4116	NC_022659	ACG	2	6	151799	151804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577454
4117	NC_022659	CCG	3	9	151807	151815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577454
4118	NC_022659	TGCG	2	8	151887	151894	0 %	25 %	50 %	25 %	556577454
4119	NC_022659	GCC	3	9	151914	151922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577454
4120	NC_022659	CG	4	8	151961	151968	0 %	0 %	50 %	50 %	556577454
4121	NC_022659	CGC	2	6	151971	151976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577454
4122	NC_022659	GCA	2	6	151991	151996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577454
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4241	NC_022659	ACG	3	9	158415	158423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577539
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4355	NC_022659	CTG	2	6	161902	161907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575705
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4361	NC_022659	GCT	2	6	162051	162056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575705
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4365	NC_022659	GCT	2	6	162135	162140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575705
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4367	NC_022659	CG	3	6	162179	162184	0 %	0 %	50 %	50 %	556575705
4368	NC_022659	CG	4	8	162293	162300	0 %	0 %	50 %	50 %	556575705
4369	NC_022659	CCGA	2	8	162346	162353	25 %	0 %	25 %	50 %	556575705
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4451	NC_022659	TCGA	2	8	164367	164374	25 %	25 %	25 %	25 %	556574889
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4488	NC_022659	CGC	2	6	165488	165493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574889
4489	NC_022659	GCC	2	6	165494	165499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574889
4490	NC_022659	GGA	2	6	165518	165523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556574889
4491	NC_022659	CCG	2	6	165556	165561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574889
4492	NC_022659	GATCC	2	10	165633	165642	20 %	20 %	20 %	40 %	556574889
4493	NC_022659	CGC	2	6	165645	165650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574889
4494	NC_022659	CAC	2	6	165654	165659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556574889
4495	NC_022659	TGC	2	6	165706	165711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574889
4496	NC_022659	ACG	2	6	165721	165726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574889
4497	NC_022659	GCTC	2	8	165745	165752	0 %	25 %	25 %	50 %	556574889
4498	NC_022659	GC	3	6	165797	165802	0 %	0 %	50 %	50 %	556574889
4499	NC_022659	AAG	2	6	165834	165839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574889
4500	NC_022659	CTG	2	6	165840	165845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574889

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