MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5113

Total Repeats: 45621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022081	CGA	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612797
2	NC_022081	GAA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612797
3	NC_022081	GAA	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612797
4	NC_022081	GCA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612797
5	NC_022081	GTG	2	6	976	981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530612797
6	NC_022081	TCT	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612797
7	NC_022081	TCA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612797
8	NC_022081	ATA	2	6	1031	1036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530612797
9	NC_022081	GAT	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612797
10	NC_022081	GAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612797
11	NC_022081	CCG	2	6	1195	1200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530612797
12	NC_022081	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530612797
13	NC_022081	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612797
14	NC_022081	TCT	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612797
15	NC_022081	CAG	2	6	1540	1545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612797
16	NC_022081	TTC	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612797
17	NC_022081	GAA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612797
18	NC_022081	GGC	2	6	1675	1680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612797
19	NC_022081	CTG	2	6	1726	1731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612797
20	NC_022081	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612797
21	NC_022081	AGC	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612797
22	NC_022081	CAG	3	9	1750	1758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612797
23	NC_022081	ATA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530612797
24	NC_022081	TCG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612798
25	NC_022081	AGA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612798
26	NC_022081	TGA	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612798
27	NC_022081	TGC	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612798
28	NC_022081	TTC	2	6	2213	2218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612798
29	NC_022081	ATT	2	6	2491	2496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612798
30	NC_022081	TGA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612798
31	NC_022081	TTC	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612798
32	NC_022081	TCG	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612798
33	NC_022081	CTT	2	6	2805	2810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612798
34	NC_022081	CAA	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612798
35	NC_022081	CGG	2	6	2859	2864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612798
36	NC_022081	TCA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612798
37	NC_022081	ATG	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612798
38	NC_022081	CGG	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612799
39	NC_022081	CAA	2	6	3366	3371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612799
40	NC_022081	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530612799
41	NC_022081	GTC	2	6	3448	3453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612799
42	NC_022081	ATC	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612800
43	NC_022081	TGA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612800
44	NC_022081	AGC	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612800
45	NC_022081	GAG	3	9	3864	3872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530612800
46	NC_022081	AGC	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612800
47	NC_022081	GAA	2	6	4129	4134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612800
48	NC_022081	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612800
49	NC_022081	GAT	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612800
50	NC_022081	CAG	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612800
51	NC_022081	ACG	2	6	4342	4347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612800
52	NC_022081	GAA	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612800
53	NC_022081	GAT	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612800
54	NC_022081	GAT	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612800
55	NC_022081	CAC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530612800
56	NC_022081	GAC	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612801
57	NC_022081	TCG	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612801
58	NC_022081	GAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612801
59	NC_022081	AGT	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612801
60	NC_022081	GAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612801
61	NC_022081	CAG	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612802
62	NC_022081	ATG	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612802
63	NC_022081	CAC	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530612802
64	NC_022081	TCG	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612802
65	NC_022081	ACA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612802
66	NC_022081	GCC	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530612802
67	NC_022081	TCA	2	6	5190	5195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612802
68	NC_022081	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612802
69	NC_022081	CGG	2	6	5248	5253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612802
70	NC_022081	AAC	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612802
71	NC_022081	AAG	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612802
72	NC_022081	AAT	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530612802
73	NC_022081	AAG	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612802
74	NC_022081	GAT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612802
75	NC_022081	ATT	2	6	5882	5887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612802
76	NC_022081	TCT	2	6	5978	5983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612802
77	NC_022081	CTT	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612802
78	NC_022081	TTC	2	6	6148	6153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612802
79	NC_022081	TCA	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612802
80	NC_022081	TTA	2	6	6443	6448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612802
81	NC_022081	TTC	2	6	6452	6457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612802
82	NC_022081	ATC	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612802
83	NC_022081	GCC	2	6	6508	6513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530612802
84	NC_022081	GCA	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612802
85	NC_022081	AGC	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612802
86	NC_022081	TGA	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612802
87	NC_022081	TCG	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612803
88	NC_022081	ACC	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530612803
89	NC_022081	TTG	2	6	7346	7351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530612803
90	NC_022081	GTC	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612803
91	NC_022081	TCC	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530612803
92	NC_022081	CAT	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612803
93	NC_022081	CCG	2	6	7959	7964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530612803
94	NC_022081	CTG	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612803
95	NC_022081	TTG	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530612803
96	NC_022081	ATG	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612803
97	NC_022081	TCA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612803
98	NC_022081	TTC	2	6	8713	8718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612803
99	NC_022081	TAA	2	6	8721	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530612803
100	NC_022081	ATT	2	6	8794	8799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612803
101	NC_022081	TAT	2	6	8838	8843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612803
102	NC_022081	TGA	2	6	8859	8864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612803
103	NC_022081	CTT	2	6	8877	8882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612803
104	NC_022081	ATC	3	9	9019	9027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612803
105	NC_022081	GAA	2	6	9033	9038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612803
106	NC_022081	GAT	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612803
107	NC_022081	GAA	2	6	9154	9159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612803
108	NC_022081	CAA	2	6	9302	9307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612803
109	NC_022081	ATT	2	6	9328	9333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612803
110	NC_022081	GCG	2	6	9341	9346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612803
111	NC_022081	GAA	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612803
112	NC_022081	GAA	2	6	9478	9483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612803
113	NC_022081	GAA	2	6	9487	9492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612803
114	NC_022081	CGG	2	6	14729	14734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612804
115	NC_022081	ATC	2	6	14735	14740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612804
116	NC_022081	ATC	2	6	14746	14751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612804
117	NC_022081	CAG	2	6	14767	14772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612804
118	NC_022081	ACC	2	6	14778	14783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530612804
119	NC_022081	ATC	2	6	14804	14809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612804
120	NC_022081	AAT	2	6	14829	14834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530612804
121	NC_022081	ATG	2	6	15004	15009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612804
122	NC_022081	TTC	2	6	15170	15175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612804
123	NC_022081	TTC	2	6	15187	15192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612804
124	NC_022081	AGA	2	6	15362	15367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612804
125	NC_022081	ACA	2	6	15399	15404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612804
126	NC_022081	TTC	2	6	15514	15519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612804
127	NC_022081	AAG	2	6	15755	15760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612805
128	NC_022081	GAT	2	6	15772	15777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612805
129	NC_022081	TCA	2	6	15869	15874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612805
130	NC_022081	GGC	2	6	15931	15936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612805
131	NC_022081	CAG	2	6	15970	15975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612805
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133	NC_022081	CTT	2	6	16029	16034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612805
134	NC_022081	ATC	2	6	16046	16051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612805
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142	NC_022081	AGA	2	6	16879	16884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612805
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145	NC_022081	CGG	2	6	17040	17045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530612805
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154	NC_022081	ACA	2	6	18003	18008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530612806
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164	NC_022081	TCA	2	6	18941	18946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612807
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249	NC_022081	TGT	2	6	26827	26832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530612814
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376	NC_022081	TCA	2	6	40980	40985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530612826
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378	NC_022081	AGC	2	6	41110	41115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612827
379	NC_022081	AGC	2	6	41299	41304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612827
380	NC_022081	GAA	2	6	41356	41361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612827
381	NC_022081	GCA	2	6	41486	41491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612828
382	NC_022081	CTT	2	6	41598	41603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612828
383	NC_022081	GAC	2	6	41822	41827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612828
384	NC_022081	GCA	2	6	41832	41837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612828
385	NC_022081	CTG	2	6	41844	41849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530612828
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389	NC_022081	ATA	2	6	42043	42048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530612828
390	NC_022081	ATG	2	6	42076	42081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612828
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396	NC_022081	ATG	2	6	42609	42614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530612829
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400	NC_022081	AGG	2	6	42687	42692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530612829
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497	NC_022081	AGA	2	6	50303	50308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530612837
498	NC_022081	AGC	2	6	50374	50379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530612837
499	NC_022081	TCT	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530612837
500	NC_022081	ATT	2	6	50864	50869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530612838

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