MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 2

Total Repeats: 109253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021884	ACA	2	6	204408	204413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526473206
5503	NC_021884	TCG	2	6	204548	204553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5504	NC_021884	GCG	2	6	204554	204559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473206
5505	NC_021884	TCG	2	6	204587	204592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5506	NC_021884	CG	4	8	204644	204651	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5507	NC_021884	CTG	2	6	204676	204681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5508	NC_021884	GCG	2	6	204714	204719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473206
5509	NC_021884	TCG	3	9	204734	204742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5510	NC_021884	CG	3	6	204753	204758	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5511	NC_021884	TCG	2	6	204823	204828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5512	NC_021884	CGA	2	6	204852	204857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5513	NC_021884	CG	3	6	204858	204863	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5514	NC_021884	CG	3	6	204890	204895	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5515	NC_021884	GCG	2	6	204904	204909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473206
5516	NC_021884	CG	3	6	204948	204953	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5517	NC_021884	CAC	2	6	204991	204996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526473206
5518	NC_021884	CTG	2	6	205009	205014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5519	NC_021884	CGG	2	6	205040	205045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526473206
5520	NC_021884	TTC	2	6	205063	205068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526473206
5521	NC_021884	CGC	2	6	205094	205099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473206
5522	NC_021884	GTC	2	6	205101	205106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5523	NC_021884	CG	4	8	205131	205138	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5524	NC_021884	AGC	2	6	205154	205159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5526	NC_021884	GC	3	6	205189	205194	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5527	NC_021884	GGA	2	6	205263	205268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526473206
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5529	NC_021884	CGC	2	6	205316	205321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473206
5530	NC_021884	GCA	2	6	205329	205334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5532	NC_021884	CGATC	2	10	205389	205398	20 %	20 %	20 %	40 %	526473206
5533	NC_021884	CTG	2	6	205423	205428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5534	NC_021884	TGC	2	6	205466	205471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5536	NC_021884	GC	3	6	205490	205495	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5537	NC_021884	CGGCAT	2	12	205518	205529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5539	NC_021884	GC	3	6	205628	205633	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5540	NC_021884	TGA	2	6	205646	205651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473206
5541	NC_021884	CGGC	2	8	205858	205865	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5542	NC_021884	CGAT	2	8	205871	205878	25 %	25 %	25 %	25 %	526473206
5543	NC_021884	GCGCAC	2	12	205879	205890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526473206
5544	NC_021884	CGA	2	6	205908	205913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5550	NC_021884	CGA	2	6	206004	206009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5553	NC_021884	GCC	2	6	206109	206114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526473206
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5556	NC_021884	GAA	2	6	206220	206225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526473206
5557	NC_021884	GAG	2	6	206230	206235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526473206
5558	NC_021884	CGT	2	6	206268	206273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
5559	NC_021884	CGACAT	2	12	206280	206291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526473206
5560	NC_021884	GAT	2	6	206295	206300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526473206
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5563	NC_021884	GC	3	6	206404	206409	0 %	0 %	50 %	50 %	526473206
5564	NC_021884	GGT	2	6	206460	206465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526473206
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5570	NC_021884	TCG	2	6	206567	206572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473206
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5580	NC_021884	CGC	3	9	207308	207316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470632
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5589	NC_021884	TGC	2	6	207655	207660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470632
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5592	NC_021884	GC	3	6	207869	207874	0 %	0 %	50 %	50 %	526470632
5593	NC_021884	GCC	2	6	207932	207937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470632
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5595	NC_021884	TCGGC	2	10	208845	208854	0 %	20 %	40 %	40 %	526471249
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5599	NC_021884	AAGCG	2	10	208973	208982	40 %	0 %	40 %	20 %	526471249
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5601	NC_021884	CGC	2	6	209047	209052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526471249
5602	NC_021884	CG	4	8	209072	209079	0 %	0 %	50 %	50 %	526471249
5603	NC_021884	GCG	2	6	209097	209102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526471249
5604	NC_021884	T	7	7	209161	209167	0 %	100 %	0 %	0 %	526471249
5605	NC_021884	CGA	2	6	209333	209338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470446
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5607	NC_021884	CG	3	6	209376	209381	0 %	0 %	50 %	50 %	526470446
5608	NC_021884	CGA	2	6	209387	209392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470446
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5611	NC_021884	CGG	2	6	209429	209434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470446
5612	NC_021884	GCG	3	9	209560	209568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526470446
5613	NC_021884	GTC	2	6	209576	209581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470446
5614	NC_021884	GCG	2	6	209910	209915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472388
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5616	NC_021884	TTG	2	6	210044	210049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526472388
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5620	NC_021884	CGC	2	6	210336	210341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472388
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5622	NC_021884	CGG	2	6	210484	210489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472388
5623	NC_021884	GGC	2	6	210643	210648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472388
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5628	NC_021884	TCGA	2	8	210860	210867	25 %	25 %	25 %	25 %	526472388
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5652	NC_021884	CTG	2	6	213397	213402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526473391
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5732	NC_021884	GGC	3	9	217521	217529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472770
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5736	NC_021884	CGA	2	6	217646	217651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472770
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5739	NC_021884	ACTGA	2	10	217762	217771	40 %	20 %	20 %	20 %	526472770
5740	NC_021884	CAT	2	6	217871	217876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526472776
5741	NC_021884	ACG	2	6	217909	217914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472776
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5744	NC_021884	CGC	2	6	218063	218068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526472776
5745	NC_021884	GGCACG	2	12	218091	218102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526472776
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5747	NC_021884	TTCG	2	8	218207	218214	0 %	50 %	25 %	25 %	526472776
5748	NC_021884	CGATG	2	10	218240	218249	20 %	20 %	40 %	20 %	526472776
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5765	NC_021884	GTGC	2	8	219097	219104	0 %	25 %	50 %	25 %	526469966
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5851	NC_021884	GGCTC	2	10	223073	223082	0 %	20 %	40 %	40 %	526472764
5852	NC_021884	TCGC	2	8	223150	223157	0 %	25 %	25 %	50 %	526472764
5853	NC_021884	GCGAG	2	10	223164	223173	20 %	0 %	60 %	20 %	526472764
5854	NC_021884	CGT	3	9	223227	223235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526472764
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5864	NC_021884	CGG	2	6	223598	223603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526472764
5865	NC_021884	GAC	2	6	223626	223631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526472764
5866	NC_021884	GGCG	2	8	223644	223651	0 %	0 %	75 %	25 %	526472764
5867	NC_021884	GCGCC	2	10	223659	223668	0 %	0 %	40 %	60 %	526472764
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5870	NC_021884	ACG	2	6	223826	223831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526471485
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5873	NC_021884	CGT	3	9	224003	224011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526471485
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5889	NC_021884	TTCGA	2	10	224674	224683	20 %	40 %	20 %	20 %	526471485
5890	NC_021884	ATCG	2	8	224716	224723	25 %	25 %	25 %	25 %	526471485
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5980	NC_021884	GAGCC	2	10	230412	230421	20 %	0 %	40 %	40 %	526470796
5981	NC_021884	CGAT	2	8	230491	230498	25 %	25 %	25 %	25 %	526470796
5982	NC_021884	CGGTG	2	10	230636	230645	0 %	20 %	60 %	20 %	526470796
5983	NC_021884	CTT	2	6	230669	230674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526470796
5984	NC_021884	G	7	7	230675	230681	0 %	0 %	100 %	0 %	526470796
5985	NC_021884	CGC	2	6	230726	230731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526470796
5986	NC_021884	GC	3	6	230730	230735	0 %	0 %	50 %	50 %	526470796
5987	NC_021884	AC	3	6	230833	230838	50 %	0 %	0 %	50 %	526470796
5988	NC_021884	G	6	6	230855	230860	0 %	0 %	100 %	0 %	526470796
5989	NC_021884	TC	3	6	230930	230935	0 %	50 %	0 %	50 %	526470796
5990	NC_021884	ATCA	2	8	230937	230944	50 %	25 %	0 %	25 %	526470796
5991	NC_021884	CGA	2	6	230981	230986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470796
5992	NC_021884	AGCG	2	8	231006	231013	25 %	0 %	50 %	25 %	526470796
5993	NC_021884	CGCA	2	8	231014	231021	25 %	0 %	25 %	50 %	526470796
5994	NC_021884	CTG	2	6	231055	231060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470796
5995	NC_021884	GTC	2	6	231102	231107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526470796
5996	NC_021884	CAA	2	6	231110	231115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526470796
5997	NC_021884	CTGC	2	8	231140	231147	0 %	25 %	25 %	50 %	526470796
5998	NC_021884	GAC	2	6	231187	231192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526470796
5999	NC_021884	CG	3	6	231408	231413	0 %	0 %	50 %	50 %	526472428
6000	NC_021884	TGCCGC	2	12	231429	231440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526472428

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