MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 90543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022658	CAG	2	6	168285	168290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573723
4502	NC_022658	GCG	2	6	168296	168301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573723
4503	NC_022658	GTC	2	6	168303	168308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573723
4504	NC_022658	GC	3	6	168314	168319	0 %	0 %	50 %	50 %	556573723
4505	NC_022658	GCC	2	6	168349	168354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573723
4506	NC_022658	GCC	2	6	168369	168374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573723
4507	NC_022658	GC	3	6	168431	168436	0 %	0 %	50 %	50 %	556573723
4508	NC_022658	CGG	2	6	168461	168466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573723
4509	NC_022658	GC	3	6	168473	168478	0 %	0 %	50 %	50 %	556573723
4510	NC_022658	TCGC	2	8	168520	168527	0 %	25 %	25 %	50 %	556573723
4511	NC_022658	CGC	2	6	168533	168538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573723
4512	NC_022658	CGC	2	6	168554	168559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573723
4513	NC_022658	GC	3	6	168563	168568	0 %	0 %	50 %	50 %	556573723
4514	NC_022658	TCG	2	6	168574	168579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573723
4515	NC_022658	CGTG	2	8	168599	168606	0 %	25 %	50 %	25 %	556573723
4516	NC_022658	ACG	2	6	168619	168624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573723
4517	NC_022658	GCC	2	6	168630	168635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573723
4518	NC_022658	GC	3	6	168636	168641	0 %	0 %	50 %	50 %	556573723
4519	NC_022658	GCGCC	2	10	168656	168665	0 %	0 %	40 %	60 %	556573723
4520	NC_022658	ATCG	2	8	168729	168736	25 %	25 %	25 %	25 %	556573723
4521	NC_022658	GCC	2	6	169248	169253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574353
4522	NC_022658	GCGCC	2	10	169290	169299	0 %	0 %	40 %	60 %	556574353
4523	NC_022658	GAA	2	6	169303	169308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574353
4524	NC_022658	CGT	2	6	169309	169314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4525	NC_022658	GC	3	6	169317	169322	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4526	NC_022658	GTG	2	6	169324	169329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556574353
4527	NC_022658	CAGC	2	8	169336	169343	25 %	0 %	25 %	50 %	556574353
4528	NC_022658	GC	3	6	169350	169355	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4529	NC_022658	CGC	2	6	169357	169362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574353
4530	NC_022658	CCCG	2	8	169375	169382	0 %	0 %	25 %	75 %	556574353
4531	NC_022658	CGGC	2	8	169419	169426	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4532	NC_022658	CGA	2	6	169437	169442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4533	NC_022658	GCG	2	6	169445	169450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574353
4534	NC_022658	CAG	3	9	169531	169539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4535	NC_022658	CAG	3	9	169552	169560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4536	NC_022658	GCCG	2	8	169564	169571	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4537	NC_022658	GCG	2	6	169575	169580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574353
4538	NC_022658	CG	5	10	169579	169588	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4539	NC_022658	CGC	2	6	169627	169632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574353
4540	NC_022658	TACGC	2	10	169634	169643	20 %	20 %	20 %	40 %	556574353
4541	NC_022658	TCA	2	6	169644	169649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556574353
4542	NC_022658	CTG	2	6	169690	169695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4543	NC_022658	CG	3	6	169696	169701	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4544	NC_022658	GC	3	6	169726	169731	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4545	NC_022658	ACG	2	6	169757	169762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4546	NC_022658	CG	3	6	169783	169788	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4547	NC_022658	GC	4	8	169791	169798	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
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4549	NC_022658	CG	3	6	169823	169828	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4550	NC_022658	GCG	3	9	169826	169834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574353
4551	NC_022658	CG	3	6	169915	169920	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4552	NC_022658	CGC	2	6	170016	170021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574353
4553	NC_022658	GCG	2	6	170031	170036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574353
4554	NC_022658	CGA	2	6	170046	170051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4555	NC_022658	CG	3	6	170058	170063	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4556	NC_022658	GC	3	6	170064	170069	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4557	NC_022658	AGC	2	6	170096	170101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4558	NC_022658	CG	3	6	170102	170107	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4559	NC_022658	GCG	3	9	170105	170113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574353
4560	NC_022658	GCG	2	6	170159	170164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574353
4561	NC_022658	AGC	4	12	170177	170188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4562	NC_022658	GC	3	6	170217	170222	0 %	0 %	50 %	50 %	556574353
4563	NC_022658	ATC	2	6	170240	170245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556574353
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4565	NC_022658	GCA	2	6	170322	170327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
4566	NC_022658	CGA	2	6	170344	170349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574353
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4570	NC_022658	CGCC	2	8	170665	170672	0 %	0 %	25 %	75 %	556574041
4571	NC_022658	GCG	3	9	170702	170710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574041
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4574	NC_022658	TGCGCT	2	12	170813	170824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574041
4575	NC_022658	GCTG	2	8	170828	170835	0 %	25 %	50 %	25 %	556574041
4576	NC_022658	TTCG	2	8	170856	170863	0 %	50 %	25 %	25 %	556574041
4577	NC_022658	AC	3	6	170865	170870	50 %	0 %	0 %	50 %	556574041
4578	NC_022658	ACG	2	6	170878	170883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574041
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4583	NC_022658	CG	3	6	170989	170994	0 %	0 %	50 %	50 %	556574041
4584	NC_022658	GCG	2	6	171008	171013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574041
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4587	NC_022658	GCGCAT	2	12	171081	171092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556574041
4588	NC_022658	CAG	2	6	171105	171110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574041
4589	NC_022658	AAC	2	6	171142	171147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556574041
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4592	NC_022658	CGCC	2	8	171242	171249	0 %	0 %	25 %	75 %	556574041
4593	NC_022658	CGT	2	6	171285	171290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574041
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4595	NC_022658	CGAGCA	2	12	171338	171349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574041
4596	NC_022658	GCG	2	6	171350	171355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574041
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4601	NC_022658	CG	5	10	171446	171455	0 %	0 %	50 %	50 %	556574041
4602	NC_022658	GAA	2	6	171462	171467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556574041
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4605	NC_022658	GCC	2	6	171552	171557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574041
4606	NC_022658	CGG	2	6	171575	171580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574041
4607	NC_022658	CGA	2	6	172073	172078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573357
4608	NC_022658	GC	4	8	172088	172095	0 %	0 %	50 %	50 %	556573357
4609	NC_022658	CAG	2	6	172203	172208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573357
4610	NC_022658	CGA	2	6	172229	172234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573357
4611	NC_022658	TCGTGA	2	12	172241	172252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556573357
4612	NC_022658	CGC	2	6	172322	172327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573357
4613	NC_022658	GAT	2	6	172335	172340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556573357
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4616	NC_022658	CG	3	6	172477	172482	0 %	0 %	50 %	50 %	556573357
4617	NC_022658	GATC	2	8	172505	172512	25 %	25 %	25 %	25 %	556573357
4618	NC_022658	GAT	2	6	172581	172586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556573357
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4622	NC_022658	GCC	2	6	172776	172781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573357
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4740	NC_022658	CG	3	6	177375	177380	0 %	0 %	50 %	50 %	556573038
4741	NC_022658	TCG	2	6	177424	177429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573038
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4743	NC_022658	GAAC	2	8	177503	177510	50 %	0 %	25 %	25 %	556573038
4744	NC_022658	CGG	2	6	177511	177516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573038
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4864	NC_022658	CGA	2	6	183461	183466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574048
4865	NC_022658	TGC	2	6	183565	183570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574048
4866	NC_022658	CGC	2	6	183578	183583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574048
4867	NC_022658	CGCGC	2	10	183783	183792	0 %	0 %	40 %	60 %	556574048
4868	NC_022658	TCG	2	6	183793	183798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574048
4869	NC_022658	CGC	2	6	183836	183841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556574048
4870	NC_022658	CGGCG	2	10	183874	183883	0 %	0 %	60 %	40 %	556572950
4871	NC_022658	CG	3	6	183882	183887	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
4872	NC_022658	CG	3	6	183901	183906	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
4873	NC_022658	CGG	2	6	183937	183942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572950
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4875	NC_022658	GACC	2	8	183978	183985	25 %	0 %	25 %	50 %	556572950
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4877	NC_022658	CGG	2	6	184031	184036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572950
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4881	NC_022658	GC	3	6	184116	184121	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
4882	NC_022658	CGC	3	9	184119	184127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572950
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4885	NC_022658	GC	3	6	184246	184251	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
4886	NC_022658	CCCG	2	8	184263	184270	0 %	0 %	25 %	75 %	556572950
4887	NC_022658	CCCG	2	8	184274	184281	0 %	0 %	25 %	75 %	556572950
4888	NC_022658	C	8	8	184295	184302	0 %	0 %	0 %	100 %	556572950
4889	NC_022658	GCCC	2	8	184306	184313	0 %	0 %	25 %	75 %	556572950
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4892	NC_022658	GC	3	6	184371	184376	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
4893	NC_022658	GC	3	6	184380	184385	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
4894	NC_022658	CGC	2	6	184426	184431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572950
4895	NC_022658	CCG	2	6	184436	184441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572950
4896	NC_022658	GC	3	6	184442	184447	0 %	0 %	50 %	50 %	556572950
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4899	NC_022658	CTCTGA	2	12	184592	184603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556574250
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4904	NC_022658	CGA	2	6	184695	184700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574250
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4921	NC_022658	GC	4	8	185404	185411	0 %	0 %	50 %	50 %	556572061
4922	NC_022658	CGA	2	6	185424	185429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572061
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4929	NC_022658	ACG	2	6	185657	185662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572061
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4931	NC_022658	CGGA	2	8	185699	185706	25 %	0 %	50 %	25 %	556572061
4932	NC_022658	GCC	2	6	185724	185729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572061
4933	NC_022658	GTC	2	6	185784	185789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572061
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4936	NC_022658	TCA	2	6	185849	185854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572061
4937	NC_022658	AGT	2	6	185864	185869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572061
4938	NC_022658	CTG	2	6	185874	185879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572061
4939	NC_022658	CGAC	2	8	185882	185889	25 %	0 %	25 %	50 %	556572061
4940	NC_022658	CTT	2	6	185991	185996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556572061
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4942	NC_022658	TCG	2	6	186095	186100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572061
4943	NC_022658	ATC	2	6	186118	186123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572061
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4947	NC_022658	CG	3	6	186222	186227	0 %	0 %	50 %	50 %	556572061
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4950	NC_022658	CGCTG	2	10	186296	186305	0 %	20 %	40 %	40 %	556572061
4951	NC_022658	AGA	2	6	186314	186319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556572061
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4958	NC_022658	TGA	2	6	186464	186469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572061
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4961	NC_022658	TC	3	6	186509	186514	0 %	50 %	0 %	50 %	556572061
4962	NC_022658	GCG	2	6	186523	186528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572061
4963	NC_022658	CAT	2	6	186602	186607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572061
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4966	NC_022658	GATA	2	8	186674	186681	50 %	25 %	25 %	0 %	556572061
4967	NC_022658	GCG	2	6	186814	186819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572061
4968	NC_022658	TCA	2	6	186833	186838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572061
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4970	NC_022658	GCT	2	6	186893	186898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572061
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4972	NC_022658	GC	3	6	187005	187010	0 %	0 %	50 %	50 %	556572061
4973	NC_022658	TGC	2	6	187018	187023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572061
4974	NC_022658	GCC	2	6	187087	187092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572061
4975	NC_022658	CGG	2	6	187094	187099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572061
4976	NC_022658	GC	3	6	187671	187676	0 %	0 %	50 %	50 %	556573958
4977	NC_022658	CCGG	2	8	187700	187707	0 %	0 %	50 %	50 %	556573958
4978	NC_022658	CCG	3	9	187728	187736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573958
4979	NC_022658	GCT	2	6	187777	187782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573958
4980	NC_022658	CGA	2	6	187815	187820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573958
4981	NC_022658	GCA	2	6	188123	188128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4982	NC_022658	ATCG	2	8	188150	188157	25 %	25 %	25 %	25 %	556574475
4983	NC_022658	CGT	2	6	188159	188164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4984	NC_022658	GGCC	2	8	188203	188210	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
4985	NC_022658	AGC	2	6	188263	188268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4986	NC_022658	GTC	2	6	188274	188279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4987	NC_022658	GCG	2	6	188285	188290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574475
4988	NC_022658	GC	3	6	188297	188302	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
4989	NC_022658	GC	3	6	188327	188332	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
4990	NC_022658	CGG	2	6	188334	188339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556574475
4991	NC_022658	CG	3	6	188354	188359	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
4992	NC_022658	TCGC	2	8	188386	188393	0 %	25 %	25 %	50 %	556574475
4993	NC_022658	CTGCC	2	10	188488	188497	0 %	20 %	20 %	60 %	556574475
4994	NC_022658	CGA	2	6	188510	188515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4995	NC_022658	TTC	2	6	188533	188538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556574475
4996	NC_022658	ACG	2	6	188557	188562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4997	NC_022658	GC	3	6	188621	188626	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
4998	NC_022658	CGA	2	6	188714	188719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556574475
4999	NC_022658	CG	3	6	188732	188737	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475
5000	NC_022658	CG	6	12	188740	188751	0 %	0 %	50 %	50 %	556574475

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