MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 2

Total Repeats: 109253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021884	TCA	2	6	141746	141751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526470768
4002	NC_021884	GC	3	6	141761	141766	0 %	0 %	50 %	50 %	526470768
4003	NC_021884	TCGT	2	8	141772	141779	0 %	50 %	25 %	25 %	526470768
4004	NC_021884	CGCC	2	8	141821	141828	0 %	0 %	25 %	75 %	526470768
4005	NC_021884	TCG	2	6	141857	141862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470768
4006	NC_021884	CGT	2	6	141867	141872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470768
4007	NC_021884	AGC	2	6	141890	141895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470768
4008	NC_021884	CGC	3	9	141905	141913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470768
4009	NC_021884	GCATC	2	10	141949	141958	20 %	20 %	20 %	40 %	526473096
4010	NC_021884	GTC	2	6	141959	141964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4011	NC_021884	CGA	2	6	141979	141984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4012	NC_021884	GC	6	12	142000	142011	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4013	NC_021884	CGT	2	6	142015	142020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4014	NC_021884	CG	5	10	142045	142054	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4015	NC_021884	GC	3	6	142071	142076	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4016	NC_021884	GCT	2	6	142105	142110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4017	NC_021884	GC	3	6	142129	142134	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4018	NC_021884	CGA	2	6	142140	142145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4019	NC_021884	TCGG	2	8	142148	142155	0 %	25 %	50 %	25 %	526473096
4020	NC_021884	CGC	2	6	142187	142192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473096
4021	NC_021884	CCG	2	6	142236	142241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473096
4022	NC_021884	GC	3	6	142269	142274	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4023	NC_021884	CGT	2	6	142279	142284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4024	NC_021884	TCG	2	6	142377	142382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4025	NC_021884	CG	3	6	142408	142413	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4026	NC_021884	GC	3	6	142414	142419	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4027	NC_021884	GC	4	8	142491	142498	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4028	NC_021884	CGA	2	6	142510	142515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4029	NC_021884	GCT	2	6	142516	142521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4030	NC_021884	CGC	2	6	142560	142565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473096
4031	NC_021884	GC	4	8	142584	142591	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4032	NC_021884	CG	3	6	142635	142640	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4033	NC_021884	CGT	2	6	142645	142650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4034	NC_021884	CGA	2	6	142651	142656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4035	NC_021884	GGC	2	6	142657	142662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473096
4036	NC_021884	GC	3	6	142678	142683	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4037	NC_021884	GCG	2	6	142697	142702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473096
4038	NC_021884	CGC	2	6	142732	142737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473096
4039	NC_021884	CGT	2	6	142765	142770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4040	NC_021884	TCGGC	2	10	142785	142794	0 %	20 %	40 %	40 %	526473096
4041	NC_021884	CG	3	6	142797	142802	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4042	NC_021884	GC	3	6	142820	142825	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4043	NC_021884	CG	3	6	142867	142872	0 %	0 %	50 %	50 %	526473096
4044	NC_021884	TGC	2	6	142893	142898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473096
4045	NC_021884	CGA	2	6	143553	143558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472981
4046	NC_021884	AGGC	2	8	143577	143584	25 %	0 %	50 %	25 %	526472981
4047	NC_021884	GC	3	6	143702	143707	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4048	NC_021884	CCT	2	6	143731	143736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526472981
4049	NC_021884	TGC	2	6	143781	143786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472981
4050	NC_021884	GCG	2	6	143787	143792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472981
4051	NC_021884	GAT	2	6	143905	143910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526472981
4052	NC_021884	GCG	3	9	143955	143963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472981
4053	NC_021884	TCG	2	6	143979	143984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472981
4054	NC_021884	CG	3	6	144067	144072	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4055	NC_021884	TCG	2	6	144093	144098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472981
4056	NC_021884	CGG	2	6	144125	144130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472981
4057	NC_021884	CGCA	2	8	144149	144156	25 %	0 %	25 %	50 %	526472981
4058	NC_021884	GGC	2	6	144160	144165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472981
4059	NC_021884	CGGG	2	8	144169	144176	0 %	0 %	75 %	25 %	526472981
4060	NC_021884	CGA	2	6	144186	144191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472981
4061	NC_021884	GC	4	8	144226	144233	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4062	NC_021884	GC	3	6	144248	144253	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4063	NC_021884	CG	3	6	144325	144330	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4064	NC_021884	CG	3	6	144340	144345	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4065	NC_021884	GC	3	6	144367	144372	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4066	NC_021884	CGA	2	6	144388	144393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472981
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4069	NC_021884	CGG	2	6	144490	144495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472981
4070	NC_021884	GCT	2	6	144517	144522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472981
4071	NC_021884	GC	3	6	144541	144546	0 %	0 %	50 %	50 %	526472981
4072	NC_021884	TGAGT	2	10	144560	144569	20 %	40 %	40 %	0 %	526472981
4073	NC_021884	GGC	2	6	144643	144648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473312
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4075	NC_021884	TGC	2	6	144678	144683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473312
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4083	NC_021884	CG	3	6	144952	144957	0 %	0 %	50 %	50 %	526473312
4084	NC_021884	CGG	2	6	144982	144987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473312
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4087	NC_021884	GCCG	2	8	145087	145094	0 %	0 %	50 %	50 %	526473312
4088	NC_021884	CGA	2	6	145125	145130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473312
4089	NC_021884	GTCG	2	8	145141	145148	0 %	25 %	50 %	25 %	526473312
4090	NC_021884	TCG	2	6	145179	145184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473312
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4092	NC_021884	GAT	2	6	145252	145257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473312
4093	NC_021884	TGC	2	6	145260	145265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473312
4094	NC_021884	GATC	2	8	145273	145280	25 %	25 %	25 %	25 %	526473312
4095	NC_021884	CGG	3	9	145300	145308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473312
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4099	NC_021884	TGA	2	6	145371	145376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473312
4100	NC_021884	CG	4	8	145390	145397	0 %	0 %	50 %	50 %	526473312
4101	NC_021884	CGA	2	6	145418	145423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470276
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4103	NC_021884	CGA	2	6	145524	145529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470276
4104	NC_021884	GAC	2	6	145590	145595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470276
4105	NC_021884	GCG	2	6	145626	145631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470276
4106	NC_021884	GC	5	10	145656	145665	0 %	0 %	50 %	50 %	526470276
4107	NC_021884	TGC	2	6	145676	145681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470276
4108	NC_021884	GC	3	6	145680	145685	0 %	0 %	50 %	50 %	526470276
4109	NC_021884	GCTCG	2	10	145701	145710	0 %	20 %	40 %	40 %	526470276
4110	NC_021884	GAG	2	6	145714	145719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526470276
4111	NC_021884	CGG	2	6	145727	145732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470276
4112	NC_021884	CG	3	6	145745	145750	0 %	0 %	50 %	50 %	526470276
4113	NC_021884	GAC	2	6	145752	145757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470276
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4118	NC_021884	CGC	2	6	146291	146296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470379
4119	NC_021884	CCG	2	6	146297	146302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470379
4120	NC_021884	GC	3	6	146304	146309	0 %	0 %	50 %	50 %	526470379
4121	NC_021884	TTCGC	2	10	146330	146339	0 %	40 %	20 %	40 %	526470379
4122	NC_021884	ACG	2	6	146344	146349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470379
4123	NC_021884	GC	3	6	146384	146389	0 %	0 %	50 %	50 %	526470379
4124	NC_021884	GCC	2	6	146395	146400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470379
4125	NC_021884	CG	3	6	146429	146434	0 %	0 %	50 %	50 %	526470379
4126	NC_021884	ACC	2	6	146437	146442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526470379
4127	NC_021884	CGCC	2	8	146477	146484	0 %	0 %	25 %	75 %	526470379
4128	NC_021884	GCG	2	6	146530	146535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470379
4129	NC_021884	GAC	2	6	146562	146567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470379
4130	NC_021884	GCGCA	2	10	146568	146577	20 %	0 %	40 %	40 %	526470379
4131	NC_021884	CGC	3	9	146823	146831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
4132	NC_021884	GC	4	8	146830	146837	0 %	0 %	50 %	50 %	526473144
4133	NC_021884	CGC	3	9	146844	146852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
4134	NC_021884	CGC	3	9	146868	146876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
4135	NC_021884	GC	3	6	146885	146890	0 %	0 %	50 %	50 %	526473144
4136	NC_021884	GCCGC	2	10	146893	146902	0 %	0 %	40 %	60 %	526473144
4137	NC_021884	GC	3	6	146916	146921	0 %	0 %	50 %	50 %	526473144
4138	NC_021884	GTC	2	6	146952	146957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473144
4139	NC_021884	GGT	2	6	147003	147008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526473144
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4142	NC_021884	GCG	2	6	147046	147051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473144
4143	NC_021884	TCG	2	6	147119	147124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473144
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4147	NC_021884	ATCT	2	8	147190	147197	25 %	50 %	0 %	25 %	526473144
4148	NC_021884	CGACG	2	10	147240	147249	20 %	0 %	40 %	40 %	526473144
4149	NC_021884	TCG	2	6	147266	147271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473144
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4151	NC_021884	CGC	2	6	147363	147368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
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4154	NC_021884	GCT	2	6	147423	147428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473144
4155	NC_021884	CGC	2	6	147452	147457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
4156	NC_021884	CCG	2	6	147458	147463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
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4160	NC_021884	CCG	3	9	147617	147625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473144
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4164	NC_021884	GAT	2	6	147804	147809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473144
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4171	NC_021884	GC	3	6	148674	148679	0 %	0 %	50 %	50 %	526470591
4172	NC_021884	CGGC	2	8	148685	148692	0 %	0 %	50 %	50 %	526470591
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4195	NC_021884	TCG	2	6	150215	150220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472034
4196	NC_021884	GCT	2	6	150222	150227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472034
4197	NC_021884	CG	5	10	150237	150246	0 %	0 %	50 %	50 %	526472034
4198	NC_021884	CG	3	6	150261	150266	0 %	0 %	50 %	50 %	526472034
4199	NC_021884	CG	3	6	150279	150284	0 %	0 %	50 %	50 %	526472034
4200	NC_021884	CG	3	6	150297	150302	0 %	0 %	50 %	50 %	526472034
4201	NC_021884	CG	3	6	150306	150311	0 %	0 %	50 %	50 %	526472034
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4205	NC_021884	GC	3	6	150554	150559	0 %	0 %	50 %	50 %	526472034
4206	NC_021884	GAC	3	9	150576	150584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472034
4207	NC_021884	ATC	2	6	150589	150594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526472034
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4232	NC_021884	GAG	2	6	151495	151500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526470123
4233	NC_021884	GCG	2	6	151503	151508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470123
4234	NC_021884	GC	4	8	151521	151528	0 %	0 %	50 %	50 %	526470123
4235	NC_021884	CGC	2	6	151554	151559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470123
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4241	NC_021884	CG	3	6	151865	151870	0 %	0 %	50 %	50 %	526470955
4242	NC_021884	CTT	2	6	151893	151898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526470955
4243	NC_021884	GC	3	6	151982	151987	0 %	0 %	50 %	50 %	526470955
4244	NC_021884	CCT	2	6	151988	151993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526470955
4245	NC_021884	CTG	2	6	152010	152015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470955
4246	NC_021884	CGGC	2	8	152036	152043	0 %	0 %	50 %	50 %	526470955
4247	NC_021884	ACG	2	6	152054	152059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470955
4248	NC_021884	CG	3	6	152079	152084	0 %	0 %	50 %	50 %	526470955
4249	NC_021884	TTG	2	6	152120	152125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526470955
4250	NC_021884	TCG	2	6	152570	152575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526471207
4251	NC_021884	AGT	2	6	152634	152639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526471207
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4254	NC_021884	CG	3	6	152893	152898	0 %	0 %	50 %	50 %	526471207
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4283	NC_021884	GCAG	2	8	154372	154379	25 %	0 %	50 %	25 %	526470450
4284	NC_021884	CGT	2	6	154391	154396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470450
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4287	NC_021884	CGT	2	6	154430	154435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470450
4288	NC_021884	TGA	2	6	154581	154586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526470007
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4292	NC_021884	GAG	2	6	155056	155061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526470236
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4302	NC_021884	TGC	2	6	155423	155428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470236
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4305	NC_021884	TCG	2	6	155468	155473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470236
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4353	NC_021884	GAA	2	6	158632	158637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526473252
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4356	NC_021884	CTCG	2	8	158781	158788	0 %	25 %	25 %	50 %	526471008
4357	NC_021884	GGC	3	9	158791	158799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526471008
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4472	NC_021884	GCCC	2	8	162602	162609	0 %	0 %	25 %	75 %	526473162
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4484	NC_021884	GC	3	6	163058	163063	0 %	0 %	50 %	50 %	526473162
4485	NC_021884	CCGG	2	8	163073	163080	0 %	0 %	50 %	50 %	526473162
4486	NC_021884	CGCGC	2	10	163098	163107	0 %	0 %	40 %	60 %	526473162
4487	NC_021884	CGA	2	6	163109	163114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4488	NC_021884	CG	4	8	163130	163137	0 %	0 %	50 %	50 %	526473162
4489	NC_021884	GCA	2	6	163145	163150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4490	NC_021884	GCA	2	6	163163	163168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4491	NC_021884	GC	4	8	163311	163318	0 %	0 %	50 %	50 %	526473162
4492	NC_021884	AGC	2	6	163354	163359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4493	NC_021884	CGA	2	6	163376	163381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4494	NC_021884	GCACGC	2	12	163406	163417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526473162
4495	NC_021884	GTCG	2	8	163494	163501	0 %	25 %	50 %	25 %	526473162
4496	NC_021884	GC	5	10	163523	163532	0 %	0 %	50 %	50 %	526473162
4497	NC_021884	CGT	2	6	163538	163543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4498	NC_021884	GC	3	6	163578	163583	0 %	0 %	50 %	50 %	526473162
4499	NC_021884	GCA	2	6	163604	163609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473162
4500	NC_021884	GCTG	2	8	163643	163650	0 %	25 %	50 %	25 %	526473162

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