MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 108493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_022659	GC	3	6	36830	36835	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1003	NC_022659	TCA	2	6	36839	36844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576955
1004	NC_022659	TCG	2	6	36874	36879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1005	NC_022659	ACG	2	6	36884	36889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1006	NC_022659	GATGCG	2	12	36894	36905	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556576955
1007	NC_022659	GCCTGC	2	12	36910	36921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556576955
1008	NC_022659	TCG	2	6	36931	36936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1009	NC_022659	CG	5	10	36996	37005	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1010	NC_022659	TCG	2	6	37018	37023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1011	NC_022659	GC	3	6	37059	37064	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1012	NC_022659	AGC	2	6	37066	37071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1013	NC_022659	CG	3	6	37073	37078	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1014	NC_022659	CGA	2	6	37112	37117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1015	NC_022659	CGA	2	6	37128	37133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1016	NC_022659	GCG	2	6	37136	37141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576955
1017	NC_022659	CAG	2	6	37158	37163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1018	NC_022659	CCT	2	6	37172	37177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556576955
1019	NC_022659	CGA	2	6	37214	37219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1020	NC_022659	GCGTA	2	10	37267	37276	20 %	20 %	40 %	20 %	556576955
1021	NC_022659	GAT	2	6	37280	37285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576955
1022	NC_022659	CGT	2	6	37328	37333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1023	NC_022659	CG	3	6	37343	37348	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1024	NC_022659	CGGC	2	8	37361	37368	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1025	NC_022659	GTGC	2	8	37371	37378	0 %	25 %	50 %	25 %	556576955
1026	NC_022659	ACGA	2	8	37420	37427	50 %	0 %	25 %	25 %	556576955
1027	NC_022659	ACGCG	2	10	37439	37448	20 %	0 %	40 %	40 %	556576955
1028	NC_022659	GCC	2	6	37454	37459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576955
1029	NC_022659	CG	3	6	37483	37488	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1030	NC_022659	CGC	2	6	37500	37505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576955
1031	NC_022659	ACG	3	9	37543	37551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1032	NC_022659	CGC	2	6	37652	37657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576955
1033	NC_022659	CG	3	6	37673	37678	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1034	NC_022659	GCA	2	6	37688	37693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1035	NC_022659	TCG	2	6	37702	37707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
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1037	NC_022659	ACAGCC	2	12	37814	37825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556576955
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1039	NC_022659	AGCG	2	8	37891	37898	25 %	0 %	50 %	25 %	556576955
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1041	NC_022659	ACG	2	6	37933	37938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1042	NC_022659	GCA	2	6	37943	37948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1043	NC_022659	AGCC	2	8	37966	37973	25 %	0 %	25 %	50 %	556576955
1044	NC_022659	CG	3	6	37989	37994	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1045	NC_022659	TCA	2	6	38000	38005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576955
1046	NC_022659	CGA	2	6	38108	38113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
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1048	NC_022659	CGA	2	6	38165	38170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
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1050	NC_022659	GTC	2	6	38235	38240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
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1052	NC_022659	CG	3	6	38263	38268	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1053	NC_022659	GCCCGC	2	12	38418	38429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576955
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1055	NC_022659	CTC	2	6	38484	38489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556576955
1056	NC_022659	CAG	2	6	38496	38501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1057	NC_022659	GC	3	6	38543	38548	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1058	NC_022659	GTC	2	6	38550	38555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1059	NC_022659	CGT	2	6	38579	38584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1060	NC_022659	GAC	2	6	38586	38591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
1061	NC_022659	GCC	2	6	38593	38598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576955
1062	NC_022659	GC	3	6	38615	38620	0 %	0 %	50 %	50 %	556576955
1063	NC_022659	CGCTG	2	10	38639	38648	0 %	20 %	40 %	40 %	556576955
1064	NC_022659	CGA	2	6	38693	38698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556576955
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1083	NC_022659	CG	4	8	39295	39302	0 %	0 %	50 %	50 %	556577538
1084	NC_022659	CG	4	8	39348	39355	0 %	0 %	50 %	50 %	556577538
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1092	NC_022659	CGA	2	6	39648	39653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577538
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1095	NC_022659	GATC	2	8	39786	39793	25 %	25 %	25 %	25 %	556577538
1096	NC_022659	GGC	2	6	39803	39808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577538
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1099	NC_022659	CT	3	6	39936	39941	0 %	50 %	0 %	50 %	556577538
1100	NC_022659	CCGTG	2	10	39945	39954	0 %	20 %	40 %	40 %	556577538
1101	NC_022659	CG	3	6	39995	40000	0 %	0 %	50 %	50 %	556577538
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1106	NC_022659	CGT	2	6	40110	40115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577538
1107	NC_022659	CGC	2	6	40125	40130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577538
1108	NC_022659	CGT	2	6	40135	40140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577538
1109	NC_022659	ACCG	2	8	40157	40164	25 %	0 %	25 %	50 %	556577538
1110	NC_022659	GCG	3	9	40181	40189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577538
1111	NC_022659	TGC	2	6	40190	40195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577538
1112	NC_022659	CG	4	8	40254	40261	0 %	0 %	50 %	50 %	556577538
1113	NC_022659	TAGCCG	2	12	40300	40311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556577804
1114	NC_022659	GCA	2	6	40364	40369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577804
1115	NC_022659	GC	4	8	40439	40446	0 %	0 %	50 %	50 %	556577804
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1119	NC_022659	GCA	2	6	40613	40618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577804
1120	NC_022659	GC	5	10	40629	40638	0 %	0 %	50 %	50 %	556577804
1121	NC_022659	ACG	2	6	40663	40668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577804
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1124	NC_022659	GAT	2	6	40734	40739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556577804
1125	NC_022659	CGAGCA	2	12	40817	40828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577804
1126	NC_022659	CTT	2	6	40854	40859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556577804
1127	NC_022659	GCCTT	2	10	40864	40873	0 %	40 %	20 %	40 %	556577804
1128	NC_022659	CGG	2	6	40898	40903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577804
1129	NC_022659	CTGA	2	8	40914	40921	25 %	25 %	25 %	25 %	556577804
1130	NC_022659	TGC	2	6	41344	41349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577116
1131	NC_022659	GGC	2	6	41363	41368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556577116
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1134	NC_022659	GC	3	6	41531	41536	0 %	0 %	50 %	50 %	556577116
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1139	NC_022659	CGT	2	6	41996	42001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577250
1140	NC_022659	CGA	2	6	42002	42007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577250
1141	NC_022659	CGA	2	6	42010	42015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577250
1142	NC_022659	CG	3	6	42125	42130	0 %	0 %	50 %	50 %	556577250
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1244	NC_022659	CG	3	6	44943	44948	0 %	0 %	50 %	50 %	556575328
1245	NC_022659	ACCGC	2	10	44949	44958	20 %	0 %	20 %	60 %	556575328
1246	NC_022659	GGCC	2	8	44968	44975	0 %	0 %	50 %	50 %	556575328
1247	NC_022659	GCT	2	6	45001	45006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575328
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1250	NC_022659	CGC	2	6	45124	45129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556575328
1251	NC_022659	CAT	2	6	45158	45163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556575328
1252	NC_022659	TCG	2	6	45180	45185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575328
1253	NC_022659	GCA	2	6	45247	45252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556575328
1254	NC_022659	TCG	2	6	45255	45260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575328
1255	NC_022659	CGGC	2	8	45262	45269	0 %	0 %	50 %	50 %	556575328
1256	NC_022659	G	7	7	45276	45282	0 %	0 %	100 %	0 %	556575328
1257	NC_022659	GTC	2	6	45287	45292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556575328
1258	NC_022659	GC	3	6	45569	45574	0 %	0 %	50 %	50 %	556574621
1259	NC_022659	CGC	2	6	45581	45586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574621
1260	NC_022659	CGG	2	6	45598	45603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574621
1261	NC_022659	GCG	2	6	45610	45615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574621
1262	NC_022659	GGC	2	6	45632	45637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574621
1263	NC_022659	GC	4	8	45640	45647	0 %	0 %	50 %	50 %	556574621
1264	NC_022659	CGATTC	2	12	45671	45682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556574621
1265	NC_022659	GTG	2	6	45683	45688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574621
1266	NC_022659	CCG	2	6	45756	45761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574621
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1268	NC_022659	CG	4	8	45806	45813	0 %	0 %	50 %	50 %	556574621
1269	NC_022659	ACG	2	6	45817	45822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1270	NC_022659	ACG	2	6	45831	45836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1271	NC_022659	ACG	2	6	45847	45852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1272	NC_022659	GAA	2	6	45857	45862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574621
1273	NC_022659	GAA	2	6	45869	45874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574621
1274	NC_022659	GAA	2	6	45884	45889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574621
1275	NC_022659	GAA	2	6	45921	45926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574621
1276	NC_022659	GC	3	6	45931	45936	0 %	0 %	50 %	50 %	556574621
1277	NC_022659	CATG	2	8	45950	45957	25 %	25 %	25 %	25 %	556574621
1278	NC_022659	CGG	2	6	45988	45993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574621
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1280	NC_022659	CGA	2	6	46117	46122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1281	NC_022659	CCGA	2	8	46140	46147	25 %	0 %	25 %	50 %	556574621
1282	NC_022659	CGC	2	6	46223	46228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574621
1283	NC_022659	GCA	2	6	46247	46252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1284	NC_022659	TTC	2	6	46275	46280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556574621
1285	NC_022659	CGA	2	6	46298	46303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1286	NC_022659	GCG	2	6	46324	46329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574621
1287	NC_022659	CAG	2	6	46350	46355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1288	NC_022659	TCGCGA	2	12	46390	46401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556574621
1289	NC_022659	ACC	2	6	46413	46418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556574621
1290	NC_022659	CGT	2	6	46495	46500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574621
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1292	NC_022659	TCA	2	6	46534	46539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556574621
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1294	NC_022659	GCAC	2	8	46719	46726	25 %	0 %	25 %	50 %	556576902
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1297	NC_022659	GCG	2	6	46769	46774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576902
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1300	NC_022659	CAT	2	6	46893	46898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576902
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1305	NC_022659	GTTCGC	2	12	47067	47078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576902
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1310	NC_022659	TGC	2	6	47375	47380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576902
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1322	NC_022659	GC	3	6	47693	47698	0 %	0 %	50 %	50 %	556576902
1323	NC_022659	CGT	2	6	47709	47714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576902
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1326	NC_022659	GCC	2	6	47813	47818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576902
1327	NC_022659	ACGAT	2	10	47867	47876	40 %	20 %	20 %	20 %	556576756
1328	NC_022659	GCG	2	6	47951	47956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576756
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1331	NC_022659	TCG	2	6	48050	48055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576756
1332	NC_022659	GCT	2	6	48141	48146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556576756
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1338	NC_022659	GCG	2	6	48311	48316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556576756
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1342	NC_022659	CCG	2	6	48386	48391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576756
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1349	NC_022659	ATG	2	6	48586	48591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556576756
1350	NC_022659	GCGG	2	8	48592	48599	0 %	0 %	75 %	25 %	556576756
1351	NC_022659	AGA	2	6	48611	48616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556576756
1352	NC_022659	CCTTT	2	10	48676	48685	0 %	60 %	0 %	40 %	556577536
1353	NC_022659	GCA	2	6	48745	48750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577536
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1359	NC_022659	CG	4	8	48907	48914	0 %	0 %	50 %	50 %	556577536
1360	NC_022659	CACCGA	2	12	48940	48951	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556577536
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1362	NC_022659	CGA	2	6	49042	49047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577536
1363	NC_022659	GAC	2	6	49049	49054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577536
1364	NC_022659	CGA	2	6	49057	49062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556577536
1365	NC_022659	TCG	2	6	49076	49081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577536
1366	NC_022659	CTC	2	6	49088	49093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577536
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1368	NC_022659	GC	3	6	49129	49134	0 %	0 %	50 %	50 %	556577536
1369	NC_022659	GCC	2	6	49137	49142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556577536
1370	NC_022659	GC	3	6	49143	49148	0 %	0 %	50 %	50 %	556577536
1371	NC_022659	CG	3	6	49156	49161	0 %	0 %	50 %	50 %	556577536
1372	NC_022659	CGAA	2	8	49254	49261	50 %	0 %	25 %	25 %	556577536
1373	NC_022659	CGT	2	6	49303	49308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556577536
1374	NC_022659	GAG	2	6	49319	49324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556577536
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1376	NC_022659	CTC	2	6	49355	49360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556577536
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1497	NC_022659	CGC	2	6	52595	52600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556576488
1498	NC_022659	GC	4	8	52599	52606	0 %	0 %	50 %	50 %	556576488
1499	NC_022659	ATC	2	6	52646	52651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556576488
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