MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 108493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_022659	CCGCG	2	10	104360	104369	0 %	0 %	40 %	60 %	556576850
3003	NC_022659	GC	4	8	104373	104380	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3004	NC_022659	CG	5	10	104385	104394	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3005	NC_022659	GC	3	6	104427	104432	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3006	NC_022659	GCT	2	6	104460	104465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576850
3007	NC_022659	GTC	3	9	104482	104490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576850
3008	NC_022659	CGGC	2	8	104503	104510	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3009	NC_022659	CTG	2	6	104548	104553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576850
3010	NC_022659	CCG	2	6	104591	104596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576850
3011	NC_022659	CG	4	8	104639	104646	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3012	NC_022659	GC	5	10	104647	104656	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3013	NC_022659	GCA	2	6	104712	104717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576850
3014	NC_022659	GAC	2	6	104739	104744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576850
3015	NC_022659	CGA	2	6	104757	104762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576850
3016	NC_022659	GCG	2	6	104784	104789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576850
3017	NC_022659	CAT	2	6	104790	104795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576850
3018	NC_022659	GC	5	10	104809	104818	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3019	NC_022659	CG	4	8	104844	104851	0 %	0 %	50 %	50 %	556576850
3020	NC_022659	ACCT	2	8	105333	105340	25 %	25 %	0 %	50 %	556575250
3021	NC_022659	TGA	2	6	105367	105372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556575250
3022	NC_022659	GCG	2	6	105384	105389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556575250
3023	NC_022659	GC	3	6	105399	105404	0 %	0 %	50 %	50 %	556575250
3024	NC_022659	TCG	2	6	105433	105438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575250
3025	NC_022659	ACG	2	6	105453	105458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575250
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3027	NC_022659	TGC	2	6	105484	105489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575250
3028	NC_022659	CGGCCG	2	12	105548	105559	0 %	0 %	50 %	50 %	556575250
3029	NC_022659	CGC	2	6	105590	105595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575250
3030	NC_022659	TCG	2	6	105598	105603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575250
3031	NC_022659	GC	4	8	105903	105910	0 %	0 %	50 %	50 %	556576558
3032	NC_022659	TGCCGC	2	12	105918	105929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556576558
3033	NC_022659	GC	3	6	105972	105977	0 %	0 %	50 %	50 %	556576558
3034	NC_022659	GC	3	6	106011	106016	0 %	0 %	50 %	50 %	556576558
3035	NC_022659	CAG	2	6	106027	106032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576558
3036	NC_022659	CAG	3	9	106123	106131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576558
3037	NC_022659	CGAT	2	8	106143	106150	25 %	25 %	25 %	25 %	556576558
3038	NC_022659	CGA	2	6	107043	107048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3039	NC_022659	CGA	2	6	107103	107108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3040	NC_022659	CCGA	2	8	107156	107163	25 %	0 %	25 %	50 %	556576712
3041	NC_022659	GC	3	6	107238	107243	0 %	0 %	50 %	50 %	556576712
3042	NC_022659	GCGCGA	2	12	107277	107288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556576712
3043	NC_022659	CG	3	6	107292	107297	0 %	0 %	50 %	50 %	556576712
3044	NC_022659	CCAT	2	8	107342	107349	25 %	25 %	0 %	50 %	556576712
3045	NC_022659	TGACC	2	10	107352	107361	20 %	20 %	20 %	40 %	556576712
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3047	NC_022659	GCCGC	2	10	107429	107438	0 %	0 %	40 %	60 %	556576712
3048	NC_022659	CGA	2	6	107439	107444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
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3050	NC_022659	CGA	3	9	107553	107561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3051	NC_022659	CCG	2	6	107621	107626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576712
3052	NC_022659	ACG	2	6	107627	107632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3053	NC_022659	CGC	2	6	107633	107638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576712
3054	NC_022659	CGAC	2	8	107646	107653	25 %	0 %	25 %	50 %	556576712
3055	NC_022659	ATG	2	6	107678	107683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576712
3056	NC_022659	CGA	2	6	107691	107696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3057	NC_022659	GCA	2	6	107760	107765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3058	NC_022659	GC	3	6	107768	107773	0 %	0 %	50 %	50 %	556576712
3059	NC_022659	GGC	2	6	107780	107785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576712
3060	NC_022659	CGA	2	6	107802	107807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3061	NC_022659	CCTG	2	8	107853	107860	0 %	25 %	25 %	50 %	556576712
3062	NC_022659	ATC	2	6	107888	107893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576712
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3065	NC_022659	GAT	2	6	107992	107997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576712
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3069	NC_022659	CGA	2	6	108225	108230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576712
3070	NC_022659	TGC	2	6	108294	108299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576712
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3072	NC_022659	CGGTG	2	10	108322	108331	0 %	20 %	60 %	20 %	556576712
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3092	NC_022659	GAC	2	6	110318	110323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577961
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3094	NC_022659	CGC	2	6	110464	110469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577961
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3098	NC_022659	TGA	2	6	110612	110617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577961
3099	NC_022659	TCCAT	2	10	110652	110661	20 %	40 %	0 %	40 %	556577961
3100	NC_022659	ACC	2	6	110684	110689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556577961
3101	NC_022659	GTAA	2	8	110696	110703	50 %	25 %	25 %	0 %	556577961
3102	NC_022659	GC	3	6	110705	110710	0 %	0 %	50 %	50 %	556577961
3103	NC_022659	AT	3	6	110721	110726	50 %	50 %	0 %	0 %	556577961
3104	NC_022659	GCCA	2	8	110750	110757	25 %	0 %	25 %	50 %	556577961
3105	NC_022659	TCA	2	6	110841	110846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577961
3106	NC_022659	TTA	2	6	110871	110876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556577961
3107	NC_022659	A	7	7	110939	110945	100 %	0 %	0 %	0 %	556577961
3108	NC_022659	CTC	2	6	111069	111074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577961
3109	NC_022659	CTT	2	6	111194	111199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577961
3110	NC_022659	TCGC	2	8	111234	111241	0 %	25 %	25 %	50 %	556577961
3111	NC_022659	GCC	2	6	111292	111297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577961
3112	NC_022659	TCA	2	6	111322	111327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556577961
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3114	NC_022659	CTTC	2	8	111442	111449	0 %	50 %	0 %	50 %	556577961
3115	NC_022659	CAG	2	6	111461	111466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577961
3116	NC_022659	CGCTG	2	10	111514	111523	0 %	20 %	40 %	40 %	556577961
3117	NC_022659	GTC	2	6	111563	111568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
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3120	NC_022659	CCG	2	6	111721	111726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577961
3121	NC_022659	ACG	2	6	111748	111753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577961
3122	NC_022659	GC	3	6	111768	111773	0 %	0 %	50 %	50 %	556577961
3123	NC_022659	TCG	3	9	111775	111783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
3124	NC_022659	GCA	2	6	111826	111831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577961
3125	NC_022659	GCC	2	6	111846	111851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577961
3126	NC_022659	GCC	3	9	111938	111946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577961
3127	NC_022659	TGC	2	6	111953	111958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
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3129	NC_022659	TCG	2	6	112060	112065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
3130	NC_022659	TCG	2	6	112069	112074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
3131	NC_022659	GC	3	6	112094	112099	0 %	0 %	50 %	50 %	556577961
3132	NC_022659	CGG	2	6	112154	112159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577961
3133	NC_022659	CACTC	2	10	112216	112225	20 %	20 %	0 %	60 %	556577961
3134	NC_022659	GC	3	6	112229	112234	0 %	0 %	50 %	50 %	556577961
3135	NC_022659	TCG	2	6	112236	112241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
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3137	NC_022659	CGT	2	6	112274	112279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577961
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3142	NC_022659	TCG	2	6	112520	112525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576762
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3144	NC_022659	TCG	2	6	112586	112591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576762
3145	NC_022659	GCC	2	6	112605	112610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576762
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3150	NC_022659	GCA	2	6	112818	112823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576762
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3153	NC_022659	ACC	2	6	112896	112901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556576762
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3200	NC_022659	TCG	2	6	114405	114410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576181
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3205	NC_022659	TGC	2	6	114561	114566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576181
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3207	NC_022659	CG	3	6	114661	114666	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
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3217	NC_022659	ACG	2	6	114861	114866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576181
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3225	NC_022659	CGGCG	2	10	115070	115079	0 %	0 %	60 %	40 %	556576181
3226	NC_022659	CG	4	8	115145	115152	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
3227	NC_022659	GCAG	2	8	115168	115175	25 %	0 %	50 %	25 %	556576181
3228	NC_022659	GAT	2	6	115204	115209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576181
3229	NC_022659	TGC	2	6	115252	115257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576181
3230	NC_022659	TGC	3	9	115299	115307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576181
3231	NC_022659	GC	4	8	115306	115313	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
3232	NC_022659	CG	5	10	115391	115400	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
3233	NC_022659	CG	5	10	115439	115448	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
3234	NC_022659	CGC	2	6	115467	115472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576181
3235	NC_022659	GTC	3	9	115505	115513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576181
3236	NC_022659	TGA	2	6	115521	115526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576181
3237	NC_022659	CGA	2	6	115531	115536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576181
3238	NC_022659	GC	4	8	115608	115615	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
3239	NC_022659	AGA	2	6	115639	115644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556576181
3240	NC_022659	CTC	2	6	115649	115654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556576181
3241	NC_022659	CGC	2	6	115727	115732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576181
3242	NC_022659	CGCGC	2	10	115766	115775	0 %	0 %	40 %	60 %	556576181
3243	NC_022659	CGG	2	6	115782	115787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576181
3244	NC_022659	CGA	2	6	115807	115812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576181
3245	NC_022659	CGA	3	9	115873	115881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576181
3246	NC_022659	GCC	2	6	115898	115903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576181
3247	NC_022659	CGA	2	6	115912	115917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576181
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3250	NC_022659	GC	3	6	115952	115957	0 %	0 %	50 %	50 %	556576181
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3252	NC_022659	GCC	2	6	116063	116068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576181
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3355	NC_022659	TTG	2	6	120660	120665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556577169
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3361	NC_022659	CGT	2	6	120868	120873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3362	NC_022659	GCA	2	6	120889	120894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3363	NC_022659	GCT	2	6	120916	120921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3364	NC_022659	GCGAGC	2	12	120933	120944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556577169
3365	NC_022659	TCG	2	6	120948	120953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3366	NC_022659	TCG	2	6	120964	120969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3367	NC_022659	CGA	2	6	120970	120975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577169
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3369	NC_022659	GC	4	8	121081	121088	0 %	0 %	50 %	50 %	556577169
3370	NC_022659	ACG	2	6	121098	121103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577169
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3372	NC_022659	GTC	2	6	121199	121204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3373	NC_022659	GTCGAC	2	12	121316	121327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556577169
3374	NC_022659	CGC	2	6	121421	121426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577169
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3377	NC_022659	GCG	2	6	121501	121506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577169
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3379	NC_022659	GCG	2	6	121662	121667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577169
3380	NC_022659	GCTC	2	8	121781	121788	0 %	25 %	25 %	50 %	556576624
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3383	NC_022659	CG	3	6	121876	121881	0 %	0 %	50 %	50 %	556576624
3384	NC_022659	GCC	2	6	121976	121981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576624
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3391	NC_022659	CGT	2	6	122302	122307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576624
3392	NC_022659	TCG	2	6	122310	122315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576624
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3403	NC_022659	CTG	2	6	122890	122895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576624
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3485	NC_022659	CGC	2	6	127565	127570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574852
3486	NC_022659	CGC	2	6	127574	127579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574852
3487	NC_022659	CCG	2	6	127594	127599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574852
3488	NC_022659	CTG	2	6	127668	127673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574852
3489	NC_022659	CTCG	2	8	127686	127693	0 %	25 %	25 %	50 %	556574852
3490	NC_022659	CG	4	8	127707	127714	0 %	0 %	50 %	50 %	556574852
3491	NC_022659	CGA	3	9	127829	127837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574852
3492	NC_022659	GC	3	6	127847	127852	0 %	0 %	50 %	50 %	556574852
3493	NC_022659	TCC	2	6	127894	127899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556574852
3494	NC_022659	CG	3	6	127922	127927	0 %	0 %	50 %	50 %	556574852
3495	NC_022659	GCG	2	6	127930	127935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574852
3496	NC_022659	GCC	2	6	127953	127958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574852
3497	NC_022659	CG	4	8	127979	127986	0 %	0 %	50 %	50 %	556574852
3498	NC_022659	GGC	2	6	127999	128004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574852
3499	NC_022659	TTG	2	6	128053	128058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556574852
3500	NC_022659	CG	3	6	128075	128080	0 %	0 %	50 %	50 %	556574852

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