MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 90543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022658	CGC	2	6	188757	188762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574475
5002	NC_022658	GCTG	2	8	188795	188802	0 %	25 %	50 %	25 %	556574475
5003	NC_022658	CG	4	8	188811	188818	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
5004	NC_022658	GCG	2	6	188822	188827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574475
5005	NC_022658	CGA	2	6	188849	188854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574475
5006	NC_022658	CGT	2	6	188865	188870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574475
5007	NC_022658	GCC	2	6	188946	188951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574475
5008	NC_022658	GGT	2	6	188964	188969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574475
5009	NC_022658	TCG	2	6	188977	188982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574475
5010	NC_022658	GC	3	6	189003	189008	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
5011	NC_022658	GTG	2	6	189025	189030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574475
5012	NC_022658	GCG	2	6	189117	189122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574475
5013	NC_022658	GCG	2	6	189191	189196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574475
5014	NC_022658	GAA	2	6	189242	189247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574475
5015	NC_022658	GGC	2	6	189310	189315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572469
5016	NC_022658	CGC	2	6	189323	189328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572469
5017	NC_022658	GGC	2	6	189350	189355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572469
5018	NC_022658	GC	3	6	189368	189373	0 %	0 %	50 %	50 %	556572469
5019	NC_022658	GCG	2	6	189429	189434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572469
5020	NC_022658	TCG	2	6	189456	189461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572469
5021	NC_022658	ACT	2	6	189483	189488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572469
5022	NC_022658	TGC	2	6	189519	189524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572469
5023	NC_022658	CGA	2	6	189544	189549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572469
5024	NC_022658	TCG	2	6	189555	189560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572469
5025	NC_022658	CG	3	6	189581	189586	0 %	0 %	50 %	50 %	556572469
5026	NC_022658	CGC	2	6	189595	189600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572469
5027	NC_022658	CG	3	6	189614	189619	0 %	0 %	50 %	50 %	556572469
5028	NC_022658	CGCGC	2	10	189653	189662	0 %	0 %	40 %	60 %	556572469
5029	NC_022658	CG	3	6	189677	189682	0 %	0 %	50 %	50 %	556572469
5030	NC_022658	CGC	3	9	189698	189706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572469
5031	NC_022658	CTG	2	6	189713	189718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572469
5032	NC_022658	TCC	2	6	189795	189800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556572469
5033	NC_022658	GCA	2	6	189835	189840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572469
5034	NC_022658	CAA	2	6	189865	189870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556572469
5035	NC_022658	GCG	2	6	190030	190035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573900
5036	NC_022658	GTCG	2	8	190054	190061	0 %	25 %	50 %	25 %	556573900
5037	NC_022658	CG	3	6	190060	190065	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5038	NC_022658	CAG	2	6	190093	190098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5039	NC_022658	CG	3	6	190105	190110	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5040	NC_022658	AACCG	2	10	190125	190134	40 %	0 %	20 %	40 %	556573900
5041	NC_022658	TCG	2	6	190139	190144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5042	NC_022658	CGA	2	6	190200	190205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5043	NC_022658	ACG	2	6	190217	190222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5044	NC_022658	CCG	2	6	190223	190228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573900
5045	NC_022658	GAC	2	6	190267	190272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5046	NC_022658	CGG	3	9	190309	190317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573900
5047	NC_022658	GGCC	2	8	190318	190325	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5048	NC_022658	TGCG	2	8	190388	190395	0 %	25 %	50 %	25 %	556573900
5049	NC_022658	CG	3	6	190411	190416	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5050	NC_022658	GGC	2	6	190420	190425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573900
5051	NC_022658	CGC	2	6	190449	190454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573900
5052	NC_022658	CAG	2	6	190480	190485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5053	NC_022658	CGG	2	6	190491	190496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573900
5054	NC_022658	CCGT	2	8	190517	190524	0 %	25 %	25 %	50 %	556573900
5055	NC_022658	GCGCC	2	10	190545	190554	0 %	0 %	40 %	60 %	556573900
5056	NC_022658	ACG	2	6	190574	190579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5057	NC_022658	CAGCAC	2	12	190585	190596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556573900
5058	NC_022658	CG	4	8	190624	190631	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5059	NC_022658	GAC	2	6	190636	190641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5060	NC_022658	CGG	2	6	190655	190660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573900
5061	NC_022658	CGA	2	6	190668	190673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5062	NC_022658	CGG	2	6	190678	190683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573900
5063	NC_022658	CAG	2	6	190708	190713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573900
5064	NC_022658	CGC	2	6	190729	190734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573900
5065	NC_022658	CG	3	6	190741	190746	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5066	NC_022658	GC	4	8	190769	190776	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5067	NC_022658	GC	4	8	190792	190799	0 %	0 %	50 %	50 %	556573900
5068	NC_022658	GCACC	2	10	190870	190879	20 %	0 %	20 %	60 %	556574442
5069	NC_022658	CGA	2	6	190882	190887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5070	NC_022658	GC	3	6	190898	190903	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5071	NC_022658	CCG	2	6	190909	190914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574442
5072	NC_022658	GAC	2	6	190982	190987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5073	NC_022658	CG	4	8	191024	191031	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5074	NC_022658	ACGC	2	8	191043	191050	25 %	0 %	25 %	50 %	556574442
5075	NC_022658	CTG	2	6	191091	191096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574442
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5077	NC_022658	CG	3	6	191120	191125	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5078	NC_022658	CGA	2	6	191185	191190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
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5080	NC_022658	CGA	2	6	191266	191271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5081	NC_022658	GC	3	6	191272	191277	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5082	NC_022658	CG	3	6	191283	191288	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
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5087	NC_022658	GCC	2	6	191379	191384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574442
5088	NC_022658	ACG	2	6	191391	191396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5089	NC_022658	GGC	2	6	191401	191406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
5090	NC_022658	CGT	2	6	191407	191412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5091	NC_022658	CGG	2	6	191461	191466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
5092	NC_022658	GCG	2	6	191507	191512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
5093	NC_022658	GGC	2	6	191521	191526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
5094	NC_022658	GCGTC	2	10	191542	191551	0 %	20 %	40 %	40 %	556574442
5095	NC_022658	CGG	2	6	191576	191581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
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5100	NC_022658	CGA	2	6	191735	191740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5101	NC_022658	GC	4	8	191764	191771	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5102	NC_022658	CGG	2	6	191782	191787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
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5104	NC_022658	CGC	2	6	191872	191877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574442
5105	NC_022658	CGC	2	6	191882	191887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574442
5106	NC_022658	GC	3	6	191909	191914	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5107	NC_022658	TTG	2	6	191916	191921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556574442
5108	NC_022658	TGCG	2	8	191927	191934	0 %	25 %	50 %	25 %	556574442
5109	NC_022658	CG	3	6	191960	191965	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5110	NC_022658	CGC	2	6	191983	191988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574442
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5112	NC_022658	GC	3	6	192023	192028	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5113	NC_022658	CGA	2	6	192052	192057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5114	NC_022658	TGCG	2	8	192064	192071	0 %	25 %	50 %	25 %	556574442
5115	NC_022658	CG	4	8	192076	192083	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5116	NC_022658	CG	3	6	192095	192100	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5117	NC_022658	ATCGC	2	10	192140	192149	20 %	20 %	20 %	40 %	556574442
5118	NC_022658	GCG	2	6	192160	192165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
5119	NC_022658	GGCGC	2	10	192169	192178	0 %	0 %	60 %	40 %	556574442
5120	NC_022658	CGCGA	2	10	192179	192188	20 %	0 %	40 %	40 %	556574442
5121	NC_022658	CGG	2	6	192193	192198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574442
5122	NC_022658	TCG	2	6	192216	192221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574442
5123	NC_022658	GC	3	6	192236	192241	0 %	0 %	50 %	50 %	556574442
5124	NC_022658	CGT	2	6	192259	192264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574442
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5225	NC_022658	GAT	2	6	194834	194839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556571951
5226	NC_022658	GTC	2	6	194885	194890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571951
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5229	NC_022658	TCG	2	6	194931	194936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571951
5230	NC_022658	GC	5	10	194962	194971	0 %	0 %	50 %	50 %	556571951
5231	NC_022658	ATC	2	6	194973	194978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571951
5232	NC_022658	GAA	2	6	194987	194992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556571951
5233	NC_022658	GCC	2	6	195014	195019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571951
5234	NC_022658	ATC	2	6	195021	195026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556571951
5235	NC_022658	CGT	2	6	195052	195057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571951
5236	NC_022658	TCG	2	6	195072	195077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556571951
5237	NC_022658	ACC	2	6	195106	195111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556571951
5238	NC_022658	CGCGC	2	10	195145	195154	0 %	0 %	40 %	60 %	556571951
5239	NC_022658	CGC	2	6	195160	195165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571951
5240	NC_022658	GC	3	6	195191	195196	0 %	0 %	50 %	50 %	556571951
5241	NC_022658	GTG	2	6	195197	195202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556571951
5242	NC_022658	GCCGG	2	10	195215	195224	0 %	0 %	60 %	40 %	556571951
5243	NC_022658	TCC	2	6	195237	195242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556571951
5244	NC_022658	CGC	2	6	195290	195295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556571951
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5492	NC_022658	CG	3	6	204135	204140	0 %	0 %	50 %	50 %	556572286
5493	NC_022658	CG	3	6	204151	204156	0 %	0 %	50 %	50 %	556572286
5494	NC_022658	CGA	2	6	204160	204165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572286
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5497	NC_022658	CG	4	8	204238	204245	0 %	0 %	50 %	50 %	556572286
5498	NC_022658	CGA	2	6	204247	204252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572286
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