MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p2 DNA

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021295	TCGA	2	8	193	200	25 %	25 %	25 %	25 %	507527062
2	NC_021295	GCGA	2	8	683	690	25 %	0 %	50 %	25 %	507527062
3	NC_021295	CCGA	2	8	1037	1044	25 %	0 %	25 %	50 %	507527062
4	NC_021295	ACGA	2	8	2295	2302	50 %	0 %	25 %	25 %	507527063
5	NC_021295	CGCT	2	8	2489	2496	0 %	25 %	25 %	50 %	507527063
6	NC_021295	GGCG	2	8	3532	3539	0 %	0 %	75 %	25 %	507527064
7	NC_021295	TCGT	2	8	6246	6253	0 %	50 %	25 %	25 %	507527065
8	NC_021295	GTTC	2	8	7012	7019	0 %	50 %	25 %	25 %	507527067
9	NC_021295	TCAA	2	8	7139	7146	50 %	25 %	0 %	25 %	507527067
10	NC_021295	ATCA	2	8	7258	7265	50 %	25 %	0 %	25 %	507527068
11	NC_021295	GCCG	2	8	7364	7371	0 %	0 %	50 %	50 %	507527069
12	NC_021295	GCGA	2	8	7854	7861	25 %	0 %	50 %	25 %	507527070
13	NC_021295	GTCT	2	8	7862	7869	0 %	50 %	25 %	25 %	507527070
14	NC_021295	GGCG	2	8	8682	8689	0 %	0 %	75 %	25 %	507527071
15	NC_021295	GCGG	2	8	9373	9380	0 %	0 %	75 %	25 %	507527071
16	NC_021295	GTCG	2	8	9618	9625	0 %	25 %	50 %	25 %	507527071
17	NC_021295	GCAG	2	8	9699	9706	25 %	0 %	50 %	25 %	507527071
18	NC_021295	CTTC	2	8	9985	9992	0 %	50 %	0 %	50 %	507527072
19	NC_021295	GGCC	2	8	10045	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	507527072
20	NC_021295	TCTT	2	8	10163	10170	0 %	75 %	0 %	25 %	507527072
21	NC_021295	CTGG	2	8	10470	10477	0 %	25 %	50 %	25 %	507527072
22	NC_021295	GGGC	2	8	10559	10566	0 %	0 %	75 %	25 %	507527072
23	NC_021295	CGTC	3	12	10772	10783	0 %	25 %	25 %	50 %	507527072
24	NC_021295	CTCG	2	8	11188	11195	0 %	25 %	25 %	50 %	507527073
25	NC_021295	CCGG	2	8	11358	11365	0 %	0 %	50 %	50 %	507527073
26	NC_021295	GAAG	2	8	11525	11532	50 %	0 %	50 %	0 %	507527073
27	NC_021295	CGTC	2	8	12402	12409	0 %	25 %	25 %	50 %	507527074
28	NC_021295	CGAT	2	8	12519	12526	25 %	25 %	25 %	25 %	507527074
29	NC_021295	GAAG	2	8	12822	12829	50 %	0 %	50 %	0 %	507527074
30	NC_021295	GGCG	2	8	13067	13074	0 %	0 %	75 %	25 %	507527075
31	NC_021295	CTGT	2	8	14178	14185	0 %	50 %	25 %	25 %	507527076
32	NC_021295	GGGC	2	8	14518	14525	0 %	0 %	75 %	25 %	507527077
33	NC_021295	GCTG	2	8	16351	16358	0 %	25 %	50 %	25 %	507527077
34	NC_021295	CGTG	2	8	16713	16720	0 %	25 %	50 %	25 %	507527078
35	NC_021295	GCGA	2	8	16862	16869	25 %	0 %	50 %	25 %	507527078
36	NC_021295	CACG	2	8	17215	17222	25 %	0 %	25 %	50 %	507527079
37	NC_021295	CACG	2	8	17473	17480	25 %	0 %	25 %	50 %	507527079
38	NC_021295	GCGG	2	8	18388	18395	0 %	0 %	75 %	25 %	507527079
39	NC_021295	CCAA	2	8	18582	18589	50 %	0 %	0 %	50 %	507527080
40	NC_021295	GAAC	2	8	19284	19291	50 %	0 %	25 %	25 %	507527080
41	NC_021295	GCGA	2	8	19538	19545	25 %	0 %	50 %	25 %	507527080
42	NC_021295	GATG	2	8	20060	20067	25 %	25 %	50 %	0 %	507527081
43	NC_021295	CTCG	2	8	21379	21386	0 %	25 %	25 %	50 %	507527083
44	NC_021295	CCGG	2	8	22225	22232	0 %	0 %	50 %	50 %	507527084
45	NC_021295	GCTG	2	8	23692	23699	0 %	25 %	50 %	25 %	507527085
46	NC_021295	TTCG	2	8	24435	24442	0 %	50 %	25 %	25 %	507527086
47	NC_021295	CGTC	2	8	24538	24545	0 %	25 %	25 %	50 %	507527086
48	NC_021295	ATGA	2	8	24730	24737	50 %	25 %	25 %	0 %	507527087
49	NC_021295	GGCT	2	8	26062	26069	0 %	25 %	50 %	25 %	507527090
50	NC_021295	TCGA	2	8	26145	26152	25 %	25 %	25 %	25 %	507527090
51	NC_021295	GTGG	2	8	26380	26387	0 %	25 %	75 %	0 %	507527090
52	NC_021295	TGCC	2	8	26464	26471	0 %	25 %	25 %	50 %	507527090
53	NC_021295	ATCG	2	8	26536	26543	25 %	25 %	25 %	25 %	507527090
54	NC_021295	TTTG	2	8	26854	26861	0 %	75 %	25 %	0 %	507527092
55	NC_021295	AAAG	2	8	26965	26972	75 %	0 %	25 %	0 %	507527092
56	NC_021295	GGAT	2	8	27106	27113	25 %	25 %	50 %	0 %	507527093
57	NC_021295	GCAG	2	8	28322	28329	25 %	0 %	50 %	25 %	507527096
58	NC_021295	GCGA	2	8	28589	28596	25 %	0 %	50 %	25 %	507527096
59	NC_021295	GTTC	2	8	29248	29255	0 %	50 %	25 %	25 %	507527097
60	NC_021295	AATG	2	8	29827	29834	50 %	25 %	25 %	0 %	507527098
61	NC_021295	TTCG	2	8	30805	30812	0 %	50 %	25 %	25 %	507527100
62	NC_021295	TTGC	2	8	30971	30978	0 %	50 %	25 %	25 %	507527100
63	NC_021295	GGCC	2	8	31036	31043	0 %	0 %	50 %	50 %	507527100
64	NC_021295	AAGC	2	8	31248	31255	50 %	0 %	25 %	25 %	507527100
65	NC_021295	GACG	2	8	31653	31660	25 %	0 %	50 %	25 %	507527101
66	NC_021295	TGCT	2	8	31897	31904	0 %	50 %	25 %	25 %	507527101
67	NC_021295	TCGC	2	8	32220	32227	0 %	25 %	25 %	50 %	507527101
68	NC_021295	CGGA	2	8	32305	32312	25 %	0 %	50 %	25 %	507527101
69	NC_021295	CGAG	2	8	32314	32321	25 %	0 %	50 %	25 %	507527101
70	NC_021295	ACGA	2	8	32665	32672	50 %	0 %	25 %	25 %	507527101
71	NC_021295	GCTG	2	8	32681	32688	0 %	25 %	50 %	25 %	507527101
72	NC_021295	GTCG	2	8	32847	32854	0 %	25 %	50 %	25 %	507527102
73	NC_021295	GCCG	2	8	32858	32865	0 %	0 %	50 %	50 %	507527102
74	NC_021295	CGAA	2	8	32918	32925	50 %	0 %	25 %	25 %	507527102
75	NC_021295	GCTC	2	8	33223	33230	0 %	25 %	25 %	50 %	507527103
76	NC_021295	CTGG	2	8	33696	33703	0 %	25 %	50 %	25 %	507527103
77	NC_021295	ATGC	2	8	33719	33726	25 %	25 %	25 %	25 %	507527103
78	NC_021295	GGGT	2	8	33916	33923	0 %	25 %	75 %	0 %	507527103
79	NC_021295	ATCA	2	8	34284	34291	50 %	25 %	0 %	25 %	507527103
80	NC_021295	CGCA	2	8	34925	34932	25 %	0 %	25 %	50 %	507527105
81	NC_021295	CTGG	2	8	35396	35403	0 %	25 %	50 %	25 %	507527105
82	NC_021295	CTTC	2	8	35422	35429	0 %	50 %	0 %	50 %	507527105
83	NC_021295	CGAT	2	8	35744	35751	25 %	25 %	25 %	25 %	507527105
84	NC_021295	CGAG	2	8	35834	35841	25 %	0 %	50 %	25 %	507527105
85	NC_021295	AGCG	2	8	36206	36213	25 %	0 %	50 %	25 %	507527105
86	NC_021295	GGCA	2	8	36364	36371	25 %	0 %	50 %	25 %	507527105
87	NC_021295	GAAT	2	8	36399	36406	50 %	25 %	25 %	0 %	507527105
88	NC_021295	CTTC	2	8	36610	36617	0 %	50 %	0 %	50 %	507527105
89	NC_021295	CATC	2	8	37479	37486	25 %	25 %	0 %	50 %	507527107
90	NC_021295	AGCG	2	8	37711	37718	25 %	0 %	50 %	25 %	507527108
91	NC_021295	GCGG	2	8	37737	37744	0 %	0 %	75 %	25 %	507527108
92	NC_021295	ATCT	2	8	37834	37841	25 %	50 %	0 %	25 %	507527108
93	NC_021295	GATC	2	8	38409	38416	25 %	25 %	25 %	25 %	507527108
94	NC_021295	TCGA	2	8	38660	38667	25 %	25 %	25 %	25 %	507527108
95	NC_021295	TCGG	2	8	40309	40316	0 %	25 %	50 %	25 %	507527110
96	NC_021295	AAGG	2	8	40379	40386	50 %	0 %	50 %	0 %	507527110
97	NC_021295	CGCC	2	8	40956	40963	0 %	0 %	25 %	75 %	507527110
98	NC_021295	GATG	2	8	40980	40987	25 %	25 %	50 %	0 %	507527110
99	NC_021295	GAGC	2	8	41124	41131	25 %	0 %	50 %	25 %	507527110
100	NC_021295	TCAG	2	8	41418	41425	25 %	25 %	25 %	25 %	507527110
101	NC_021295	CGGA	2	8	41475	41482	25 %	0 %	50 %	25 %	507527110
102	NC_021295	GCGG	2	8	41797	41804	0 %	0 %	75 %	25 %	507527110
103	NC_021295	CGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	25 %	25 %	507527110
104	NC_021295	AAGG	2	8	42089	42096	50 %	0 %	50 %	0 %	507527110
105	NC_021295	CGAA	2	8	42261	42268	50 %	0 %	25 %	25 %	507527110
106	NC_021295	CGAC	2	8	42964	42971	25 %	0 %	25 %	50 %	507527112
107	NC_021295	GTTC	2	8	43082	43089	0 %	50 %	25 %	25 %	507527112
108	NC_021295	CCGG	2	8	43188	43195	0 %	0 %	50 %	50 %	507527112
109	NC_021295	AGGC	2	8	43256	43263	25 %	0 %	50 %	25 %	507527112
110	NC_021295	TCGC	2	8	43843	43850	0 %	25 %	25 %	50 %	507527113
111	NC_021295	GGCT	2	8	43897	43904	0 %	25 %	50 %	25 %	507527113
112	NC_021295	GGCA	2	8	44080	44087	25 %	0 %	50 %	25 %	507527113
113	NC_021295	ATTG	2	8	44893	44900	25 %	50 %	25 %	0 %	507527114
114	NC_021295	CGGT	2	8	44972	44979	0 %	25 %	50 %	25 %	507527114
115	NC_021295	CGCC	2	8	45708	45715	0 %	0 %	25 %	75 %	507527115
116	NC_021295	GCTG	2	8	45736	45743	0 %	25 %	50 %	25 %	507527115
117	NC_021295	GCAT	2	8	45960	45967	25 %	25 %	25 %	25 %	507527115
118	NC_021295	GATC	2	8	46889	46896	25 %	25 %	25 %	25 %	507527117
119	NC_021295	GCCC	2	8	46994	47001	0 %	0 %	25 %	75 %	507527117
120	NC_021295	TGGC	2	8	47150	47157	0 %	25 %	50 %	25 %	507527117
121	NC_021295	CGGA	2	8	47724	47731	25 %	0 %	50 %	25 %	507527118
122	NC_021295	GGAA	2	8	47744	47751	50 %	0 %	50 %	0 %	507527118
123	NC_021295	TTGC	2	8	48263	48270	0 %	50 %	25 %	25 %	507527118
124	NC_021295	GCAT	2	8	48324	48331	25 %	25 %	25 %	25 %	507527119
125	NC_021295	TGGT	2	8	49910	49917	0 %	50 %	50 %	0 %	507527122
126	NC_021295	GCTG	2	8	50497	50504	0 %	25 %	50 %	25 %	507527122
127	NC_021295	ACCG	2	8	50509	50516	25 %	0 %	25 %	50 %	507527122
128	NC_021295	AATG	2	8	51150	51157	50 %	25 %	25 %	0 %	507527123
129	NC_021295	GAGT	2	8	51875	51882	25 %	25 %	50 %	0 %	507527123
130	NC_021295	CGAT	2	8	51904	51911	25 %	25 %	25 %	25 %	507527123
131	NC_021295	GAAG	2	8	52201	52208	50 %	0 %	50 %	0 %	507527123
132	NC_021295	GTTC	2	8	52339	52346	0 %	50 %	25 %	25 %	507527123
133	NC_021295	TACC	2	8	52907	52914	25 %	25 %	0 %	50 %	507527123
134	NC_021295	CGAT	2	8	53105	53112	25 %	25 %	25 %	25 %	507527123
135	NC_021295	TTGA	2	8	53454	53461	25 %	50 %	25 %	0 %	507527123
136	NC_021295	GATC	2	8	53549	53556	25 %	25 %	25 %	25 %	507527123
137	NC_021295	AGTG	2	8	54107	54114	25 %	25 %	50 %	0 %	507527123
138	NC_021295	TCGA	2	8	54493	54500	25 %	25 %	25 %	25 %	507527124
139	NC_021295	GATC	2	8	55018	55025	25 %	25 %	25 %	25 %	507527124
140	NC_021295	TCAT	2	8	55383	55390	25 %	50 %	0 %	25 %	507527124
141	NC_021295	TCGA	2	8	55532	55539	25 %	25 %	25 %	25 %	507527125
142	NC_021295	GTCG	2	8	56123	56130	0 %	25 %	50 %	25 %	507527126
143	NC_021295	ACTC	2	8	57139	57146	25 %	25 %	0 %	50 %	507527128
144	NC_021295	CATT	2	8	57377	57384	25 %	50 %	0 %	25 %	507527128
145	NC_021295	CGCC	2	8	57896	57903	0 %	0 %	25 %	75 %	507527129
146	NC_021295	TGCC	2	8	58010	58017	0 %	25 %	25 %	50 %	507527129
147	NC_021295	GGCC	2	8	58496	58503	0 %	0 %	50 %	50 %	507527129
148	NC_021295	GGAA	2	8	59448	59455	50 %	0 %	50 %	0 %	507527130
149	NC_021295	TTGA	2	8	59551	59558	25 %	50 %	25 %	0 %	507527130
150	NC_021295	GGCA	2	8	59933	59940	25 %	0 %	50 %	25 %	507527130
151	NC_021295	TCGG	2	8	60345	60352	0 %	25 %	50 %	25 %	507527130
152	NC_021295	AGCG	2	8	61223	61230	25 %	0 %	50 %	25 %	507527131
153	NC_021295	AGAT	2	8	62765	62772	50 %	25 %	25 %	0 %	507527133
154	NC_021295	GAAG	2	8	62865	62872	50 %	0 %	50 %	0 %	507527133
155	NC_021295	CGGA	2	8	63700	63707	25 %	0 %	50 %	25 %	507527134
156	NC_021295	CGAC	2	8	64770	64777	25 %	0 %	25 %	50 %	507527135
157	NC_021295	TATC	2	8	66152	66159	25 %	50 %	0 %	25 %	507527136
158	NC_021295	ACGG	2	8	66611	66618	25 %	0 %	50 %	25 %	507527136
159	NC_021295	ATTG	2	8	66655	66662	25 %	50 %	25 %	0 %	507527136
160	NC_021295	TCCG	2	8	67638	67645	0 %	25 %	25 %	50 %	507527139
161	NC_021295	GATC	2	8	68455	68462	25 %	25 %	25 %	25 %	507527140
162	NC_021295	GCTC	2	8	68898	68905	0 %	25 %	25 %	50 %	507527141
163	NC_021295	GCCT	2	8	69485	69492	0 %	25 %	25 %	50 %	507527141
164	NC_021295	GCTC	2	8	70321	70328	0 %	25 %	25 %	50 %	507527142
165	NC_021295	CCGA	2	8	70371	70378	25 %	0 %	25 %	50 %	507527142
166	NC_021295	GGTG	2	8	70400	70407	0 %	25 %	75 %	0 %	507527142
167	NC_021295	GGAG	2	8	70935	70942	25 %	0 %	75 %	0 %	507527142
168	NC_021295	GAGT	2	8	71786	71793	25 %	25 %	50 %	0 %	507527143
169	NC_021295	CGAT	2	8	72848	72855	25 %	25 %	25 %	25 %	507527146
170	NC_021295	CGGT	2	8	72974	72981	0 %	25 %	50 %	25 %	507527146
171	NC_021295	CGGC	2	8	74856	74863	0 %	0 %	50 %	50 %	507527148
172	NC_021295	TCGG	2	8	75195	75202	0 %	25 %	50 %	25 %	507527148
173	NC_021295	ACGC	2	8	75345	75352	25 %	0 %	25 %	50 %	507527148
174	NC_021295	TGAA	2	8	75424	75431	50 %	25 %	25 %	0 %	507527148
175	NC_021295	ATCG	2	8	75824	75831	25 %	25 %	25 %	25 %	507527148
176	NC_021295	TCGC	2	8	76829	76836	0 %	25 %	25 %	50 %	507527149
177	NC_021295	CTGC	2	8	77636	77643	0 %	25 %	25 %	50 %	507527150
178	NC_021295	TCCG	2	8	78546	78553	0 %	25 %	25 %	50 %	507527151
179	NC_021295	CCTT	2	8	79166	79173	0 %	50 %	0 %	50 %	507527152
180	NC_021295	CGAC	2	8	79208	79215	25 %	0 %	25 %	50 %	507527152
181	NC_021295	GATG	2	8	79401	79408	25 %	25 %	50 %	0 %	507527152
182	NC_021295	CGAC	2	8	79912	79919	25 %	0 %	25 %	50 %	507527153
183	NC_021295	GGCC	2	8	80330	80337	0 %	0 %	50 %	50 %	507527153
184	NC_021295	TCCC	2	8	80792	80799	0 %	25 %	0 %	75 %	507527153
185	NC_021295	CCAC	2	8	81675	81682	25 %	0 %	0 %	75 %	507527155
186	NC_021295	ACGT	2	8	82984	82991	25 %	25 %	25 %	25 %	507527155
187	NC_021295	GCGG	2	8	83501	83508	0 %	0 %	75 %	25 %	507527155
188	NC_021295	GGGC	2	8	83619	83626	0 %	0 %	75 %	25 %	507527155
189	NC_021295	CTGG	2	8	84341	84348	0 %	25 %	50 %	25 %	507527155
190	NC_021295	CAGG	2	8	84524	84531	25 %	0 %	50 %	25 %	507527155
191	NC_021295	TCGA	2	8	85416	85423	25 %	25 %	25 %	25 %	507527155
192	NC_021295	GAGC	2	8	85521	85528	25 %	0 %	50 %	25 %	507527155
193	NC_021295	ATCA	2	8	85617	85624	50 %	25 %	0 %	25 %	507527155
194	NC_021295	CGTG	2	8	85703	85710	0 %	25 %	50 %	25 %	507527155
195	NC_021295	TCGC	2	8	85728	85735	0 %	25 %	25 %	50 %	507527155
196	NC_021295	GACC	2	8	86285	86292	25 %	0 %	25 %	50 %	507527155
197	NC_021295	ATCG	2	8	86532	86539	25 %	25 %	25 %	25 %	507527155
198	NC_021295	GTAC	2	8	86775	86782	25 %	25 %	25 %	25 %	507527155
199	NC_021295	TCGA	2	8	86936	86943	25 %	25 %	25 %	25 %	507527155
200	NC_021295	TCAA	2	8	87005	87012	50 %	25 %	0 %	25 %	507527155

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.