MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 2

Total Repeats: 109253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021884	TCGA	2	8	17542	17549	25 %	25 %	25 %	25 %	526472593
502	NC_021884	GCCAC	2	10	17613	17622	20 %	0 %	20 %	60 %	526472593
503	NC_021884	CGAGC	2	10	17625	17634	20 %	0 %	40 %	40 %	526472593
504	NC_021884	GCG	2	6	17641	17646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472593
505	NC_021884	GC	5	10	17669	17678	0 %	0 %	50 %	50 %	526472593
506	NC_021884	GAT	2	6	17730	17735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526472593
507	NC_021884	GCG	2	6	17747	17752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472593
508	NC_021884	CGA	2	6	17765	17770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472593
509	NC_021884	CGA	2	6	17807	17812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472593
510	NC_021884	TCG	2	6	17849	17854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472593
511	NC_021884	ACG	2	6	17861	17866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472593
512	NC_021884	CGT	2	6	17871	17876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472593
513	NC_021884	TCG	2	6	17884	17889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472593
514	NC_021884	CGCC	2	8	17962	17969	0 %	0 %	25 %	75 %	526472593
515	NC_021884	GCA	2	6	18035	18040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472593
516	NC_021884	TCG	2	6	18067	18072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472593
517	NC_021884	AGGAA	2	10	18094	18103	60 %	0 %	40 %	0 %	526472593
518	NC_021884	GC	3	6	18252	18257	0 %	0 %	50 %	50 %	526473196
519	NC_021884	GAT	2	6	18279	18284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473196
520	NC_021884	CGA	2	6	18293	18298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473196
521	NC_021884	GAC	2	6	18351	18356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473196
522	NC_021884	CGAG	2	8	18362	18369	25 %	0 %	50 %	25 %	526473196
523	NC_021884	CGAC	2	8	18383	18390	25 %	0 %	25 %	50 %	526473196
524	NC_021884	CGA	2	6	18410	18415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473196
525	NC_021884	ACC	2	6	18424	18429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526473196
526	NC_021884	AGC	2	6	18440	18445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473196
527	NC_021884	GCC	2	6	18450	18455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473196
528	NC_021884	GAT	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473196
529	NC_021884	GC	3	6	18532	18537	0 %	0 %	50 %	50 %	526473196
530	NC_021884	CAG	3	9	18549	18557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473196
531	NC_021884	GC	3	6	18560	18565	0 %	0 %	50 %	50 %	526473196
532	NC_021884	CGA	3	9	18655	18663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
533	NC_021884	CGA	2	6	18682	18687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
534	NC_021884	GGCC	2	8	18700	18707	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
535	NC_021884	AGCGCG	2	12	18741	18752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526472233
536	NC_021884	GC	3	6	18762	18767	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
537	NC_021884	GCT	2	6	18772	18777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472233
538	NC_021884	ATC	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526472233
539	NC_021884	GGC	2	6	18927	18932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
540	NC_021884	GAG	2	6	18965	18970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526472233
541	NC_021884	CGT	2	6	18997	19002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472233
542	NC_021884	GCC	2	6	19010	19015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472233
543	NC_021884	GAG	2	6	19025	19030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526472233
544	NC_021884	CAGC	2	8	19031	19038	25 %	0 %	25 %	50 %	526472233
545	NC_021884	GCC	3	9	19056	19064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472233
546	NC_021884	CG	3	6	19073	19078	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
547	NC_021884	CGG	2	6	19083	19088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
548	NC_021884	CGA	2	6	19102	19107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
549	NC_021884	CGC	2	6	19121	19126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472233
550	NC_021884	GCGT	3	12	19177	19188	0 %	25 %	50 %	25 %	526472233
551	NC_021884	CG	3	6	19197	19202	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
552	NC_021884	GCG	3	9	19221	19229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
553	NC_021884	GGC	2	6	19258	19263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
554	NC_021884	CG	3	6	19273	19278	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
555	NC_021884	ATC	2	6	19302	19307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526472233
556	NC_021884	AGCGCG	2	12	19308	19319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526472233
557	NC_021884	GCA	2	6	19330	19335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
558	NC_021884	GAA	2	6	19367	19372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526472233
559	NC_021884	GAGCAT	2	12	19400	19411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526472233
560	NC_021884	AGT	2	6	19516	19521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526472233
561	NC_021884	CTG	2	6	19568	19573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472233
562	NC_021884	GAA	3	9	19580	19588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526472233
563	NC_021884	GAA	2	6	19592	19597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526472233
564	NC_021884	GCACGA	2	12	19615	19626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
565	NC_021884	TCGCGA	2	12	19636	19647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526472233
566	NC_021884	AGA	2	6	19648	19653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526472233
567	NC_021884	CAG	2	6	19791	19796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
568	NC_021884	GC	3	6	19818	19823	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
569	NC_021884	AGC	3	9	19848	19856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
570	NC_021884	GC	3	6	19855	19860	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
571	NC_021884	CG	4	8	19967	19974	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
572	NC_021884	CG	4	8	19984	19991	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
573	NC_021884	GC	3	6	20045	20050	0 %	0 %	50 %	50 %	526472233
574	NC_021884	GCG	2	6	20107	20112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
575	NC_021884	GCG	2	6	20143	20148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
576	NC_021884	TCG	2	6	20202	20207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472233
577	NC_021884	GCG	2	6	20233	20238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472233
578	NC_021884	CGA	2	6	20263	20268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472233
579	NC_021884	AGG	2	6	20271	20276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526472233
580	NC_021884	GCGCG	2	10	20278	20287	0 %	0 %	60 %	40 %	526472233
581	NC_021884	GCGCG	2	10	20302	20311	0 %	0 %	60 %	40 %	526472233
582	NC_021884	TCG	2	6	20326	20331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472233
583	NC_021884	CGCT	2	8	20506	20513	0 %	25 %	25 %	50 %	526470655
584	NC_021884	CAG	2	6	20525	20530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470655
585	NC_021884	CGC	3	9	20531	20539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470655
586	NC_021884	TGT	2	6	20566	20571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526470655
587	NC_021884	GGC	2	6	20582	20587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470655
588	NC_021884	CGACGC	2	12	20605	20616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526470655
589	NC_021884	AGC	2	6	20706	20711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470655
590	NC_021884	ACG	2	6	20743	20748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470655
591	NC_021884	CGA	2	6	20761	20766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470655
592	NC_021884	GCA	2	6	20779	20784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470655
593	NC_021884	CTCGT	2	10	20793	20802	0 %	40 %	20 %	40 %	526470655
594	NC_021884	CCG	2	6	21221	21226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472163
595	NC_021884	GCT	2	6	21252	21257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
596	NC_021884	GCATC	2	10	21321	21330	20 %	20 %	20 %	40 %	526472163
597	NC_021884	ATC	2	6	21385	21390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526472163
598	NC_021884	TCC	2	6	21418	21423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526472163
599	NC_021884	CGC	2	6	21450	21455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472163
600	NC_021884	GC	3	6	21454	21459	0 %	0 %	50 %	50 %	526472163
601	NC_021884	GCA	2	6	21480	21485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
602	NC_021884	CGA	2	6	21510	21515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
603	NC_021884	ACG	2	6	21575	21580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
604	NC_021884	CGA	2	6	21582	21587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
605	NC_021884	TGC	3	9	21590	21598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
606	NC_021884	CGG	2	6	21623	21628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472163
607	NC_021884	GGC	2	6	21643	21648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472163
608	NC_021884	CGA	2	6	21669	21674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
609	NC_021884	CCCGAC	2	12	21691	21702	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	526472163
610	NC_021884	CGC	2	6	21709	21714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472163
611	NC_021884	TCG	2	6	21740	21745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
612	NC_021884	AAC	2	6	21757	21762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526472163
613	NC_021884	GC	3	6	21770	21775	0 %	0 %	50 %	50 %	526472163
614	NC_021884	TCG	2	6	21794	21799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
615	NC_021884	GATCGC	2	12	21804	21815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526472163
616	NC_021884	GC	3	6	21814	21819	0 %	0 %	50 %	50 %	526472163
617	NC_021884	TCA	2	6	21830	21835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526472163
618	NC_021884	CGA	2	6	21843	21848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
619	NC_021884	ACG	2	6	21869	21874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
620	NC_021884	TCGC	2	8	21898	21905	0 %	25 %	25 %	50 %	526472163
621	NC_021884	CG	3	6	21967	21972	0 %	0 %	50 %	50 %	526472163
622	NC_021884	GTCG	2	8	21981	21988	0 %	25 %	50 %	25 %	526472163
623	NC_021884	CCG	3	9	22008	22016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472163
624	NC_021884	CG	3	6	22015	22020	0 %	0 %	50 %	50 %	526472163
625	NC_021884	GTC	2	6	22050	22055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
626	NC_021884	CGG	2	6	22107	22112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472163
627	NC_021884	AGC	2	6	22160	22165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
628	NC_021884	CGTG	2	8	22208	22215	0 %	25 %	50 %	25 %	526472163
629	NC_021884	GCG	2	6	22225	22230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472163
630	NC_021884	CAG	2	6	22282	22287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
631	NC_021884	GCT	3	9	22299	22307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
632	NC_021884	TGC	2	6	22319	22324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472163
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634	NC_021884	CGA	2	6	22392	22397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472163
635	NC_021884	TCGA	2	8	22408	22415	25 %	25 %	25 %	25 %	526472163
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643	NC_021884	CGA	2	6	22700	22705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472189
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655	NC_021884	GGC	2	6	22904	22909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472189
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659	NC_021884	ACG	2	6	22998	23003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472189
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661	NC_021884	CGA	2	6	23134	23139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472189
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674	NC_021884	CCTGCG	2	12	23582	23593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526472189
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734	NC_021884	GCC	2	6	26340	26345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526471910
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744	NC_021884	TCGC	2	8	26607	26614	0 %	25 %	25 %	50 %	526471910
745	NC_021884	TTC	2	6	26643	26648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526471910
746	NC_021884	CGA	2	6	26654	26659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526471910
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748	NC_021884	CGGCT	2	10	26739	26748	0 %	20 %	40 %	40 %	526471910
749	NC_021884	CGACG	2	10	26786	26795	20 %	0 %	40 %	40 %	526471910
750	NC_021884	CG	4	8	26794	26801	0 %	0 %	50 %	50 %	526471910
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752	NC_021884	GC	3	6	26817	26822	0 %	0 %	50 %	50 %	526471910
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