MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3

Total Repeats: 78195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022530	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	549695946
2	NC_022530	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695946
3	NC_022530	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	549695946
4	NC_022530	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	549695946
5	NC_022530	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695946
6	NC_022530	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695946
7	NC_022530	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	549695946
8	NC_022530	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	549695946
9	NC_022530	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695946
10	NC_022530	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	549695946
11	NC_022530	TA	3	6	855	860	50 %	50 %	0 %	0 %	549695946
12	NC_022530	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549695946
13	NC_022530	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695946
14	NC_022530	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695946
15	NC_022530	ATA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549695946
16	NC_022530	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695946
17	NC_022530	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	549695946
18	NC_022530	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695946
19	NC_022530	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	549695946
20	NC_022530	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695946
21	NC_022530	GATT	2	8	1214	1221	25 %	50 %	25 %	0 %	549695946
22	NC_022530	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695946
23	NC_022530	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	549695946
24	NC_022530	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695946
25	NC_022530	TCG	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695946
26	NC_022530	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695946
27	NC_022530	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695946
28	NC_022530	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695946
29	NC_022530	GA	3	6	1644	1649	50 %	0 %	50 %	0 %	549695946
30	NC_022530	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695946
31	NC_022530	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695946
32	NC_022530	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695946
33	NC_022530	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695946
34	NC_022530	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	549695946
35	NC_022530	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549695946
36	NC_022530	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695947
37	NC_022530	TCAT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	549695947
38	NC_022530	AGA	3	9	2113	2121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695947
39	NC_022530	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	549695947
40	NC_022530	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695947
41	NC_022530	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695947
42	NC_022530	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	549695947
43	NC_022530	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	549695947
44	NC_022530	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695947
45	NC_022530	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695947
46	NC_022530	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695947
47	NC_022530	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695947
48	NC_022530	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695947
49	NC_022530	GA	3	6	2782	2787	50 %	0 %	50 %	0 %	549695947
50	NC_022530	CAA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549695947
51	NC_022530	CGG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695947
52	NC_022530	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695947
53	NC_022530	GCTG	2	8	2884	2891	0 %	25 %	50 %	25 %	549695947
54	NC_022530	TTCA	2	8	2920	2927	25 %	50 %	0 %	25 %	549695947
55	NC_022530	AT	3	6	2935	2940	50 %	50 %	0 %	0 %	549695947
56	NC_022530	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695947
57	NC_022530	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549695948
58	NC_022530	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695948
59	NC_022530	GAGC	2	8	3309	3316	25 %	0 %	50 %	25 %	549695948
60	NC_022530	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549695948
61	NC_022530	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695948
62	NC_022530	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695948
63	NC_022530	GC	3	6	3483	3488	0 %	0 %	50 %	50 %	549695949
64	NC_022530	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695949
65	NC_022530	CTAT	2	8	3563	3570	25 %	50 %	0 %	25 %	549695949
66	NC_022530	GAAG	2	8	3649	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	549695949
67	NC_022530	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695949
68	NC_022530	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	549695949
69	NC_022530	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695949
70	NC_022530	TCAG	2	8	3749	3756	25 %	25 %	25 %	25 %	549695949
71	NC_022530	GAG	3	9	3828	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549695949
72	NC_022530	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	549695949
73	NC_022530	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695949
74	NC_022530	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695949
75	NC_022530	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549695949
76	NC_022530	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695949
77	NC_022530	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695949
78	NC_022530	T	6	6	4250	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	549695949
79	NC_022530	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695949
80	NC_022530	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695949
81	NC_022530	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695949
82	NC_022530	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695949
83	NC_022530	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695949
84	NC_022530	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549695949
85	NC_022530	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	549695949
86	NC_022530	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695950
87	NC_022530	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695950
88	NC_022530	TTG	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549695950
89	NC_022530	GACA	2	8	4671	4678	50 %	0 %	25 %	25 %	549695950
90	NC_022530	GAAA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	549695950
91	NC_022530	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695950
92	NC_022530	CCGT	2	8	4695	4702	0 %	25 %	25 %	50 %	549695950
93	NC_022530	AT	4	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	549695950
94	NC_022530	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695950
95	NC_022530	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695951
96	NC_022530	ATG	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695951
97	NC_022530	CAC	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549695951
98	NC_022530	TCG	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695951
99	NC_022530	ACA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549695951
100	NC_022530	CGGT	2	8	5112	5119	0 %	25 %	50 %	25 %	549695951
101	NC_022530	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695951
102	NC_022530	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695951
103	NC_022530	CGG	2	6	5176	5181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695951
104	NC_022530	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695951
105	NC_022530	CGTC	2	8	5235	5242	0 %	25 %	25 %	50 %	549695951
106	NC_022530	TCCGGA	2	12	5386	5397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549695951
107	NC_022530	AAC	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549695951
108	NC_022530	AAG	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695951
109	NC_022530	TTGCA	2	10	5643	5652	20 %	40 %	20 %	20 %	549695951
110	NC_022530	ATA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549695951
111	NC_022530	AAG	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695951
112	NC_022530	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695951
113	NC_022530	GA	3	6	5827	5832	50 %	0 %	50 %	0 %	549695951
114	NC_022530	ATT	2	6	5846	5851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695951
115	NC_022530	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695951
116	NC_022530	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695951
117	NC_022530	A	6	6	6038	6043	100 %	0 %	0 %	0 %	549695951
118	NC_022530	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695951
119	NC_022530	TTC	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695951
120	NC_022530	GCGG	2	8	6164	6171	0 %	0 %	75 %	25 %	549695951
121	NC_022530	GGGAC	2	10	6184	6193	20 %	0 %	60 %	20 %	549695951
122	NC_022530	TC	3	6	6265	6270	0 %	50 %	0 %	50 %	549695951
123	NC_022530	TCA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695951
124	NC_022530	TTA	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695951
125	NC_022530	TTC	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695951
126	NC_022530	ATC	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695951
127	NC_022530	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695951
128	NC_022530	GCA	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695951
129	NC_022530	AGC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695951
130	NC_022530	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695951
131	NC_022530	AC	3	6	7016	7021	50 %	0 %	0 %	50 %	549695952
132	NC_022530	TCAG	2	8	7043	7050	25 %	25 %	25 %	25 %	549695952
133	NC_022530	TCCT	2	8	7063	7070	0 %	50 %	0 %	50 %	549695952
134	NC_022530	AATG	2	8	7158	7165	50 %	25 %	25 %	0 %	549695952
135	NC_022530	A	6	6	7195	7200	100 %	0 %	0 %	0 %	549695952
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139	NC_022530	TTCGG	2	10	7330	7339	0 %	40 %	40 %	20 %	549695952
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142	NC_022530	CTG	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695952
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263	NC_022530	GCG	2	6	20078	20083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695957
264	NC_022530	GCC	2	6	20127	20132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695957
265	NC_022530	GTC	2	6	20229	20234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695957
266	NC_022530	TGA	2	6	20297	20302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695957
267	NC_022530	TATT	2	8	20317	20324	25 %	75 %	0 %	0 %	549695957
268	NC_022530	CG	3	6	20325	20330	0 %	0 %	50 %	50 %	549695957
269	NC_022530	GCT	2	6	20419	20424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695957
270	NC_022530	GAT	2	6	20445	20450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695957
271	NC_022530	TGAT	2	8	20834	20841	25 %	50 %	25 %	0 %	549695958
272	NC_022530	AGAGA	2	10	20942	20951	60 %	0 %	40 %	0 %	549695958
273	NC_022530	AGA	2	6	20967	20972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695958
274	NC_022530	CAG	2	6	21001	21006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695958
275	NC_022530	A	6	6	21028	21033	100 %	0 %	0 %	0 %	549695958
276	NC_022530	ATT	2	6	21046	21051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695958
277	NC_022530	GAA	2	6	21073	21078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695958
278	NC_022530	AAG	2	6	21082	21087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695958
279	NC_022530	TGA	2	6	21090	21095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695958
280	NC_022530	ACG	2	6	21115	21120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695958
281	NC_022530	GAT	2	6	21187	21192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695958
282	NC_022530	CG	3	6	21355	21360	0 %	0 %	50 %	50 %	549695958
283	NC_022530	TGA	2	6	21390	21395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695958
284	NC_022530	TCC	2	6	21417	21422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549695958
285	NC_022530	AGA	2	6	21498	21503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695958
286	NC_022530	ATT	2	6	21506	21511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695958
287	NC_022530	CGG	2	6	21524	21529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695958
288	NC_022530	GCTT	2	8	21607	21614	0 %	50 %	25 %	25 %	549695958
289	NC_022530	GCCG	2	8	21634	21641	0 %	0 %	50 %	50 %	549695958
290	NC_022530	CAA	2	6	21675	21680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549695958
291	NC_022530	GAG	2	6	21721	21726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549695958
292	NC_022530	GCT	2	6	21765	21770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549695958
293	NC_022530	CCAAG	2	10	21856	21865	40 %	0 %	20 %	40 %	549695958
294	NC_022530	TCT	2	6	21883	21888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695958
295	NC_022530	ATT	2	6	22054	22059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549695958
296	NC_022530	TCA	2	6	22097	22102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695958
297	NC_022530	GC	3	6	22127	22132	0 %	0 %	50 %	50 %	549695959
298	NC_022530	T	6	6	22134	22139	0 %	100 %	0 %	0 %	549695959
299	NC_022530	GCG	2	6	22155	22160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695959
300	NC_022530	GCG	2	6	22338	22343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695959
301	NC_022530	ATCTG	2	10	22422	22431	20 %	40 %	20 %	20 %	549695959
302	NC_022530	ACA	2	6	22452	22457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549695959
303	NC_022530	TCT	2	6	22615	22620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549695959
304	NC_022530	ACGGAT	2	12	22700	22711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549695959
305	NC_022530	GA	4	8	22726	22733	50 %	0 %	50 %	0 %	549695959
306	NC_022530	GC	3	6	22822	22827	0 %	0 %	50 %	50 %	549695959
307	NC_022530	CCG	2	6	22842	22847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695959
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312	NC_022530	T	7	7	23077	23083	0 %	100 %	0 %	0 %	549695959
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320	NC_022530	TCA	2	6	23770	23775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549695960
321	NC_022530	TGT	2	6	24018	24023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549695960
322	NC_022530	GCAT	2	8	24055	24062	25 %	25 %	25 %	25 %	549695960
323	NC_022530	CCG	2	6	24112	24117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695960
324	NC_022530	AAAT	2	8	24163	24170	75 %	25 %	0 %	0 %	549695960
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326	NC_022530	GTT	2	6	24333	24338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549695960
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328	NC_022530	GTCT	2	8	24398	24405	0 %	50 %	25 %	25 %	549695961
329	NC_022530	AT	3	6	24451	24456	50 %	50 %	0 %	0 %	549695961
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335	NC_022530	ACTCC	2	10	24818	24827	20 %	20 %	0 %	60 %	549695961
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341	NC_022530	CGA	2	6	25545	25550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695962
342	NC_022530	A	6	6	25676	25681	100 %	0 %	0 %	0 %	549695962
343	NC_022530	GTTTT	2	10	25782	25791	0 %	80 %	20 %	0 %	549695962
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348	NC_022530	GCC	2	6	25997	26002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695962
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352	NC_022530	AT	3	6	26160	26165	50 %	50 %	0 %	0 %	549695962
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354	NC_022530	GC	3	6	26317	26322	0 %	0 %	50 %	50 %	549695962
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371	NC_022530	GA	3	6	27084	27089	50 %	0 %	50 %	0 %	549695964
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379	NC_022530	GCG	2	6	27449	27454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695964
380	NC_022530	T	6	6	27489	27494	0 %	100 %	0 %	0 %	549695964
381	NC_022530	AAAG	2	8	27513	27520	75 %	0 %	25 %	0 %	549695964
382	NC_022530	AGT	2	6	27542	27547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549695964
383	NC_022530	CAG	2	6	28065	28070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549695965
384	NC_022530	AGA	2	6	28235	28240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695965
385	NC_022530	AATG	2	8	28248	28255	50 %	25 %	25 %	0 %	549695965
386	NC_022530	GCG	2	6	28257	28262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695965
387	NC_022530	GCG	2	6	28311	28316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549695965
388	NC_022530	TA	3	6	28393	28398	50 %	50 %	0 %	0 %	549695965
389	NC_022530	CT	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	549695965
390	NC_022530	GAA	2	6	28458	28463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549695965
391	NC_022530	CCG	2	6	28464	28469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549695965
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