MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5113

Total Repeats: 71958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022081	GTGCA	2	10	277660	277669	20 %	20 %	40 %	20 %	530613051
4502	NC_022081	CAG	2	6	277702	277707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613051
4503	NC_022081	A	6	6	277711	277716	100 %	0 %	0 %	0 %	530613051
4504	NC_022081	TGA	2	6	277761	277766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613051
4505	NC_022081	AT	3	6	277770	277775	50 %	50 %	0 %	0 %	530613051
4506	NC_022081	TGC	2	6	277779	277784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613051
4507	NC_022081	TAT	2	6	277789	277794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530613051
4508	NC_022081	TGTA	2	8	277807	277814	25 %	50 %	25 %	0 %	530613051
4509	NC_022081	GGC	2	6	277836	277841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613051
4510	NC_022081	GGA	2	6	277842	277847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530613051
4511	NC_022081	GGC	2	6	277857	277862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613051
4512	NC_022081	CA	3	6	277877	277882	50 %	0 %	0 %	50 %	530613051
4513	NC_022081	T	6	6	277907	277912	0 %	100 %	0 %	0 %	530613051
4514	NC_022081	GCC	3	9	277954	277962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613051
4515	NC_022081	GC	3	6	277967	277972	0 %	0 %	50 %	50 %	530613051
4516	NC_022081	GCG	2	6	277987	277992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613051
4517	NC_022081	TTTC	2	8	278148	278155	0 %	75 %	0 %	25 %	530613051
4518	NC_022081	T	6	6	278187	278192	0 %	100 %	0 %	0 %	530613051
4519	NC_022081	CAG	2	6	278193	278198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613051
4520	NC_022081	A	6	6	278213	278218	100 %	0 %	0 %	0 %	530613051
4521	NC_022081	AAC	2	6	278230	278235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530613051
4522	NC_022081	TTC	2	6	278401	278406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613052
4523	NC_022081	CCG	2	6	278484	278489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613052
4524	NC_022081	GAA	2	6	278495	278500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613052
4525	NC_022081	GCG	2	6	278501	278506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613052
4526	NC_022081	CAT	2	6	278509	278514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613052
4527	NC_022081	AGA	2	6	278563	278568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613052
4528	NC_022081	GCC	2	6	278591	278596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613052
4529	NC_022081	CAA	2	6	278629	278634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530613052
4530	NC_022081	GGA	2	6	278680	278685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530613052
4531	NC_022081	A	6	6	278768	278773	100 %	0 %	0 %	0 %	530613052
4532	NC_022081	TCA	2	6	278800	278805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613052
4533	NC_022081	ATG	2	6	278861	278866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613052
4534	NC_022081	A	7	7	278990	278996	100 %	0 %	0 %	0 %	530613052
4535	NC_022081	GAA	2	6	279023	279028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613052
4536	NC_022081	CGC	2	6	279031	279036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613052
4537	NC_022081	GCC	2	6	279038	279043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613052
4538	NC_022081	ATGG	2	8	279046	279053	25 %	25 %	50 %	0 %	530613052
4539	NC_022081	GAA	2	6	279059	279064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613052
4540	NC_022081	TCG	2	6	279093	279098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613052
4541	NC_022081	TGG	2	6	279234	279239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530613053
4542	NC_022081	CG	3	6	279323	279328	0 %	0 %	50 %	50 %	530613053
4543	NC_022081	TA	3	6	279336	279341	50 %	50 %	0 %	0 %	530613053
4544	NC_022081	ATC	2	6	279421	279426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613053
4545	NC_022081	GGA	2	6	279455	279460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530613053
4546	NC_022081	ATT	2	6	279592	279597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530613053
4547	NC_022081	GGC	2	6	279604	279609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613053
4548	NC_022081	CCGA	2	8	279630	279637	25 %	0 %	25 %	50 %	530613053
4549	NC_022081	GAA	2	6	279675	279680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613053
4550	NC_022081	GAT	2	6	279770	279775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613053
4551	NC_022081	TCT	2	6	279827	279832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613053
4552	NC_022081	A	7	7	279836	279842	100 %	0 %	0 %	0 %	530613053
4553	NC_022081	GCC	2	6	279851	279856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613053
4554	NC_022081	CGG	2	6	279876	279881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613053
4555	NC_022081	GTCG	2	8	279974	279981	0 %	25 %	50 %	25 %	530613053
4556	NC_022081	TTTTCA	2	12	280055	280066	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530613053
4557	NC_022081	GAA	2	6	280136	280141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613053
4558	NC_022081	GCC	2	6	280278	280283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613053
4559	NC_022081	GAA	2	6	280326	280331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613053
4560	NC_022081	GAA	2	6	280434	280439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613053
4561	NC_022081	GCA	2	6	280501	280506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613053
4562	NC_022081	GAT	2	6	280587	280592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613053
4563	NC_022081	A	6	6	280617	280622	100 %	0 %	0 %	0 %	530613053
4564	NC_022081	GCT	3	9	280673	280681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613053
4565	NC_022081	TGA	2	6	280685	280690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613053
4566	NC_022081	AGA	2	6	280760	280765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613053
4567	NC_022081	GCT	2	6	280811	280816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613053
4568	NC_022081	A	6	6	281093	281098	100 %	0 %	0 %	0 %	530613054
4569	NC_022081	TCATTG	2	12	281109	281120	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530613054
4570	NC_022081	GCG	2	6	281138	281143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613054
4571	NC_022081	TTC	2	6	281179	281184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613054
4572	NC_022081	CGT	2	6	281203	281208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613054
4573	NC_022081	GAC	2	6	281209	281214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613054
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4575	NC_022081	AT	3	6	281371	281376	50 %	50 %	0 %	0 %	530613054
4576	NC_022081	A	6	6	281400	281405	100 %	0 %	0 %	0 %	530613054
4577	NC_022081	GAAGAG	2	12	281474	281485	50 %	0 %	50 %	0 %	530613054
4578	NC_022081	CGG	2	6	281497	281502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613054
4579	NC_022081	CCACAG	2	12	281509	281520	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	530613054
4580	NC_022081	GAA	2	6	281605	281610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613054
4581	NC_022081	AT	3	6	281641	281646	50 %	50 %	0 %	0 %	530613054
4582	NC_022081	ACA	2	6	281681	281686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530613054
4583	NC_022081	TAAA	2	8	281688	281695	75 %	25 %	0 %	0 %	530613054
4584	NC_022081	GCG	2	6	281696	281701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613054
4585	NC_022081	A	6	6	281702	281707	100 %	0 %	0 %	0 %	530613054
4586	NC_022081	CA	3	6	281716	281721	50 %	0 %	0 %	50 %	530613054
4587	NC_022081	GAA	2	6	281792	281797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613054
4588	NC_022081	ATG	2	6	281847	281852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613054
4589	NC_022081	ATC	2	6	281858	281863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613054
4590	NC_022081	GAA	2	6	281870	281875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613054
4591	NC_022081	TTACA	2	10	282111	282120	40 %	40 %	0 %	20 %	530613055
4592	NC_022081	GCG	2	6	282183	282188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613055
4593	NC_022081	TCG	2	6	282192	282197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613055
4594	NC_022081	TGA	2	6	282234	282239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613055
4595	NC_022081	GGAA	2	8	282268	282275	50 %	0 %	50 %	0 %	530613055
4596	NC_022081	GCA	2	6	282334	282339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613055
4597	NC_022081	TTC	2	6	282343	282348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613055
4598	NC_022081	CAC	2	6	282443	282448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530613055
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4600	NC_022081	CGG	2	6	282517	282522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613055
4601	NC_022081	CTG	2	6	282572	282577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613055
4602	NC_022081	TGA	2	6	282583	282588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613055
4603	NC_022081	GTC	2	6	282671	282676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613055
4604	NC_022081	AC	3	6	282683	282688	50 %	0 %	0 %	50 %	530613055
4605	NC_022081	CAG	2	6	282704	282709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613055
4606	NC_022081	G	6	6	282738	282743	0 %	0 %	100 %	0 %	530613055
4607	NC_022081	CGA	2	6	282781	282786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613055
4608	NC_022081	T	7	7	282912	282918	0 %	100 %	0 %	0 %	530613056
4609	NC_022081	CGG	2	6	282935	282940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613056
4610	NC_022081	GTC	2	6	282952	282957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613056
4611	NC_022081	GCG	2	6	282987	282992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613056
4612	NC_022081	CGTAC	2	10	282995	283004	20 %	20 %	20 %	40 %	530613056
4613	NC_022081	TATC	2	8	283016	283023	25 %	50 %	0 %	25 %	530613056
4614	NC_022081	GGC	2	6	283035	283040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613056
4615	NC_022081	GGC	2	6	283081	283086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613056
4616	NC_022081	ATTT	2	8	283109	283116	25 %	75 %	0 %	0 %	530613056
4617	NC_022081	CAGC	2	8	283134	283141	25 %	0 %	25 %	50 %	530613056
4618	NC_022081	TAT	2	6	283152	283157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530613056
4619	NC_022081	CTG	2	6	283171	283176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613056
4620	NC_022081	CTG	2	6	283267	283272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613056
4621	NC_022081	ATT	2	6	283315	283320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530613056
4622	NC_022081	TGC	2	6	283334	283339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613056
4623	NC_022081	CTC	2	6	283351	283356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530613056
4624	NC_022081	ATT	3	9	283420	283428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530613056
4625	NC_022081	GT	3	6	283439	283444	0 %	50 %	50 %	0 %	530613056
4626	NC_022081	TTCTGC	2	12	283514	283525	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530613056
4627	NC_022081	A	6	6	283561	283566	100 %	0 %	0 %	0 %	530613056
4628	NC_022081	A	6	6	283578	283583	100 %	0 %	0 %	0 %	530613056
4629	NC_022081	CCG	2	6	283584	283589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613056
4630	NC_022081	T	8	8	283632	283639	0 %	100 %	0 %	0 %	530613057
4631	NC_022081	AT	3	6	283646	283651	50 %	50 %	0 %	0 %	530613057
4632	NC_022081	T	6	6	283674	283679	0 %	100 %	0 %	0 %	530613057
4633	NC_022081	CAT	2	6	283710	283715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613057
4634	NC_022081	TCT	2	6	283801	283806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613057
4635	NC_022081	TCC	2	6	283819	283824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530613057
4636	NC_022081	CTT	2	6	283847	283852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613057
4637	NC_022081	GAA	2	6	283892	283897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613057
4638	NC_022081	TTC	2	6	283923	283928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613057
4639	NC_022081	GCG	2	6	284092	284097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613057
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4641	NC_022081	GAT	2	6	284215	284220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613057
4642	NC_022081	TCG	2	6	284291	284296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613057
4643	NC_022081	GCC	2	6	284298	284303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613057
4644	NC_022081	GCA	3	9	284396	284404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613057
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4646	NC_022081	GGAT	2	8	284423	284430	25 %	25 %	50 %	0 %	530613057
4647	NC_022081	GCG	2	6	284440	284445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613057
4648	NC_022081	GGCG	2	8	284543	284550	0 %	0 %	75 %	25 %	530613057
4649	NC_022081	CGG	2	6	284563	284568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613057
4650	NC_022081	ATCA	2	8	284625	284632	50 %	25 %	0 %	25 %	530613057
4651	NC_022081	GATT	2	8	284938	284945	25 %	50 %	25 %	0 %	530613058
4652	NC_022081	CTG	2	6	284975	284980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613058
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4655	NC_022081	GACA	2	8	285097	285104	50 %	0 %	25 %	25 %	530613058
4656	NC_022081	GCG	2	6	285144	285149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613058
4657	NC_022081	GAT	2	6	285194	285199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613058
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4661	NC_022081	GAA	2	6	285347	285352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613058
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4663	NC_022081	CA	3	6	285524	285529	50 %	0 %	0 %	50 %	530613059
4664	NC_022081	ACAA	2	8	285619	285626	75 %	0 %	0 %	25 %	530613059
4665	NC_022081	ACG	2	6	285629	285634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613059
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4672	NC_022081	GAG	2	6	285943	285948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530613059
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4682	NC_022081	CTGA	2	8	286829	286836	25 %	25 %	25 %	25 %	530613061
4683	NC_022081	CTG	2	6	286871	286876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613061
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4691	NC_022081	TGGCT	2	10	287064	287073	0 %	40 %	40 %	20 %	530613061
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4695	NC_022081	CGG	2	6	287266	287271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613061
4696	NC_022081	ATG	2	6	287288	287293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613061
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4700	NC_022081	ATC	3	9	287438	287446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613061
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4702	NC_022081	CAA	2	6	287482	287487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530613061
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4730	NC_022081	CGC	3	9	289024	289032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613062
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4732	NC_022081	ATC	2	6	289064	289069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613062
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4735	NC_022081	GGA	2	6	289141	289146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530613062
4736	NC_022081	TAAA	2	8	289226	289233	75 %	25 %	0 %	0 %	530613062
4737	NC_022081	AAAATC	2	12	289242	289253	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530613063
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4743	NC_022081	ACA	2	6	289704	289709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530613063
4744	NC_022081	ACT	2	6	289713	289718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530613063
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4852	NC_022081	TCAAT	2	10	294981	294990	40 %	40 %	0 %	20 %	530613067
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4862	NC_022081	TTTCGG	2	12	295388	295399	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	530613068
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4864	NC_022081	GCCT	2	8	295488	295495	0 %	25 %	25 %	50 %	530613068
4865	NC_022081	ATGA	2	8	295539	295546	50 %	25 %	25 %	0 %	530613068
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4926	NC_022081	CATG	2	8	298700	298707	25 %	25 %	25 %	25 %	530613071
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4973	NC_022081	TGAA	2	8	302031	302038	50 %	25 %	25 %	0 %	530613073
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4983	NC_022081	A	6	6	302581	302586	100 %	0 %	0 %	0 %	530613073
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4986	NC_022081	ACC	2	6	302696	302701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530613073
4987	NC_022081	CTT	2	6	302734	302739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530613073
4988	NC_022081	TAA	2	6	302759	302764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530613073
4989	NC_022081	GAA	2	6	302766	302771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530613073
4990	NC_022081	GC	3	6	302847	302852	0 %	0 %	50 %	50 %	530613073
4991	NC_022081	CGG	2	6	302926	302931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530613073
4992	NC_022081	AAAT	2	8	302932	302939	75 %	25 %	0 %	0 %	530613073
4993	NC_022081	GC	3	6	302970	302975	0 %	0 %	50 %	50 %	530613073
4994	NC_022081	CCG	2	6	302978	302983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530613073
4995	NC_022081	AAT	2	6	303004	303009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530613073
4996	NC_022081	AAGAA	2	10	303056	303065	80 %	0 %	20 %	0 %	530613073
4997	NC_022081	ATG	2	6	303153	303158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530613073
4998	NC_022081	TAT	2	6	303231	303236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530613073
4999	NC_022081	GAC	2	6	303274	303279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530613073
5000	NC_022081	TCG	2	6	303285	303290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530613073

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