MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5033

Total Repeats: 47364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022075	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530567813
2	NC_022075	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567813
3	NC_022075	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
4	NC_022075	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
5	NC_022075	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
6	NC_022075	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
7	NC_022075	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530567814
8	NC_022075	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567814
9	NC_022075	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567814
10	NC_022075	ATA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567814
11	NC_022075	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567814
12	NC_022075	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
13	NC_022075	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567814
14	NC_022075	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567814
15	NC_022075	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567814
16	NC_022075	TCT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567814
17	NC_022075	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
18	NC_022075	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567814
19	NC_022075	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
20	NC_022075	GGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567814
21	NC_022075	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567814
22	NC_022075	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567814
23	NC_022075	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
24	NC_022075	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
25	NC_022075	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567814
26	NC_022075	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567815
27	NC_022075	AGA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567815
28	NC_022075	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567815
29	NC_022075	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567815
30	NC_022075	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567815
31	NC_022075	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567815
32	NC_022075	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567815
33	NC_022075	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567815
34	NC_022075	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567815
35	NC_022075	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567815
36	NC_022075	CAA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567815
37	NC_022075	CGG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567815
38	NC_022075	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567815
39	NC_022075	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567815
40	NC_022075	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567816
41	NC_022075	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567816
42	NC_022075	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567816
43	NC_022075	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567816
44	NC_022075	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567817
45	NC_022075	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
46	NC_022075	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
47	NC_022075	GAG	3	9	3828	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530567817
48	NC_022075	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
49	NC_022075	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567817
50	NC_022075	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567817
51	NC_022075	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
52	NC_022075	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
53	NC_022075	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
54	NC_022075	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567817
55	NC_022075	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
56	NC_022075	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
57	NC_022075	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530567817
58	NC_022075	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567818
59	NC_022075	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567818
60	NC_022075	GAA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567818
61	NC_022075	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567818
62	NC_022075	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567818
63	NC_022075	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567819
64	NC_022075	ATG	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567819
65	NC_022075	CAC	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530567819
66	NC_022075	TCG	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567819
67	NC_022075	ACA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567819
68	NC_022075	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567819
69	NC_022075	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567819
70	NC_022075	CGG	2	6	5176	5181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567819
71	NC_022075	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567819
72	NC_022075	AAC	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567819
73	NC_022075	AAG	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567819
74	NC_022075	AAT	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567819
75	NC_022075	AAG	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567819
76	NC_022075	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567819
77	NC_022075	ATT	2	6	5846	5851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567819
78	NC_022075	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
79	NC_022075	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
80	NC_022075	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567819
81	NC_022075	TTC	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
82	NC_022075	TCA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567819
83	NC_022075	TTA	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567819
84	NC_022075	TTC	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
85	NC_022075	ATC	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567819
86	NC_022075	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567819
87	NC_022075	GCA	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567819
88	NC_022075	AGC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567819
89	NC_022075	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567819
90	NC_022075	TCG	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567820
91	NC_022075	ACC	2	6	7235	7240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530567820
92	NC_022075	TTG	2	6	7310	7315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530567820
93	NC_022075	GTC	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567820
94	NC_022075	TCC	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530567820
95	NC_022075	CAT	2	6	7757	7762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567820
96	NC_022075	CTG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567820
97	NC_022075	TTG	2	6	8342	8347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530567820
98	NC_022075	GAA	2	6	8383	8388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
99	NC_022075	ATC	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567820
100	NC_022075	ATG	2	6	8441	8446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567820
101	NC_022075	TCA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567820
102	NC_022075	TTC	2	6	8677	8682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567820
103	NC_022075	TAA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567820
104	NC_022075	ATT	2	6	8758	8763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567820
105	NC_022075	ATT	2	6	8803	8808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567820
106	NC_022075	TGA	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567820
107	NC_022075	CTT	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567820
108	NC_022075	ATC	3	9	8983	8991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567820
109	NC_022075	GAA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
110	NC_022075	GAA	2	6	9025	9030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
111	NC_022075	GAT	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567820
112	NC_022075	GAA	2	6	9118	9123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
113	NC_022075	CAA	2	6	9266	9271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567820
114	NC_022075	ATT	2	6	9292	9297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567820
115	NC_022075	GCG	2	6	9305	9310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567820
116	NC_022075	GAA	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
117	NC_022075	GAA	2	6	9442	9447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
118	NC_022075	GAA	2	6	9451	9456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567820
119	NC_022075	CGG	2	6	14694	14699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567821
120	NC_022075	ATC	2	6	14700	14705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567821
121	NC_022075	ATC	2	6	14711	14716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567821
122	NC_022075	CAG	2	6	14732	14737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567821
123	NC_022075	ACC	2	6	14743	14748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530567821
124	NC_022075	ATC	2	6	14769	14774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567821
125	NC_022075	AAT	2	6	14801	14806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567821
126	NC_022075	ATG	2	6	14969	14974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567821
127	NC_022075	TTC	2	6	15135	15140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567821
128	NC_022075	TTC	2	6	15152	15157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567821
129	NC_022075	AGA	2	6	15327	15332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567821
130	NC_022075	ACA	2	6	15364	15369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567821
131	NC_022075	AAG	2	6	15720	15725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567822
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138	NC_022075	ATC	2	6	16011	16016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567822
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162	NC_022075	ATG	2	6	18542	18547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567823
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379	NC_022075	AGC	2	6	41264	41269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567844
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381	NC_022075	GCA	2	6	41451	41456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567845
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383	NC_022075	GCA	2	6	41797	41802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567845
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385	NC_022075	TTA	2	6	41855	41860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567845
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393	NC_022075	TAT	2	6	42459	42464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567846
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498	NC_022075	AAG	2	6	50243	50248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567854
499	NC_022075	AGA	2	6	50268	50273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567854
500	NC_022075	AGC	2	6	50339	50344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567854

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