MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 90543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022658	GCA	2	6	110342	110347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3002	NC_022658	CG	3	6	110365	110370	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3003	NC_022658	CAG	2	6	110379	110384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3004	NC_022658	CCG	2	6	110408	110413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572366
3005	NC_022658	GC	4	8	110420	110427	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3006	NC_022658	GC	3	6	110432	110437	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3007	NC_022658	AGT	2	6	110447	110452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572366
3008	NC_022658	CGGC	2	8	110465	110472	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3009	NC_022658	CG	4	8	110546	110553	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3010	NC_022658	GCGT	2	8	110557	110564	0 %	25 %	50 %	25 %	556572366
3011	NC_022658	AGC	2	6	110602	110607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3012	NC_022658	GC	3	6	110612	110617	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3013	NC_022658	CGCGC	2	10	110652	110661	0 %	0 %	40 %	60 %	556572366
3014	NC_022658	GC	3	6	110667	110672	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3015	NC_022658	CGC	2	6	110708	110713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572366
3016	NC_022658	GC	3	6	110712	110717	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3017	NC_022658	TCA	2	6	110726	110731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572366
3018	NC_022658	TCGA	2	8	110746	110753	25 %	25 %	25 %	25 %	556572366
3019	NC_022658	GC	3	6	110764	110769	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3020	NC_022658	GCC	2	6	110772	110777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572366
3021	NC_022658	CGC	2	6	110790	110795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572366
3022	NC_022658	GTT	2	6	110796	110801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556572366
3023	NC_022658	GCC	2	6	110817	110822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572366
3024	NC_022658	CG	4	8	110828	110835	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3025	NC_022658	TCG	2	6	110839	110844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3026	NC_022658	GGC	2	6	110850	110855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572366
3027	NC_022658	CGT	2	6	110897	110902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3028	NC_022658	CGCC	2	8	110975	110982	0 %	0 %	25 %	75 %	556572366
3029	NC_022658	CGA	2	6	110984	110989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3030	NC_022658	CGA	2	6	110996	111001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572366
3031	NC_022658	CG	4	8	111017	111024	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3032	NC_022658	CGG	2	6	111043	111048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572366
3033	NC_022658	GC	3	6	111074	111079	0 %	0 %	50 %	50 %	556572366
3034	NC_022658	GC	3	6	111084	111089	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3035	NC_022658	CCG	2	6	111091	111096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572262
3036	NC_022658	CG	3	6	111110	111115	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3037	NC_022658	GCG	2	6	111129	111134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572262
3038	NC_022658	GC	4	8	111145	111152	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3039	NC_022658	GCA	2	6	111157	111162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572262
3040	NC_022658	CCG	2	6	111164	111169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572262
3041	NC_022658	CG	3	6	111172	111177	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3042	NC_022658	CG	4	8	111214	111221	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3043	NC_022658	TCG	3	9	111369	111377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572262
3044	NC_022658	CGA	2	6	111394	111399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572262
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3046	NC_022658	CGA	2	6	111700	111705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572262
3047	NC_022658	TCG	2	6	111708	111713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572262
3048	NC_022658	GCG	2	6	111724	111729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572262
3049	NC_022658	CGT	2	6	111745	111750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572262
3050	NC_022658	CTC	2	6	111782	111787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572262
3051	NC_022658	CGGC	2	8	111838	111845	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3052	NC_022658	CCG	3	9	111861	111869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572262
3053	NC_022658	ACGCG	2	10	111895	111904	20 %	0 %	40 %	40 %	556572262
3054	NC_022658	GC	4	8	111932	111939	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3055	NC_022658	GC	3	6	112033	112038	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3056	NC_022658	AGT	2	6	112072	112077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572262
3057	NC_022658	CG	3	6	112100	112105	0 %	0 %	50 %	50 %	556572262
3058	NC_022658	GCG	2	6	112195	112200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574285
3059	NC_022658	CGG	2	6	112220	112225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574285
3060	NC_022658	GC	3	6	112244	112249	0 %	0 %	50 %	50 %	556574285
3061	NC_022658	CGA	2	6	112274	112279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574285
3062	NC_022658	CGC	2	6	112298	112303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574285
3063	NC_022658	TCGGC	2	10	112352	112361	0 %	20 %	40 %	40 %	556574285
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3065	NC_022658	GCG	2	6	112439	112444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574285
3066	NC_022658	CG	3	6	112443	112448	0 %	0 %	50 %	50 %	556574285
3067	NC_022658	GTC	2	6	112480	112485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574285
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3069	NC_022658	GCC	2	6	112558	112563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573968
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3074	NC_022658	GCA	2	6	113262	113267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574433
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3082	NC_022658	GCG	2	6	113446	113451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574433
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3092	NC_022658	GCCGG	2	10	113910	113919	0 %	0 %	60 %	40 %	556574433
3093	NC_022658	GAA	2	6	113960	113965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574433
3094	NC_022658	GCT	2	6	114008	114013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574433
3095	NC_022658	CG	3	6	114031	114036	0 %	0 %	50 %	50 %	556574433
3096	NC_022658	ACG	2	6	114079	114084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574433
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3098	NC_022658	GCCG	2	8	114150	114157	0 %	0 %	50 %	50 %	556574433
3099	NC_022658	TTC	2	6	114264	114269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556574433
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3104	NC_022658	GCCGC	2	10	114740	114749	0 %	0 %	40 %	60 %	556572204
3105	NC_022658	CGA	2	6	114759	114764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
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3107	NC_022658	CGC	2	6	114820	114825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572204
3108	NC_022658	CCG	2	6	114864	114869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572204
3109	NC_022658	CG	3	6	114914	114919	0 %	0 %	50 %	50 %	556572204
3110	NC_022658	TCG	2	6	114944	114949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3111	NC_022658	GT	3	6	114962	114967	0 %	50 %	50 %	0 %	556572204
3112	NC_022658	TCGCG	2	10	115011	115020	0 %	20 %	40 %	40 %	556572204
3113	NC_022658	CGA	2	6	115131	115136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3114	NC_022658	ACG	2	6	115139	115144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3115	NC_022658	CGG	2	6	115148	115153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572204
3116	NC_022658	CAG	2	6	115162	115167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3117	NC_022658	GC	3	6	115212	115217	0 %	0 %	50 %	50 %	556572204
3118	NC_022658	GCA	2	6	115263	115268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3119	NC_022658	CG	3	6	115303	115308	0 %	0 %	50 %	50 %	556572204
3120	NC_022658	GCA	2	6	115338	115343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3121	NC_022658	CGT	3	9	115351	115359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572204
3122	NC_022658	GC	3	6	115392	115397	0 %	0 %	50 %	50 %	556572204
3123	NC_022658	CG	4	8	115410	115417	0 %	0 %	50 %	50 %	556572204
3124	NC_022658	ACG	2	6	115467	115472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
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3127	NC_022658	GC	4	8	115516	115523	0 %	0 %	50 %	50 %	556572204
3128	NC_022658	GCA	2	6	115529	115534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572204
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3230	NC_022658	CG	3	6	119596	119601	0 %	0 %	50 %	50 %	556574173
3231	NC_022658	CAG	2	6	119661	119666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574173
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3233	NC_022658	ACG	2	6	119832	119837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572892
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3236	NC_022658	CAGCA	2	10	119958	119967	40 %	0 %	20 %	40 %	556572892
3237	NC_022658	TCA	2	6	120034	120039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572892
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3239	NC_022658	CGGT	2	8	120108	120115	0 %	25 %	50 %	25 %	556572892
3240	NC_022658	CG	3	6	120120	120125	0 %	0 %	50 %	50 %	556572892
3241	NC_022658	CG	3	6	120148	120153	0 %	0 %	50 %	50 %	556572892
3242	NC_022658	CG	4	8	120196	120203	0 %	0 %	50 %	50 %	556572892
3243	NC_022658	CGT	2	6	120215	120220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572892
3244	NC_022658	TCGC	2	8	120225	120232	0 %	25 %	25 %	50 %	556572892
3245	NC_022658	GC	3	6	120268	120273	0 %	0 %	50 %	50 %	556572892
3246	NC_022658	TCCA	2	8	120324	120331	25 %	25 %	0 %	50 %	556572892
3247	NC_022658	CGA	2	6	120358	120363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572892
3248	NC_022658	AGC	2	6	120400	120405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572892
3249	NC_022658	AGCCG	2	10	120415	120424	20 %	0 %	40 %	40 %	556572892
3250	NC_022658	GCT	3	9	120454	120462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572892
3251	NC_022658	TCG	2	6	120712	120717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572537
3252	NC_022658	GCGA	2	8	120726	120733	25 %	0 %	50 %	25 %	556572537
3253	NC_022658	CGGCG	2	10	120785	120794	0 %	0 %	60 %	40 %	556572537
3254	NC_022658	GCA	2	6	120868	120873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572537
3255	NC_022658	AACTG	2	10	120952	120961	40 %	20 %	20 %	20 %	556572537
3256	NC_022658	CCG	2	6	120967	120972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572537
3257	NC_022658	CCG	2	6	120976	120981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572537
3258	NC_022658	TCG	2	6	120989	120994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572537
3259	NC_022658	GGC	2	6	121300	121305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573286
3260	NC_022658	TCG	2	6	121335	121340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3261	NC_022658	AGC	2	6	121341	121346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3262	NC_022658	CGA	2	6	121402	121407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3263	NC_022658	CGA	3	9	121429	121437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3264	NC_022658	GCT	2	6	121462	121467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3265	NC_022658	CGA	2	6	121470	121475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3266	NC_022658	CCCG	2	8	121476	121483	0 %	0 %	25 %	75 %	556573286
3267	NC_022658	CTG	2	6	121487	121492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3268	NC_022658	CCG	3	9	121542	121550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573286
3269	NC_022658	CGC	2	6	121570	121575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573286
3270	NC_022658	GGC	2	6	121598	121603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573286
3271	NC_022658	CGC	2	6	121633	121638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573286
3272	NC_022658	CGT	2	6	121639	121644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3273	NC_022658	CG	3	6	121654	121659	0 %	0 %	50 %	50 %	556573286
3274	NC_022658	CCG	2	6	121714	121719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573286
3275	NC_022658	CGGG	2	8	121739	121746	0 %	0 %	75 %	25 %	556573286
3276	NC_022658	GCA	2	6	121753	121758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3277	NC_022658	GTC	2	6	121775	121780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573286
3278	NC_022658	CGC	2	6	121813	121818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573286
3279	NC_022658	GCT	2	6	121834	121839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573286
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3281	NC_022658	CGCC	2	8	121848	121855	0 %	0 %	25 %	75 %	556573286
3282	NC_022658	GCC	2	6	121859	121864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573286
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3285	NC_022658	GCC	2	6	122078	122083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574215
3286	NC_022658	CGA	3	9	122120	122128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574215
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3289	NC_022658	GCT	2	6	122228	122233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574215
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3293	NC_022658	CCGGCA	2	12	122304	122315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556574215
3294	NC_022658	CCG	2	6	122330	122335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574215
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3297	NC_022658	GC	3	6	122364	122369	0 %	0 %	50 %	50 %	556574215
3298	NC_022658	CG	4	8	122386	122393	0 %	0 %	50 %	50 %	556574215
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3300	NC_022658	CGA	2	6	122489	122494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574215
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3302	NC_022658	CGC	2	6	122521	122526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574215
3303	NC_022658	TGAA	2	8	122536	122543	50 %	25 %	25 %	0 %	556574215
3304	NC_022658	GGCG	2	8	122558	122565	0 %	0 %	75 %	25 %	556574215
3305	NC_022658	CCG	2	6	122612	122617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574215
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3309	NC_022658	GCCGC	2	10	122720	122729	0 %	0 %	40 %	60 %	556574215
3310	NC_022658	CG	3	6	122734	122739	0 %	0 %	50 %	50 %	556574215
3311	NC_022658	TCG	2	6	122750	122755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574215
3312	NC_022658	ATA	2	6	122758	122763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556574215
3313	NC_022658	GCT	2	6	122778	122783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574269
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3315	NC_022658	CTT	2	6	122878	122883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556574269
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3320	NC_022658	TCG	2	6	122963	122968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574269
3321	NC_022658	CGAGGT	2	12	122976	122987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556574269
3322	NC_022658	CG	3	6	123028	123033	0 %	0 %	50 %	50 %	556574269
3323	NC_022658	TTG	2	6	123038	123043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556574269
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3326	NC_022658	GCT	2	6	123132	123137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574269
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3330	NC_022658	ACG	2	6	123282	123287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574269
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3333	NC_022658	CGT	2	6	123354	123359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574269
3334	NC_022658	GCG	2	6	123366	123371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574269
3335	NC_022658	GC	3	6	123691	123696	0 %	0 %	50 %	50 %	556574105
3336	NC_022658	CG	3	6	123749	123754	0 %	0 %	50 %	50 %	556574105
3337	NC_022658	GGT	2	6	123758	123763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574105
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3339	NC_022658	TCG	2	6	123777	123782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574105
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3341	NC_022658	TGA	2	6	123865	123870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556574105
3342	NC_022658	CGA	2	6	123902	123907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574105
3343	NC_022658	TCG	2	6	123916	123921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574105
3344	NC_022658	CGAT	2	8	123976	123983	25 %	25 %	25 %	25 %	556574105
3345	NC_022658	GCC	2	6	124014	124019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574105
3346	NC_022658	TCGAT	2	10	124230	124239	20 %	40 %	20 %	20 %	556573230
3347	NC_022658	CG	3	6	124293	124298	0 %	0 %	50 %	50 %	556573230
3348	NC_022658	GCC	2	6	124299	124304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573230
3349	NC_022658	CCG	2	6	124310	124315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573230
3350	NC_022658	GCCG	2	8	124317	124324	0 %	0 %	50 %	50 %	556573230
3351	NC_022658	CTG	2	6	124365	124370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573230
3352	NC_022658	GCAG	2	8	124372	124379	25 %	0 %	50 %	25 %	556573230
3353	NC_022658	CGG	2	6	124494	124499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573230
3354	NC_022658	CTG	2	6	124500	124505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573230
3355	NC_022658	GCG	2	6	124529	124534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573230
3356	NC_022658	ACGA	2	8	124567	124574	50 %	0 %	25 %	25 %	556573230
3357	NC_022658	GCT	2	6	125195	125200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572822
3358	NC_022658	GC	3	6	125204	125209	0 %	0 %	50 %	50 %	556572822
3359	NC_022658	TCG	2	6	125215	125220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572822
3360	NC_022658	CGT	2	6	125243	125248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572822
3361	NC_022658	CGA	2	6	125276	125281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572822
3362	NC_022658	GCG	2	6	125395	125400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572822
3363	NC_022658	GCG	2	6	125425	125430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572822
3364	NC_022658	GACGC	2	10	125433	125442	20 %	0 %	40 %	40 %	556572822
3365	NC_022658	TCG	2	6	125449	125454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572822
3366	NC_022658	AGCG	2	8	125474	125481	25 %	0 %	50 %	25 %	556572822
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3485	NC_022658	CGCC	2	8	130650	130657	0 %	0 %	25 %	75 %	556574002
3486	NC_022658	CG	3	6	130680	130685	0 %	0 %	50 %	50 %	556574002
3487	NC_022658	TCT	2	6	130752	130757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556574002
3488	NC_022658	GCT	2	6	130765	130770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574002
3489	NC_022658	CGA	2	6	130773	130778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574002
3490	NC_022658	TGG	2	6	130779	130784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574002
3491	NC_022658	TTGACG	2	12	130820	130831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556574002
3492	NC_022658	TCG	2	6	130836	130841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574002
3493	NC_022658	GCATGG	2	12	130862	130873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556574002
3494	NC_022658	GC	4	8	130880	130887	0 %	0 %	50 %	50 %	556574002
3495	NC_022658	GCT	2	6	130894	130899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574002
3496	NC_022658	GCC	2	6	130905	130910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574002
3497	NC_022658	GGC	2	6	130921	130926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574002
3498	NC_022658	CG	3	6	130931	130936	0 %	0 %	50 %	50 %	556574002
3499	NC_022658	GGCG	2	8	130951	130958	0 %	0 %	75 %	25 %	556574002
3500	NC_022658	CCG	2	6	130959	130964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574002

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