MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 46113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022653	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555760
2	NC_022653	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555760
3	NC_022653	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555760
4	NC_022653	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555760
5	NC_022653	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555760
6	NC_022653	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555760
7	NC_022653	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555760
8	NC_022653	ATA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555760
9	NC_022653	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555760
10	NC_022653	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555760
11	NC_022653	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555760
12	NC_022653	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555760
13	NC_022653	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555760
14	NC_022653	TCT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555760
15	NC_022653	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555760
16	NC_022653	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555760
17	NC_022653	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555760
18	NC_022653	GGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555760
19	NC_022653	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555760
20	NC_022653	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555760
21	NC_022653	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555760
22	NC_022653	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555760
23	NC_022653	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555760
24	NC_022653	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555761
25	NC_022653	AGA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555761
26	NC_022653	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555761
27	NC_022653	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555761
28	NC_022653	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555761
29	NC_022653	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555761
30	NC_022653	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555761
31	NC_022653	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555761
32	NC_022653	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555761
33	NC_022653	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555761
34	NC_022653	CAA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555761
35	NC_022653	CGG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555761
36	NC_022653	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555761
37	NC_022653	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555761
38	NC_022653	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555762
39	NC_022653	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555762
40	NC_022653	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555762
41	NC_022653	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555762
42	NC_022653	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555762
43	NC_022653	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555763
44	NC_022653	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555763
45	NC_022653	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555763
46	NC_022653	GAG	3	9	3828	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555763
47	NC_022653	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555763
48	NC_022653	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555763
49	NC_022653	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555763
50	NC_022653	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555763
51	NC_022653	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555763
52	NC_022653	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555763
53	NC_022653	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555763
54	NC_022653	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555763
55	NC_022653	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555763
56	NC_022653	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555763
57	NC_022653	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555764
58	NC_022653	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555764
59	NC_022653	TTG	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555764
60	NC_022653	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555764
61	NC_022653	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555764
62	NC_022653	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555765
63	NC_022653	ATG	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555765
64	NC_022653	CAC	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555765
65	NC_022653	TCG	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555765
66	NC_022653	ACA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555765
67	NC_022653	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555765
68	NC_022653	CGG	2	6	5176	5181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555765
69	NC_022653	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555765
70	NC_022653	AAG	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555765
71	NC_022653	AAG	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555765
72	NC_022653	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555765
73	NC_022653	ATT	2	6	5846	5851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555765
74	NC_022653	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555765
75	NC_022653	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555765
76	NC_022653	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555765
77	NC_022653	TTC	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555765
78	NC_022653	TCA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555765
79	NC_022653	TTA	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555765
80	NC_022653	TTC	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555765
81	NC_022653	ATC	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555765
82	NC_022653	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555765
83	NC_022653	GCA	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555765
84	NC_022653	AGC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555765
85	NC_022653	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555765
86	NC_022653	TCG	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555766
87	NC_022653	ACC	2	6	7235	7240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555766
88	NC_022653	TTG	2	6	7310	7315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555766
89	NC_022653	TCC	2	6	7406	7411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555766
90	NC_022653	GTC	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555766
91	NC_022653	TCC	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555766
92	NC_022653	CAT	2	6	7757	7762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555766
93	NC_022653	CCG	2	6	7923	7928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555766
94	NC_022653	CTG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555766
95	NC_022653	TTG	2	6	8342	8347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555766
96	NC_022653	ATG	2	6	8441	8446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555766
97	NC_022653	TCA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555766
98	NC_022653	TTC	2	6	8677	8682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555766
99	NC_022653	TAA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555766
100	NC_022653	ATT	2	6	8758	8763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555766
101	NC_022653	ATT	2	6	8803	8808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555766
102	NC_022653	TGA	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555766
103	NC_022653	CTT	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555766
104	NC_022653	ATC	3	9	8983	8991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555766
105	NC_022653	GAA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555766
106	NC_022653	GAA	2	6	9025	9030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555766
107	NC_022653	GAT	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555766
108	NC_022653	GAA	2	6	9118	9123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555766
109	NC_022653	CAA	2	6	9266	9271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555766
110	NC_022653	ATT	2	6	9292	9297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555766
111	NC_022653	GCG	2	6	9305	9310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555766
112	NC_022653	GAA	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555766
113	NC_022653	GAA	2	6	9442	9447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555766
114	NC_022653	GAA	2	6	9451	9456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555766
115	NC_022653	CGG	2	6	14867	14872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555767
116	NC_022653	ATC	2	6	14873	14878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555767
117	NC_022653	ATC	2	6	14884	14889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555767
118	NC_022653	CAG	2	6	14905	14910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555767
119	NC_022653	ACC	2	6	14916	14921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555767
120	NC_022653	ATC	2	6	14942	14947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555767
121	NC_022653	AAT	2	6	14974	14979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555767
122	NC_022653	ATG	2	6	15142	15147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555767
123	NC_022653	TCA	2	6	15300	15305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555767
124	NC_022653	TTC	2	6	15308	15313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555767
125	NC_022653	TTC	2	6	15325	15330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555767
126	NC_022653	AGA	2	6	15500	15505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555767
127	NC_022653	ACA	2	6	15537	15542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555767
128	NC_022653	TTC	2	6	15652	15657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555767
129	NC_022653	AAG	2	6	15893	15898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555768
130	NC_022653	GAT	2	6	15910	15915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555768
131	NC_022653	TCA	2	6	16007	16012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555768
132	NC_022653	GGC	2	6	16069	16074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555768
133	NC_022653	CAG	2	6	16108	16113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555768
134	NC_022653	TTA	2	6	16154	16159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555768
135	NC_022653	CTT	2	6	16167	16172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555768
136	NC_022653	ATC	2	6	16184	16189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555768
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142	NC_022653	CGG	2	6	16893	16898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555768
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146	NC_022653	CGG	2	6	17178	17183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555768
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154	NC_022653	CTT	2	6	18096	18101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555769
155	NC_022653	ACA	2	6	18141	18146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555769
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158	NC_022653	TGA	2	6	18374	18379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555769
159	NC_022653	ATG	2	6	18715	18720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555769
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161	NC_022653	CGG	2	6	18761	18766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555769
162	NC_022653	TTC	2	6	18768	18773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555769
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164	NC_022653	GGC	2	6	19073	19078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555770
165	NC_022653	TCA	2	6	19080	19085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555770
166	NC_022653	CGG	2	6	19183	19188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555770
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247	NC_022653	GAA	2	6	27108	27113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555779
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251	NC_022653	GTG	2	6	27445	27450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555779
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377	NC_022653	GCA	2	6	41797	41802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555793
378	NC_022653	GAC	2	6	42133	42138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555793
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389	NC_022653	TAT	2	6	42805	42810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555794
390	NC_022653	TTG	2	6	42854	42859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555794
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488	NC_022653	ACA	2	6	50064	50069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555803
489	NC_022653	GAA	2	6	50120	50125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555803
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496	NC_022653	TGT	2	6	50569	50574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555803
497	NC_022653	AAG	2	6	50589	50594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555803
498	NC_022653	AGA	2	6	50614	50619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555803
499	NC_022653	AGC	2	6	50685	50690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555803
500	NC_022653	ATT	2	6	51175	51180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555804

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